以基礎能源、原材料為主的工業結構，也受到水資源、環境承載能力的嚴峻製約。鄂爾多斯是水資源缺乏的地區。能源、原材料開發必然要消耗大量的水資源，是不以人的意誌為轉移的。“十五”以來，鄂爾多斯市大力關停並轉小企業，發展循環經濟，取得了顯著的成績。但是，仍然有企業以浪費、破壞、汙染水資源、汙染環境為代價為企業謀取利益，這是不能允許的。即使是加強水資源的保護和合理利用，加強環境的保護，鄂爾多斯的水資源與環境承載力，也不可能承受基礎能源、原材料產業今後數倍甚至十幾倍的增長壓力。
二、提高層次，推進工業結構優化升級，拓展鄂爾多斯市工業發展的空間，增強發展後勁
（一）發展能源、礦產資源深加工，延伸產業鏈，提高附加值
能源、礦產資源富集地區的工業化，一般都是從能源、礦產資源開采起步的。以資源優勢為依托，從資源開發起步，完成資本、技術的積累，是今後發展的必要基礎。但是，如果僅僅停留在開采——運出——銷售的層次，僅僅是依賴賣資源，產業鏈不延伸，加工——增值實現不了，走的是一條產業低層次——低效益的傳統道路，往往導致資源過度甚至是破壞性開采，環境汙染甚至破壞嚴重，經濟發展難以持續，甚至會因資源耗竭而陷入“資源枯竭型陷阱”。
“十五”以來，鄂爾多斯市在擴大能源、礦產資源開發規模的同時，注重開拓發展深加工，取得了曆史性的突破。煤炭開采、天然氣開采是第一步；煤炭發電、天然氣發電是第二步；以煤製油，煤製甲醇、二甲醚、烯烴，煤製天然氣，煤製化肥，煤焦化工為主，發展煤化工，以天然氣製甲醇、二甲醚、烯烴，天然氣製化肥等天然氣化工為主的二大主導係列，發展重化工業為第三步；以粉煤炭綜合利用，發展氧化鋁及水泥等建材工業為第四步；初步形成了以能源、礦產資源開發為依托的產業體係，為今後的發展有效拓展了產業空間。
目前，鄂爾多斯市已布局了煤化工產能達到1000萬噸級的準格爾旗大路工業園區、伊金霍洛旗上灣煤製油工業園區、鄂托克前旗上海廟工業園區，煤化工、天然氣化工產能達到1000萬噸級的烏審旗烏審召工業園區、鄂托克旗蒙西工業園區，煤化工產能達到2500萬噸的杭錦旗能源化工循環經濟工業園區，煤化工——天然氣化工的產能可達到7500萬噸的規模。目前，伊泰集團年產360萬噸、神華集團年產216萬噸煤製油項目正在進行前期工作，爭取開工建設。彙能集團年產20億立方米煤製天然氣項目、神華集團煤製氣項目、中煤集團350噸大化肥項目、中天合創年產300萬噸二甲醚項目、蒙大公司年產50萬噸烯烴項目、中電投年產100萬噸烯烴項目、上海廟年產100萬噸乙二酸項目等，都在全力推進。根據規劃，鄂爾多斯市2015年要實現煤製油年產500萬噸，煤製氣100億立方米，PVC300萬噸，氧化鋁200萬噸的生產能力。
（二）實現能源就地轉化，支持高耗能工業發展
“十一五”期間，自治區黨委、政府提出：要將新增煤炭、電力生產能力的50％以上就地轉化，用於自治區工業（特別是高耗能工業）、經濟發展和城鄉建設。這一決策是非常正確、非常及時的。
目前，鄂爾多斯已成為國內煤炭生產、外運的第一大市。但是，煤炭外運量的迅速增加使鐵路運力難以適應，公路運輸更是難以負荷，形成2009年以來京藏高速公路內蒙古——北京段曾經運煤車堵塞100多公裏、連續5天的奇觀。國際經驗證明，公路運輸煤炭超過300公裏、鐵路運輸超過500公裏就是不經濟的；火力發電的輸送距離超過1500公裏，也是不經濟的。然而，由於我國經濟布局不合理，宏觀調控乏力，煤炭的公路、鐵路運輸距離均超過1000公裏。江浙地區的煤炭售價可達到1500元/噸以上，運輸成本大大超過生產成本。石油資源十分缺乏的中國卻以短缺的高級能源——石油換取低級能源——煤炭，造成嚴重的社會不經濟。同時，由於管理體製的利益分割，電力“上網難”，發電企業利潤低，賣電企業賺大錢的格局難以改變。在東部地區缺電嚴重、鬧“電荒”的同時，在內蒙古東部、西部地區卻出現了“賣電難”的問題，東部沿海地區1度電賣0.80元，乃至1.00元，而內蒙古的電賣0.20元1度還上不去網。