（1）事關經濟安全。國家經濟安全是維持國家機器正常運轉、推動社會和諧發展的保障。基層審計機關還要隨時關注經濟增長的環境和資源的代價問題，當前基層地方增長方式粗放問題仍然突出，經濟增長的資源環境代價很大，如不及時控製，後果不堪設想，環境資源問題直接關係到我國經濟持續健康的目標能否實現。（2）事關社會穩定。利益永遠是社會的焦點，社會矛盾的爆發和平衡點。如果利關係調整不好，不僅影響改革發展的問題，還可能危及社會穩定。（3）事關政府自身建設。政府在當今經濟社會中扮演著重要的角色，建立一個有效的政府是關係一國發展成敗的關鍵，提高政府能力是各級政府追求的目標。加強行政監督，推進依法行政是審計的基本任務。
2.靈活審計監督方式，突出預防與建設效果
（1）加強審計監督的幅度和頻度，實現審計監督全麵化和日常化。（2）提高審計監督深度，實行關口前移和全過程跟蹤審計。（3）加大審計監督的力度，建立監督部門聯動機製。（4）擴大審計的影響度，推行審計公告與審計問責。
3.積極探索審計方式和方法，適應時代發展的需求
時代的變遷，審計環境的變化，審計領域的擴大，都需要不斷更新審計方式和方法來適應。審計機關要有大的作為就必須審時度勢，不斷探索符合時代發展需求、符合審計發展規律的審計方式和方法。
4.審計隊伍建設和審計
審計的免疫係統定位對審計隊伍提出了很高的要求，它不僅要求審計人員有紮實的審計專業知識，更需要審計人員有很強的宏觀形勢分析能力，對風險的預判能力，還應有較強的政策建議能力。應該說現行審計隊伍素質與勝任審計作為經濟社會免疫係統還有較大的差距，特別是基層審計機關更為突出。
基層審計機關往往忽視審計成果的管理，直接影響審計成果的利用。實際上審計成果的利用是審計的最終目的，是審計的價值所在。基層審計機關應堅強審計成果管理，利用已有的審計成果，進行橫向分析和縱向分析，使一些體製性、機製性問題的審計有新的深度和新的突破。
三、基層審計機關發揮免疫係統功能的局限和展望
1.存在的局限
（1）管理權限上劃，監督範圍縮小。但是隨著一些中央企業管理權限上劃和一些行政部門的垂直管理，基層審計機關的監督範圍越來越小，製約了審計機關作為經濟社會免疫係統的功能發揮。此外，一些工商、質檢、藥監等部門實行了垂直管理，導致審計機關無法對這些監督民生事業的執法部門的再監督。（2）缺乏係統地識別經濟社會風險的能力。係統識別經濟社會的風險是一項十分艱巨的任務，它不僅要求審計人員有很強的責任意識，而且要求審計人員有很高識別風險能力。目前審計機關和審計人員隻停留在憑經驗判斷階段，缺乏對經濟社會係統風險判斷的專業知識，審計機關也沒有出台相應的指南，因此基層審計機關對風險的防範具有很大的局限性。
2.展望
（1）加大對基層審計機關的授權，擴大其監督範圍。上級審計機關特別是審計署要加大對基層審計的授權範圍，讓基層審計機關可以自由的根據形勢需要確定監督重點和範圍，發揮基層審計機關的優勢，及時發現和控製經濟社會運行中存在的風險，真正發揮國家審計是經濟社會運行免疫係統的作用。（2）構建經濟社會運行健康指標體係，出台風險識別指南。積極探索經濟社會運行健康指標體係，出台風險識別指南，為基層審計機關對經濟社會風險判斷提供科學的依據，為審計機關動態把握經濟社會隱含的風險提供可能。為今後建議整個經濟社會風險監測機製和預警機製提供基礎。