趙高：“陛下何出此言？”
二世說：“朕閑暇時丞相不來奏事，偏挑朕與後妃行樂時他來，不是欺朕年少，又是如何？”
趙高趁機道：“丞相老謀深算，他作此舉，必有所圖。”
二世問：“他已官居丞相，位極人臣，還有何所圖？”
趙高分析道：“當初沙丘密謀，丞相參予其中，陛下曾麵允丞相，事成必有厚賞，今陛下執朝二載，尚未給丞相加官進爵，丞相豈能忘懷？他必是想裂土稱王，以此來提醒陛下。”
二世聞之怒曰：“李斯老匹夫，欲謀反乎？”
趙高再進言曰：“陛下提及謀反，老臣忽然想起一事，丞相長子李由為三川郡守，其與反賊陳勝同為楚地人，縣邑相鄰，外間傳聞陳勝率軍至三川城下，李由非但不出擊還以錢糧資助，方使反賊日趨強大，禍亂天下。”
二世疑慮：“有此等事？”
趙高說：“有，老臣還聽聞，丞相也與反賊有書信往來。”
二世道：“既如此，該徹查李斯父子通敵之罪。”
趙高道：“丞相在外，權高於陛下，若想徹查，須陛下將其召往宮中，以防其變。”
二世聽從趙高之言，派人赴三川郡調查李由，準備從李由身上打開缺口，一舉扳倒李斯。
李斯作為秦國丞相，黨羽甚多，就連二世身邊也不乏有他的眼線。所以二世調查李由的指令剛剛發出，李斯就發覺了趙高的計謀，立即上書給二世皇帝，說：“趙高專權，可比陛下，乃是當今田常，居心叵測，望陛下早日鋤之，以防後患。”二世看後，駁斥李斯曰：“趙高為朕老師，與朕相交十餘年，一向廉潔奉公、清心寡欲，乃至駕車不用僮仆，哪似丞相前呼後擁、奢侈鋪張，朕不信此廉潔之人，還當信誰？”李斯無語。
公元前208年，秦二世二年，天下義軍越來越多，朝廷發往關東平亂的軍隊一批接一批，丞相李斯、馮去疾、禦史馮劫聯名上書秦二世，請求停建阿房宮，釋放民夫回鄉耕田。
二世看到書表，大怒，謂趙高言：“阿房宮乃是先帝所造，此三個老匹夫當年不勸先帝，如今倒來勸朕，是陷朕於不忠不孝乎？”
趙高道：“然，此三人倚仗先帝倚重，欺淩陛下，已不是一日兩日矣。”
二世憤然：“朕乃萬乘之君，焉能受製於三個匹夫？趙卿傳朕口諭，速將此三人下獄，若有異端，定斬不赦。”
趙高：“喏。”
趙高按照二世旨意，把李斯、馮劫、馮去疾三人抓入獄中，分別審理。趙高先問馮劫、馮去疾之罪，二馮言：“吾等勸諫陛下，乃是盡人臣之責，何罪之有？”
趙高道：“二位大人官居高位，把持朝政多年，焉能一罪不犯？非逼本官對二位用刑乎？”