2.支出決策者與支出辦理者絕對分離
國庫集中支付製度，應該建立在支出決策和支出實際辦理者絕對分離這一原則基礎之上的。為確保這一原則的實施，各級政府支出部門和機構具有支出管理的決策權，但不能在銀行開立自己的賬戶和直接簽發支票，隻有國庫才能簽發支票，辦理支出。從目前各地方政府實施國庫集中支付的情況看，實行授權支付後，憑借零餘額賬戶或備用金賬戶，預算單位在預算範圍內可自行做出購買商品與勞務的決策，辦理預算資金的支付，核算中心對票據審核僅僅是經費開支後的事後審核，缺乏意義，監管力度不大。
三、國庫集中支付改革中強化財政監督的措施
國庫改革的深化得益於各項配套措施的完善，國庫改革中強化財政監督職能更是離不開相關配套措施的建立。
1.領導重視，部門配合
國庫集中支付改革，涉及麵廣，觸動利益分配格局，既需要各行政事業單位的理解、支持、配合，又要有政府強有力的領導支持；既需要財政部門的統一規劃運作，又要有各行政事業單位的整體聯動；既需要財政預算總體方案，又要有內部職能科室的分工協作。
2.轉變會計核算中心職能
在國庫集中支付製度下，會計核算中心需從核算型向管理型轉變，要著重於預算執行信息的反饋和控製，將對預算資金支付的事前、事中控製作為主要工作。要達到強化財政監管，提高資金使用效率的目的，首先，必須轉變會計核算中心的機構定位，要將核算中心從公益服務類逐步向監督管理類事業單位轉變。其次，要轉變核算中心工作人員的工作思路。以往中心會計人員在收到單位支付申請後，主要審核單位經濟事項的合理性、合法性，對經濟事項事前是否可以列支的支配權不大。實行轉變後，中心工作人員在審核經濟事項中主要確定是否符合有關規定、占用何指標、列支何科目，才可以通知銀行付款，要以預算執行為主要職責，以審核、控製、分析為主要工作，實現會計工作職能的轉變。
3.建立資會支付動態監控係統
構建國庫集中支付監督製約機製的總體要求是：緊緊圍繞財政國庫管理製度改革，建立以財政資會收付實時監測為中心，以現代信息網絡技術為支撐，以國庫集中支付係統和動念監測係統為手段、以內控管理和外部監管製度為基礎，綜合運用多種監管方式、強化財政事前事中監管的現代財政資金支付監督管理模式。
在科學技術高速發展的今天，財政監督必須依托現代科技手段，建立全方位、高效率的電子信息網絡，實現財政監督機構與財政業務部門、國庫、銀行等單位的聯網，全麵追蹤監測財經活動，提高財政監督的效率。為防範支付風險，強化資會支付監督，須利用現代信息網絡技術手段建立國庫動念監控係統，作為國庫集中支付監管機製的技術支撐。
4.建立健全財政外部監督管理製度
在實現資金支付動態監控的同時，各級地方政府會計核算中心要借助於其他部門共同的監管來進一步強化國庫集中支付過程中的財政監督職能，如有人大、財政部門、政府主管部門、審計、國庫、代理銀行等各個方麵的監督。采取有效措施加強政府經濟監督部門間的協作，逐步建立完善的財政監督機構體係。特別是財政職能部門與核算中心預算執行信息的溝通、傳遞，實現信息共享，提高監管效率。它們既明確分工、各有側重，又互相配合、形成合力，還互相製約、互相監督。
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