（二）完善會計軟件功能，實現核算型向管理型的順利過渡
會計電算化不僅僅要實行傳統會計的職能，更要有分析能力的功能，解決這一問題的關鍵一是要提升軟件的管理層級，要求軟件公司按照行政事業單位財務工作的需要，豐富功能模塊，統一開啟功能模塊，如財務分析、決策分析、個人往來款、部門經費等功能模塊，使軟件起到事前檢測、事中控製以及事後處理等作用；其次，要不斷完善會計軟件係統的功能，並提高其利用率，把軟件分析能力轉化成自身的能力，要熟練運用軟件的各個功能，財會軟件操作人員一定要弄懂弄透，幫助單位借助更加準確的財務指標做出正確決策，進一步提高財政資金的使用效率。
（三）改善會計電算化運行環境，完善會計電算化內部控製製度
會計電算化的實現，對人們的傳統觀念、原有的會計業務處理流程、內部控製方式及組織結構產生一定影響，單位必需要調整原有的工作體係，改善會計電算化運行環境，規範賬務處理流程，以適應會計電算化工作的要求。一是要加強預算收支、規範憑證審核。實行電算化會雖然在一定程度上提高了工作效率，能迅速、準確地處理數據，及時向相關部門提供會計信息，但若不加強執行收支預算，不規範原始憑證審核製度，就會使電算化會計輸出數據不真實。因此，必須嚴肅加強預算收支和規範原始憑證審核等製度，否則，就會導致假賬真算現象的發生。二是要製定科學、合理且可操作化的內部控製製作，以保證會計工作的順利進行。具體包括：會計電算化崗位責任製度、電算化係統操作管理製度、計算機硬件和軟件管理製度、電算化係統會計資料和檔案管理等。三是要提高領導對會計電算化的認識，一方麵可以通過製定管理製度來管理或者約定會計人員，使得人人都能以企業利益出發，把單位會計電算化作為日常工作要點來管理；另一方麵要保證會計電算化軟件、硬件製度、係統操作製度及檔案製度的有效實施，確保會計電算化正常健康發展。
（四）升級軟件係統
目前行政事業單位會計電算化係統應完成三個升級：首先，是版本的升級。目前使用的商業化財務通用軟件具有針對性較低，且不能清楚的反映出單位在財務管理方麵的優勢和特點。例如，單位在預決算、資產使用、非稅收入及國庫支付等方麵，未建立相關的管理機製或者處理不夠專業，質量較差。因此，要對係統應用版本進行統一和升級，以為單位提供專業性較強的財務管理係統，促進財務會計軟件向著規範性、專業化、針對性的方向發展，使之更好地滿足行政事業單位財務管理工作的需要。其次，是模式的升級。目前，我國行政事業單位所采用的財務管理模式，主要以分散式的核算模式為主，存在數據管理分散，監管難度較大等問題，導致主管行政事業單位對下級單位難以進行有效監控。因此，行政事業單位應該對財務管理軟件係統進行統一的升級，並通過分布管理模式或者實時管理模式，對財務會計數據信息進行集中管理，以保證財務監督工作的有效實施。第三，是管理的升級。建立財務綜合管理平台，以財務管理作為重要核心，將業務係統進行集中，同時建立有效的監督內審機製及單位決策係統，以提高財務會計電算化管理工作的信息化程度，提高財務會計管理的效率和質量。
總之，行政事業單位開展會計電算化大大促進了財務工作的全麵發展，雖然在實際工作中還存在一些問題，必須引起行政事業單位的高度重視，並采取有效的解決措施，以保證優化我國行政事業單位的會計電算化模式，促進會計電算化工作的發展，提高行政事業單位的會計工作效率和質量，促進行政事業單位的快速發展，為我國經濟發展做貢獻。
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