2.4利用沼氣工程:畜禽糞便中含有大量的有機物，在高溫（35℃～55℃）厭氧條件下經微生物降解為沼氣和二氧化碳。通過沼氣發酵，可殺滅糞水中的病原微生物。血吸蟲卵在常溫沼氣池內7～22天被殺滅；鉤蟲卵經30天殺滅90％，兩個月死亡率達99％；蛔蟲卵30～40天被殺滅；痢疾杆菌在沼氣池中30h死亡。改善了周圍的環境，減少了人畜共患病的發生，保證了人民的身體健康，有利於畜牧業的持續發展。
沼渣作為肥料，可以改良土壤質量，改善農作物生長環境。經過發酵的沼渣，病原體已基本被殺死，不會對農作物造成感染而發生病蟲害，是優質的有機肥，用它代替化肥，可以改良土壤，降低成本。
沼渣液作為飼料，用於養殖畜禽，節省飼料資源。據江蘇省沼氣研究所對雞糞沼氣發酵渣液的檢測結果顯示，其中含粗蛋白16.94％、粗脂肪29.28％、粗纖維5.32％、灰分36.4％、無氮浸出物12.06％、氨基酸總量為14.54％，其中賴氨酸0.87％。另外還含有核黃素、煙酸、銅、錳、鉀、硒、磷等多種營養素。趙書峰（1999）用雞糞發酵沼渣液飼喂生長育肥豬日增重提高43g/頭，料重比下降6.98％。
用沼液可以防治病蟲害，能夠避免農藥對環境的汙染。由於沼液中存在著許多氨離子和多種微生物，並含有吲哚乙酸和赤黴素等物質，能夠殺菌並對有害病菌有抑製作用。試驗表明，沼液對蚜蟲的殺死率為90.23％，對紅、黃蜘蛛的殺死率為95.25％，對矢尖晰的殺死率為91.55％，對其它青蟲的殺死率為99.4％。
3．利用除臭劑:為減輕畜禽排泄物及其氣味的汙染，可在飼料或墊料中添加各類除臭劑。沸石有較強的吸附能力，可減少糞臭。美洲植物絲蘭的提取物，有兩種活性成分，一種可與氨氣結合，另一種可與其它有害氣體結合，從而能減少畜舍內的臭氣味，目前，絲蘭提取物在國外已廣泛用來做畜舍的除臭劑。
4．製定防汙染法規:英、法、美、日、丹麥、荷蘭、意大利等國家都已製定了有關防治畜牧業汙染的法規及標準。如：日本規定豬的糞汙排放標準，BOD最大為160mg/L，日平均為120mg/L以下，SS（懸浮物）最大為200mg/L，日平均為150mg/L以下，我國的相應法規也應早日出台。