王安石在變法的過程中，視呂惠卿為自己最得力的助手和最知心的朋友，一再向神宗皇帝推薦，並予以重用，朝中之事，無論巨細，全都與呂惠卿商量之後才實施，所有變法的具體內容，都是根據王安石的想法，由呂惠卿事先寫成文及實施細則，交付朝廷頒發推行。
當時，變法所遇到的阻力極大，盡管有神宗的支持，但能否成功仍是未知數，在這種情況下，王安石認為，變法的成敗關係到兩人的身家性命，並一廂情願地把呂惠卿當成了自己推行變法的主要助手，是可以同甘苦共患難的“同誌”。然而，呂惠卿千方百計討好王安石，並且積極地投身於變法，卻有自己的小算盤，他不過是想通過變法來為自己撈取個人的好處罷了。對於這一點，當時一些有眼光、有遠見的大臣早已洞若觀火。司馬光曾當麵對宋神宗說：“呂惠卿可算不了什麼人才，將來使王安石遭到天下人反對的，一定都是呂惠卿幹的！”又說：“王安石的確是一名賢相，但他不應該信任呂惠卿。呂惠卿是一個地道的奸邪之輩，他給王安石出謀劃策，王安石出麵去執行，這樣一來，天下之人將王安石和他都看成奸邪了。”後來，司馬光被呂惠卿排擠出朝廷，臨離京前，一連數次給王安石寫信，提醒說：“呂惠卿之類的諂諛小人，現在都依附於你，想借變法為名，作為自己向上爬的資本，在你當政之時，他們對你自然百依百順。一旦你失勢，他們必然又會以出賣你而作為新的進身之階。”
王安石對這些話半點也聽不進去，他已完全把呂惠卿當成了同舟共濟、誌同道合的變法同伴，甚至在呂惠卿暗中搗鬼被迫辭去宰相職務時，王安石仍然覺得呂惠卿對自己如同兒子對父親一般地忠順，真正能夠堅持變法不動搖的，莫過於呂惠卿，便大力推薦呂惠卿擔任副宰相職務。
王安石一失勢，呂惠卿被厚臉掩蓋下的“黑心”馬上浮上台麵，不僅立刻背叛了王安石，而且為了取王安石的宰相之位而代之，擔心王安石還會重新還朝執政，便立即對王安石進行打擊陷害，先是將王安石的兩個弟弟貶至偏遠的外郡，然後便將矛頭直接指向了王安石。
呂惠卿的心腸可謂狠得出奇，當年王安石視他為左膀右臂時，對他無話不談，一次在討論一件政事時，因還沒有最後拿定主意，便寫信囑咐呂惠卿：“這件事先不要讓皇上知道。”就在當年“同舟”之時，呂惠卿便有預謀地將這封信留了下來。此時，便以此為把柄，將信交給了皇帝，告王安石一個欺君之罪，他要借皇上的刀，為自己除掉心腹大患。在封建時代，欺君可是一個天大的罪名，輕則貶官削職，重則坐牢殺頭。呂惠卿就是希望徹底斷送王安石。雖然說最後因宋神宗對王安石還顧念舊情，而沒有追究他的“欺君”之罪，但畢竟已被呂惠卿的“軟刀子”刺得傷痕累累。
在待人處世中，特別是權力場中，總會遇到這樣的人，當你得勢時，他恭維你、追隨你，仿佛願意為你赴湯蹈火；但同時也在暗中窺伺你、算計你，搜尋和積累著你的失言、失行，作為有朝一日打擊你、陷害你並取而代之的秘密武器，對待這種人一定不能心慈手軟。公開的、明顯的對手，你可以防備他，像這種以心腹、密友的麵目出現的對手，實在令人防不勝防。王安石就是因為“同舟”之時，缺乏應有的防備之心而遭了暗算。