3.1 農藥理化性質與農藥殘留
3.1.1 有機砷、汞等高殘留、毒性強的農藥雖早已被禁用，但由於其代謝產物含砷、汞且最終無法降解而長期殘存於環境和植物體中，汙染影響時間長。日本的“水俁病”事件就是由於魚攝取了環境中嚴重超標的汞所致。
3.1.2 有機氯農藥主要有六六六（HCH）、滴滴涕（DDT）等，它們本身及其代謝產物毒性並不高，但化學性質穩定，在農作物及環境中消解緩慢，同時容易在人和動物體脂肪中積累。因而它們的殘留問題是畜牧工作者考慮的主要方麵。我國於1983年開始禁止生產使用，但目前殘留仍然較高。國標中對飼料農藥殘留測定的主要指標就是六六六、滴滴涕。
3.1.3 含磷類農藥、酯類農藥化學性質不穩定，目前應用較多，在施用後，容易分解。但這類農藥中部分品種高毒、劇毒，如甲胺磷、對硫磷、涕滅威、克百威、水胺硫磷等，如果施藥安全間隔期（最後一次施藥距采收的安全間隔時間）短，或施用於連續采收的青綠飼料，則很難避免殘留量超標。農業部2002年已發文停止了新增甲胺磷、甲基對硫磷等這類高毒有機磷農藥的登記。
3.1.4 還有一部分農藥本身毒性較低，但生產過程中雜質或代謝物殘毒較高，如三氯殺蟎醇中的雜質滴滴涕，丙硫克百威的主要代謝物3-羥基克百威等。
除上述外，對於所有的農藥而言，其水溶性、揮發性、吸附性及內吸性都會影響農藥殘留。環境因素也在不同程度上影響農藥的降解速度。
3. 2 農藥產品結構、產品質量與農藥殘留
目前，中國有農藥生產廠家2000多家，農藥產品中殺蟲劑占70％，而殺蟲劑中有機磷農藥占70％，有機磷殺蟲劑中甲胺磷、甲基對硫磷等高毒品種占70％。這說明產品結構不盡合理。此外，產品質量合格率不高，僅為75％左右，假冒偽劣產品時有出現。這些因素也影響著農藥殘留。
3.3 使用方法與農藥殘留
一味追求殺蟲效果而不合規定的施藥時間、施藥次數、施藥量和安全間隔期短是造成農藥殘留高的主要因素。施藥技術水平低，不恰當的施藥方式和不良的施藥設備也會影響農藥殘留，表現為施藥中“跑、冒、滴、漏”現象突出，流失嚴重，有效利用率低，導致汙染作物和環境。
3.4 安全環保意識與農藥殘留
目前我國的廣大農民和飼料生產企業對農副產品農藥殘留問題還重視不夠。
4 飼料中農藥殘留的分析
農藥殘留分析就是利用儀器分析的方法對食品、飼料中的農藥殘留的痕量分析，通常包括樣品前處理和測定兩部分。樣品前處理（采集、提取、淨化）是核心。
試樣提取是關鍵，選擇合適的提取劑尤顯重要。提取方法一般有：索氏提取法、浸泡-震蕩法、組織搗碎法、消解法、超聲波提取法等。淨化是定量測定前一項複雜而重要的步驟。其基本方法主要有：液液萃取法、柱層析法、薄層層權法、吸附柱色譜及吹掃蒸餾技術、固相微萃取技術、超臨界流體萃取。飼料中的農藥殘留分析常用浸泡-震蕩法。
農藥殘留的測定根據試樣及農藥種類而有不同的方法。
4.1 氣相色譜法（GC）及氣相色譜（GC）-質譜（MS）聯用國標對飼料中HCH與DDT的測定采用的是氣相色譜法（GB／T13090－1999）。此法定量檢測限（MLQ）為允許量的1／20～1／80。如果有條件，氣相色譜（GC）-質譜（MS）聯用則效果更好。