從報考條件來看，根據《中華人民共和國注冊會計師法》及有關考試辦法的規定，原來沒有從事過會計工作的人通過一段時間的突擊複習，便也能順利及格，但一段時間過後，便都忘記了。而有一些的確有過很多會計經驗的人卻有可能因應試能力較差，無法考取會計資格，導致人才流失。 其次，從注冊會計師的考試範圍分析，全國注冊會計師考試的內容也過於單一，未能全麵考察會計人員的整體能力。而且在外語，計算機方麵也不盡人意，應該加強。注冊會計師的工作自始至終離不開與客戶打交道，工作的最終成果體現在注冊會計師所撰寫的審計報告上。因此，交際才能與文字表述能力也應是注冊會計師必備的素質，而現行的考試卻無法檢驗這種素質。
（六）市場經濟機製不完善的問題
我國還處於社會主義市場經濟的初步階段。中國注冊會計師的出現，在一定程度上來說，發展的很不完全，並未形成一種真正的市場需求。絕大多數企業聘請注冊會計師審計不是出自自願，而是為了應付相關部門的規定。
（七）企業會計信息失真
企業會計報表的真實性、完整性、合法性將直接影響到注冊會計師對發表正確的審計意見。然而現狀是企業通常都是做假悵、做錯悵，令注冊會計師也沒有辦法。企業會計信息失真大致是因為企業自身經營機製存在問題。另外，有關權利部門的行政幹預也造成了企業會計信息的失真。
（八）在細節問題上的缺陷
比如，某些會計科目體係不完善。主要表現在一些單位在接受投資的時候無法客觀，真是的得到反映。現在，這些單位接受其他企事業單位對其投資的經濟業務越來越頻繁，應該包括更多方便，如貨幣投資，技術，設備，材料等。另外，某些會計科目內容還不夠全麵。主要表現在對外投資的會計核算上。
二、我國注冊會計師製度健康發展應采取的對策
（一）完善的市場經濟體製，健全法規法律製度，完善監管體製
完善市場經濟體製，重點就是要建立現代市場體係，搭建市場機製發揮作用的平台，建立統一、開放、競爭、有序的市場體係，法律是市場經濟秩序的保障，有了科學、健全的適應市場經濟的法律，市場經濟就能健康、順利地發展，財政部作為我國注冊會計師行業的主管部門，要全麵加快發展注冊會計師製度的形勢，結合本地區經濟社會發展實際的狀況，積極製定出支持注冊會計師製度快速發展的具體措施和策略，共同促進注冊會計師製度的發展，更要重視發揮注冊會計師協會的巨大作用。
（二）完善注冊會計師行業的市場準入製度
完善注冊會計師行業的市場準入機製主要表現在：首先，要逐步完善注冊會計師執業環境，政府相關部門要引導會計師事務所之間的良性競爭，嚐試運行會計師事務所的破產製度，讓會計師事務所在良性競爭中實現優勝劣汰。要扶持引導執業規範、信譽好的事務所，使會計師事務所樹立品牌意識，做大做強，造就出一批規模大、專業強、品牌硬的會計師事務所。第二，分級管理會計師事務所。分級管理是一個重要的製度創新，事務所的等級由相關專家按公認的標準來確定，實行“優者上，劣者下”。事務所等級的評定應從多方麵考慮，比如注冊會計師人數、注冊資本、年業務收入、服務態度、審計質量、對社會的責任感等方麵，事務所分級管理製度有利於全方位多角度的規範事務所的行為。
（三）完善事務所退出機製。