木葉指揮營帳中，大蛇丸聽聞自來也的警告之言，雖然臉色未變，仍是一副邪笑的樣子，但是卻不自覺地釋放出了自身的殺氣。
整個營帳之內頓時變得陰森森的，除了三代火影的四名弟子之外，其他人的臉色也變得凝重起來。由於在場之人都是火影一係這個圈子裏的核心層，所以他們對大蛇丸的研究愛好也有所耳聞，再加上這位的陰沉氣質與怪異性格，眾人難免對他的研究實驗產生種種不好的猜測。可是他們也知道這種研究各大忍村都有人在偷偷進行，有的甚至就是由忍村在背後支持或者幹脆就是忍村高層專門成立的部門。據他們所知，由所團藏領導的根部就在暗中專門成立了一個人體研究部門。以大蛇丸的身份地位，隻要他不對自己人下手，又沒有留下證據，大家都會裝作不知道。
其實在原著中，大蛇丸在木葉村內修建實驗基地又做了那麼多年的實驗研究，一定會惹人猜疑，要說三代對這些毫不知情那就是個笑話了。而且大蛇丸還有加入根部與團藏合作的經曆，沒有三代允許也是不可能的。所以我們可以從中推斷，大蛇丸的研究是得到木葉高的默許的！
隻不過大家都沒想到大蛇丸居然會對村子裏的忍者下手，這就觸犯到了木葉高層的底線！而團藏則更是趁機刻意將此事四處宣揚，想要借此打擊火影一係的聲望，好讓自己上位！為了大局著想三代才不得不忍痛放棄了自己的得意弟子，但也沒有痛下殺手，也許是因為心懷愧疚的原因，他隻是將大蛇丸趕出了木葉並將他定為s級叛忍。
而自來也更是因為大蛇丸出走這件事對木葉的政治充滿了厭惡，所以在四代死後他才堅決不當火影，而是選擇自我放逐，放棄一切權力與地位離開了木葉，這也是他對猿飛日斬的一種報複吧?既然老頭子你這麼熱衷於權力與地位那就繼續當你的火影陪那些惡心的政客玩好了，我就恕不奉陪了。
三忍相繼出走之後，木葉村內火影一係的影響力大損，本來毫無翻身餘地的團藏又有崛起的機會。而一個陰謀事件的最大受益者往往就是策劃者，所以可以推測出大蛇丸叛逃事件很可能是團藏一手造成的！以大蛇丸的智商他不可能意識不到這點，可是他仍然與團藏合作，事後也沒有找他報複！因為從始自終大蛇丸都沒有信任過團藏，他們隻是互相利用而已，更談不上出賣與背叛。大蛇丸真正在意的是猿飛日斬的態度。其實按正常思維來看這件事情猿飛日斬也是受害者，大蛇丸應該去找團藏才對，可是大蛇丸的性格與思維與常人不同，他更加在意“基伴”給自己帶來的精神傷害。
在大蛇丸看來他所做的一切都是在三代的引導下完成的！而且當時的他確實還保有人類的感情，所以他將三代的行為視為一種背叛與傷害！