這些法律、條律，律文、例則使得各類邪教分子淪為法律意義上的賤民。帝國的司法官員、行政官員在處理邪教問問題態度大都根源於此，而一般民眾對待內外邪教的態度也深受其影響。
1638年，渭河平原一帶集體農莊和集體農場，獲得大豐收。地方政府的文化部門，送戲下鄉。當地的邪教分子，以宗教關係，拒不接受。他們不看也就罷了，還禁止其他鄉鄰觀看，遂起械鬥。地方政府的文化部門決定禁演，但地方紳士、普通民眾起而反對，以為演戲自古皆然，豈能以"邪教分子"關係，便行禁止?
類似的衝突，在陝甘寧的鄉村，發生很多。鄉村中公權與教權發生矛盾是導致衝突發生的根本原因。
帝國生產建設兵團，集體農莊和集體農場，實行的是大農業，擁有一流的灌溉設施，化肥\農藥\農業機械，應有盡有，加上兵團戰士以及民工們，不但吃苦耐勞，而且懂得精耕細作，所以集體土地，都是豐收的高產田。所以，外來邪教分子，心中充滿了羨慕嫉妒恨。
各種矛盾，開始糾集在一起。最終，來了一個大爆發。陝甘寧一帶的軍隊，被抽調到西域去剿滅叛軍，各地的城防非常空虛。
甘肅平涼，邪教叛軍，攻陷平陽城，官員死節者百餘，士民死者十數萬。
華亭，隆德，平遠，海城，固原五個地區，人口損失兩百多萬，占叛亂之前人口的八成、
平涼華亭縣。“邪教叛軍入境，焚殺極慘。初叛之時，尚愛鄉土，不甚殘毒。後來，無所顧惜，焚殺慘於十倍。華亭從此丘墟。鄉鎮民屋焚殺殆盡，遺民數百悉逃蓮花台。剿滅叛軍之後，招安遺民，歸城者僅七十餘人，男女老幼死亡數萬。”
在平涼隆德縣，破城之後，從此官逃莊浪，城空無主者五年．人民殺斃餓死十有八九，老弱逃盡，全縣無二三十人家。全縣村村焦土，十室九空．人口死亡比例高達90%。
在慶陽縣，四鄉堡寨攻陷無遺，而縣城獨全，蓋四鄉之人逃出虎口者，生後入城避難。是月初九日，邪教叛軍入城，全城糜爛，死者不知其數。叛亂之前，全縣人口26.9萬，戰爭損失23。4萬，損失比例為87%。
帝國政府首先是對邪教叛軍強製遷徙。
賀人龍把2萬多陝西老弱邪教叛軍，強行安置在亞馬遜熱帶雨林、新幾內亞島、熱帶非洲，稍後又把一萬三千多甘肅邪教叛軍押解到東西伯利亞的荒涼之地。
遷徙的叛亂分子，或因饑餓困累於途中，或因疾病死於旁。如遷徙到西伯利亞等偏遠山區途中，時值隆冬，天寒地凍，叛亂者步履艱難、凍餓交加，途中1500餘名老弱凍餓而死，從而上了天堂。
左良玉分兩次將四萬多邪教叛軍，從關中一帶遷移到蘇門答臘島等偏遠地區;肅州破城之後，城內叛軍被悉數遷走。所有被強製遷離家園的叛軍群眾，家資田產全部充公，八百餘邪教寺廟俱焚於火。
大遷移布局大調整，隻是暫時。
為了徹底地根除民族情緒和宗教情緒，帝國政府還調集非洲軍團對邪教分子進行零存在的定點清楚。
其次，在善後過程中，還牽涉到在邪教叛亂中流離失所的漢族群眾的安置問題。為了徹底地把邪教分子變為賤民，帝國參謀長采取了不同的標準。
“漢民可以在近城、近路等生活方便之地安家，叛亂分子則近城驛非所宜，近漢莊非所宜，並聚一處非所宜，必須要分散安置，以達到渙其群、孤其勢、散其黨、收其權的久遠之圖。但凡回民居住地基本上都是自然條件較差的荒僻、偏遠地區，這些地方多半屬於甘肅中部幹旱地區，甚至是幹旱地區中條件最惡劣的半山半川區，氣候幹燥，土地貧瘠，水源匱乏。已經一貧如洗的邪教叛軍來到這裏，隻能在山坡上挖窯洞棲身。
李岩的"善後"措施，目的是讓邪教叛軍在經濟、文化上永遠得不到發展，即使是他們傳統的手工業和傳統的在絲綢之路上的經商特點，也要扼殺掉，長期處於貧窮落後的境地。