未久，龍雲之子、留昆滇軍首領、暫編二十四師師長龍繩祖，聞訊率部封鎖了五華山。另一滇軍首領張衝也率部向五華山殺奔而來，意與龍繩祖部合兵一處共守省府。杜聿明部一看這陣勢，遂以猛烈火力進攻昆明大東門，襲擊五華山，並向已搶占北校場的龍繩祖部包剿而來。未戰幾個回合，龍繩祖軍力不支，大部繳械投降。為速戰速決，杜聿明指揮所部使用了大批美援武器如機槍、火箭炮、坦克車等重型武器，全力進擊五華山。龍繩祖、張衝指揮駐防昆明各城門的憲兵一個團和五華山兩個連的警衛部隊拚死抵抗，因杜部火力猛烈，守軍死傷遍地，不到一個時辰，守衛大東門城樓的憲兵隊官兵全部戰死。
炮火硝煙中，龍雲如同一隻受驚的野狐，悄悄爬出樹叢，鑽入五華山省政府大廳電報室，急促地命電報員向外拍發“戡亂”電報，稱杜聿明叛變，圍攻昆明城，令盧漢率領入越軍隊火速回攻昆明，同時電令省屬各區專員、縣長率領地方保安團、隊，星夜兼程向昆明前進，實行內外夾攻，一舉消滅杜部。當時雲南各地的保安部隊號稱10萬之眾，龍雲自恃這支力量可以與杜聿明部較量一番，決心在五華山固守待援。但由於此前他的通信設施大部遭杜部破壞或監視，很快與各方失去聯係，龍雲成為一隻孤獨的困獸，隻能徒歎奈何！奈何！
3日清晨，龍繩祖殘部已無力與對方交戰，隻好退入省府大廳四周固守。杜聿明怕繼續強攻傷及龍雲性命無法向蔣交差，下令停止攻擊，派人把蔣介石“免去龍雲本兼各職，調任軍事委員會軍事參議院院長”的命令送交龍雲。龍氏看罷，當場罵蔣介石“獨夫民賊”“卑鄙無恥”等，而後把手令撕得粉碎踩於腳下，不再理會。
龍雲被困五華山的電報發到西昌後，為穩住在越受降的盧漢，打消其回返救援的念頭，蔣介石派王叔銘火速駕機飛往河內，將早已寫好的親筆信送交盧漢，信曰：
永衡吾兄勳鑒：
抗戰勝利國家急需統一軍令政令，為加強中央，鞏固地方，特任誌舟為軍事參議院院長，調中央供職，以全誌舟兄晚節。並委兄為雲南省政府主席，委李宗黃為民政廳長，在兄未到任前，由李宗黃代理。盼曉諭所屬，以安眾心。並望在越受降事竣，來渝一敘。
順頌勳祺。
中正手書10月2日[17]
10月4日，何應欽奉蔣介石之命，以中國陸軍總司令身份，再度飛至河內，名為視察受降情況，實則探視盧漢動靜。此時的盧漢已得知昆明發生兵變，龍雲凶多吉少，由於昆明方麵的通信係統中斷，無法繼續聯係，遂未做出立即回兵救援的決定。當盧接到蔣的書信後，知道這是蔣氏集團施行的穩軍之策與緩兵之計，但麵對省主席寶座的誘惑以及中央軍在旁側虎視眈眈的局麵，盧漢左右為難，舉棋不定，隻有以“沉著、冷靜，言談謹慎”的態度靜觀其變，暗中做著下一步的打算。
被圍困在五華山的龍雲仍在深宅大院中，心懷僥幸地等待援軍前來“勤王”，杜聿明派人進山勸龍雲放棄抵抗，立即下山乘機飛往重慶就職，蔣介石也拍發電報催龍速去重慶，但對方仍置之不理，雙方陷入僵局。蔣介石怕夜長夢多，急派何應欽飛昆勸龍雲從速赴渝，何氏抵達昆明後，龍雲拒絕其上五華山相見。無奈中，蔣介石隻好改派龍雲的好友、時任中國銀行昆明分行行長王振芳，從重慶飛昆再次勸說對方認清形勢，速下山飛渝，以免節外生枝，喪命於亂槍之下。龍雲見大勢已去，隻好表示必須由行政院院長宋子文親自來昆明，保證他的人身安全，才可去重慶受命。王振芳立即飛回重慶向蔣介石稟報。