在地域分布上，我國的戰略性新興產業在地域分布上有著因地製宜和依托資源的總體特征，但總體上來說在東部沿海、沿江地區發展較快較為密集。例如環渤海區域就以北京和天津為核心，其具有區位、資源、經濟等方麵的優勢，形成了我國高新技術研發、設計與製造為一體的新興產業聚集地。北京聚集著大量的人才、科研與教育資源，這也使得其成為環渤海地區技術轉化開發的中心，例如在節能環保領域，北京地區便有朝陽循環經濟產業園、中關村科技示範園以及通州國家環保園區等較為高端的產業園區。而在珠三角區域，新材料領域的發展獨樹一幟，例如廣州市擁有250餘家高新材料企業，且一半企業的產值過億，其中最具代表性的便是金發科技集團。除了沿海和沿江區域外，中東部地區也有依據自身資源優勢而發展起來的戰略性新興產業，例如中部地區有著豐富的有色金屬和非金屬礦產資源，這有力地催生了能源和原材料產業生產優勢；而以四川和陝西為核心的西部地區，其地理與能源優勢使之成為我國航空航天產業發展的重要地區。
我國戰略性新興產業發展中存在的問題
全球化使各國的經濟、社會、技術發展各方麵更加密切，我國的戰略性新興產業的發展在全球化背景下也麵臨著新的機遇與挑戰。從我國戰略性新興產業的發展來看，其在各個領域可以說是有了較大的發展，但放在全球視野中，與發達國家相比，我國的戰略性新興產業便明顯地呈現出起步晚、自主知識產權不足以及轉化難等問題。
缺乏科技成果轉化中介機構，轉化率低。科學研究的最終目的是為了服務於生產建設，在此基礎上，科技成果的轉化率也就成為了檢驗該科技成果轉化率狀況的試金石。我國當前的統計數據顯示科技成果的轉化率還比較低，其中成果轉化率隻達到20%左右，專利實施率則更低，不到10%，這一數據不僅遠遠低於歐美一些發達國家的水平，甚至與韓國、新加坡等新興國家相比較而言，也存在很大的差距。造成這一現狀的原因，便是我國缺乏專業的科技成果轉化中介，雖然我國的科研機構較多，但是由於缺乏中介機構，這便直接造成了很多企業很難直接獲得最新的生產技術，與此同時，科研機構也缺乏將研發成果推廣的渠道，這就阻礙了新的先進技術在整個社會生產中的推廣，其效益和價值得不到應有的發揮。
新興產業企業規模比較小，缺乏自主創新能力。我國企業在自主創新方麵普遍存在著創新能力較弱、知識產權少的窘境，因此他們很難在大範圍內推廣或將其品牌化，而且目前許多戰略性新興產業企業以貿易為主，大多隻是代理外國產品，很少自主進行產品研發，而即使這些公司進行產品研發，往往也處於高科技行業的中低端層次，產品並沒有過高的附加值，形成知名品牌的更少。我國大多數戰略性新興產業缺乏獨立承擔科研項目的能力，而且由於科研項目所需投入的人力、物力、財力較多，而且研發周期長，有一定的風險性，許多企業便轉為對一些高科技產品進行模仿，缺少原創精神。目前我國戰略性新興產業中也出現了聯想、華為等具有一定國際競爭力的企業，但從整體來看，我國的戰略性新興企業規模小、國際競爭力不強。
融資渠道狹窄，資金不足。科技作為一種生產要素越來越被國家重視，我國近年來用於科技研發的經費投入也越來越多，但與發達國家相比，我國科研經費的GDP占比仍然不高，例如2007年，我國用於科技研發的經費占GDP的1.49%，而同為亞洲國家的日本這一數字為3.39%，韓國是3.23%，這都高於我國。而且在科研經費的分配使用上，科研機構和高校占比較多，而企業則很少拿到國家的科研經費投入。另一方麵，我國科研經費不足主要原因便是融資渠道過於狹窄，單純從數字上分析，盡管我國企業的科技投資比例高達70%，但這其中主要是針對一些大型國企和軍工企業，而民間企業很少參與科技研發投資。因此可以說，政府仍然是我國戰略性新興產業科技研發的主要資金來源，而在發達國家，高新科技產業的主要資金來源是風險投資，民間投資也較為發達，而我國還沒有形成高新科技風險投資的市場環境。
自主知識產權少，國際競爭力不強。目前我國高新技術產品的進出口雖然在不斷上漲，但從2007年的統計數字來看，外資企業占高新技術產品進口總額的86.6%、出口總額的79.4%，由此可見我國自主的高新科技產品占進出口總額量較少，這也就意味著我國的戰略性新興產業在國際上並不具備一定的競爭力。從貿易差額的角度來看，外資企業是我國高新技術產業類貿易順差的主體，且順差額度較大，而國內的大部分新興產業都處於貿易逆差的狀態。而造成國內國有企業以及私營企業在高新技術產業貿易中貿易逆差的一個重要原因便是我國缺乏自主知識產權，其在整個國際的高新基礎產業鏈中還處於較低層次水平，這也使得其對外技術依存度較大。例如，目前一些移動電話的芯片、數字電視中的核心技術、電腦計算機中的因特爾芯片等都長期依賴進口。而這些軟件、芯片等高科技產品涉及到了國家的國防安全、經濟安全等有關信息產業的方方麵麵，對於一國發展十分重要，但目前我國在這方麵的技術研發比較薄弱，還較依賴國外相關技術。