在基金的使用方麵，應該實現因地製宜，結合各地區的實際情況來進行基金的分配，其中應該對當地的經濟水平、農民的消費習慣、貧富差距等因素進行綜合性的考慮，對醫療補助資金進行適當的調整。在使用中還應該注意向貧困地區和特殊人群進行傾斜，使農民能夠切實地體會到新農合醫療基金的保障作用，最終從根本上使農民的醫療費用問題得到解決。
（三）加大新農合的信息化建設
加大計算機網絡的不急成俗，能夠實現會計管理核算的規範化和標準化，使基金財務管理工作的效率和質量得到大幅度的提升。隨著新農合的推廣，資金籌集以及會計的審核工作都需要更加快速和精確的計算管理方式，通過信息化的管理，能夠保證資金信息的完整和規範，預防財務管理工作中出現資金數據的混亂、錯誤現象。另外在醫療中心進行信息化的管理，也能夠保障農民進行及時報銷，使結算的工作量大大減少，提高管理人員的工作效率，給基金的財務管理工作帶來更大的便利。
（四）加強監督管理工作
在基金的管理監督方麵，應該保證監督工作能夠切實到位，避免資金的分配和使用不合理。在醫療機構方麵，應該對其收費的標準和醫療技術進行監督檢查，避免不合格的治療和用藥的現象。使新農合基金財務管理工作更加規範，使廣大農民能夠真正獲利。另外還應該建立基金的網絡監控機製，對基金運行的過程進行跟蹤監督，保證醫療費用報銷能夠嚴格到位。
（五）加大宣傳力度，提高參保率
由於大部分農村地區對新農合一包體係並沒有詳細的了解，對參保有著一定的抵抗情緒，導致參保率無法得到有效提升。因此，有關部門應該加大宣傳的力度，盡可能在每家每戶落實新農合製度的宣傳，使農民能夠對新農合基金的重要性有真正的認識，主動參保。
（六）完善結餘管理
在基金的運行過程中，實現完全的收支平衡是非常困難的，對於實際基金結餘過低或者過高的問題，管理部門應該加強收支預算的管理工作，建立風險預警製度，以實現風險的防範，使基金的使用效率得到提高。管理中既要避免基金結餘過多的現象，又要防止某些地區出現收不抵支的情況。
三、結束語
新型農村合作醫療對於減輕農民群眾的醫療負擔，保障廣大農民的健康有著重要的意義，對於我國和諧社會的建立有著重要的意義。新農合基金的組織和利用，關係到廣大農民群眾的根本利益，因此需要對其資金管理工作不斷進行探索和創新。
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