（2）酵母菌酵母細胞富含蛋白質、核酸、維生素和多種酶，具有增強動物免疫力，增加料適口性，促進動物對飼料的消化吸收能力等功能，並可提高動物對磷的利用率。用於飼料中的酵母菌主要是假絲酵母、紅色酵母、釀造酵母和啤酒酵母。
（3）芽孢杆菌芽孢杆菌是好氧菌，在一定條件下產生芽孢，由於芽孢的特殊結構使芽孢杆菌耐酸堿、耐高溫和擠壓，在腸道酸性環境中具有高度的穩定性，能分泌較強活性的蛋白酶及澱粉酶，促進飼料營養物質的消化。目前使用的菌株有枯草芽孢杆菌（Bacillussbtilis）、地衣芽孢杆菌（Bacilluslicheniformis）、蠟樣芽孢杆菌（Bacilluscereus）、東洋芽孢杆菌（Bacillustoyoi）等。
（4）光合細菌光合細菌能在厭氧光照條件下利用CO2，有些光合菌還有固氮作用。經分析，光合菌菌體蛋白中多種必需氨基酸的含量高於酵母菌。光合細菌不僅為生物體宿主提供豐富的蛋白質、維生素、礦物質、核酸等營養物質，而且可以產生輔酶Q等生物活性物質，提高宿主的免疫力。光合細菌在改善水體環境，促進水產動物生長增重，改善色澤等方麵有良好的作用。
2.1.2活菌微生態製劑的作用機理
2.2.2.1改善胃腸道做生態環境
研究表明，動物自身及許多致病菌部會產生各種有毒物質，如膠、氨、細菌毒素、氧自由基等代謝產物。有些有益菌可以阻止毒性胺和氨的合成或把它們分解中和細菌毒素，從而避免這些有害物質對動物機體組織細胞的損害作用。一些好氧菌則通過產生超氧化物歧化酶可以幫助消除氧自由基，減少或消除氧自由基對細胞及細胞器膜質結構的損害。乳酸菌能夠產生有機酸和抗菌物質，降低腸道內pH值和氧化。還原電位，有利於指主生長發育和維持健康。
2.1.2.2產生有益物質
動物微生態活菌製劑能夠在動物體內產生各種消化酶，合成B族維生素、VＫ等動物所必需的營養物質；同時能促使動物體增加對腸道內容物中鈣、鎂等營養物質的吸收。
2.1.2.3建立和維持腸道微生態平衡
研究表明，動物腸道內寄居的微生物，主要為厭氧菌。通常情況下，腸道內有益菌和致病菌保持一定比例，當條件發生改變時，這種平衡失調，致病菌大量繁殖，從而導致動物體患病。當需氧型益生菌進入消化道後，生長繁殖消耗腸道內大量氧氣，通過“生物奪氧”使需氧型致病菌大幅度下降，因而起到防止動物患病的作用。研究還發現，益生菌能夠有秩序地定植於粘膜、皮膚等表麵或細胞之間形成生物屏障，這些屏障可以阻止病原微生物的定植，起著占位、爭奪營養。互利共生或拮抗作用，形成保護屏障，阻止病原菌的侵入，從而對致病菌的定植產生抑製作用。
2.1.2.4增強動物免疫能力
微生態製劑對以成為非特異性免疫調節因子，增強吞噬細胞的吞噬能力和細胞產生抗體的能力，刺激動物產生幹擾素，從而增強抗病能力。
2.2化學微生態製劑——寡糖類
2.2.1寡糖的特點
寡糖，在營養學中也稱益生素元（probioctis）。它是一類能夠促進腸道革蘭氏陽性菌生長的新型飼料添加劑，這類寡糖也稱為功能性寡糖，由2－10個單糖分子通過糖苷鍵形成直鏈和支鏈的糖類。它們具有穩定、粘度低、吸濕性大、無毒等理化特性，一般動物本身不分泌消化它們的酶類。因此，它們可以不受動物的消化而直接進入後消化道內，作為有益微生物的營養底物，從而促進後腸道有益微生物的繁殖和抑製有害微生物的生長，改善腸道微生態環境。因而自對世紀80年代以來，它愈來愈受動物營養學者的重視，作為新型飼料添加劑使用。
2.2.2寡糖的作用機理
寡糖作為微生態製劑得益於它們能夠調節動物消化道的微生物區係的平衡，動物在下述幾方麵得益。
2.2.2.1促進腸道有益微生物的生長繁殖，抑製有害微生物的生長
寡搪進入後腸道後，能被乳酸杆菌。雙歧杆菌的有益菌利用，而有害菌如大腸杆菌。沙門氏杆菌等對寡糖的利用很差。由於有益於產酸菌的迅速繁殖，產生較多的乳酸，使腸道pH值下降，直接抑製病原菌的生長；另一方麵使腸道的還原電勢降低，具有調節腸道正常蠕動的作用，間接阻止病原菌的腸道中的定植。另外，寡糖還具有結合、吸收外源性病原菌的作用。
2.2.2.2增強動物機體免疫應答能力，提高動物免疫能力
動物試驗表明，寡糖對動物的免疫能力具有促進作用，不論是體液免疫還是細胞免疫。在細胞免疫方麵，一般認為寡糖能夠刺激巨噬細胞，增強其吞噬作用，其中寡糖首先與舞特異受體結合而激活巨噬細胞。在體液免疫方麵，寡糖的主要功能在於它的免疫佐劑作用，它能顯著提高抗體的反應能力。