覺明駕駛著隱形飛船停留在耀斑級星艦的背部位置，然而要潛入這星艦也並非易事，因為，身處這星艦密集的星港重地，他們是絕不能暴露隱形飛船目標的，因為暴露就意味著被消滅。所以，這也就排除了使用飛船武器的可能性。
其實覺明也曾從崇明帝國的軍事資料中了解過，這種納野星人的生物係星艦，其實是一種矽基生命體，也就是他們之前見到的吞雲鯨，星艦的外表層是一層厚厚的晶體狀物質，十分堅硬。要想突破這層外殼，也隻有動用機甲的熾紅巨劍了才能做到了。
為了不鬧出大的動靜，覺明隻得讓莫夜先呆在隱形飛船裏，而自己卻喚出了機甲，隨即來到艦體背部一個相對隱蔽位置上，並開啟了機甲巨劍的聚能模式，當巨劍達到火紅狀態時，覺明將劍奮力刺入了艦體中，隨著劍體遊動，很快便在星艦背部開了一個直徑約4米的圓洞。
可就在覺明準備與莫夜一同潛入艦體內時，一隊翼龍飛船卻出現在了他們的上空。覺明猜測這定是這生物係星艦的痛覺神經傳遞了被侵入的信息，所以他們才能做出如此及時的反應。但翼龍級飛船的到來，並沒能阻止他們的潛入。
覺明與莫夜以極其敏捷的速度進入了星艦艦體內，此時，翼龍級飛船對於已經潛入星艦的覺明和莫夜也是無可耐何了，因為他們不可能對星艦開火，且以翼龍飛船的大小，也無法對他們進行追擊。不過覺明和莫夜也絕不敢掉以輕心，因為兩人雖然成功潛入，但同時也暴露了自己的目標。他們也並不知道這星艦的指揮官接下來將會給他們製造些什麼麻煩。
當覺明和莫夜進入到這生物係星艦內時，幾乎被眼前的景像驚得目瞪口呆，因為這與崇明帝國的星艦內部結構可謂大相徑庭，就像到了另一個世界。星艦內密密麻麻地分布著許多白色的8麵體的格室，格室與格室之間又由直徑約3米的圓型通道連接，這種結構十分類似於蜂巢的蜂房，隻是結構更複雜一些，似乎每一個格室都曾經孕育了一種生物的原始胚胎。
更讓覺明感到奇怪的是，這耀斑級星艦的內部根本看不到任務功能結構，沒有操縱台，沒有武器操作係統，沒有星圖儀，沒有生命探測儀，總之一切功能的結構都不存在。但實際上，這種生物係星艦與崇明帝國係列的星艦幾乎具備了同樣的功能。
也就是說，他具備這些功能，但看不出負責這些功能的設備，這就是這種生物係星艦的奇特之處了，覺明猜測，這種生物星艦的功能結構是集成在生物體體內的，他們的運行則是通過神經傳輸來傳達指令。
此時，覺明與莫夜在格室與格室之間穿行著，他們試圖盡快找到荒智雨的位置，但這些格室與圓通道組成的網絡就像謎宮一般，就算你知道了大概位置，但沿著這些通道找過去，卻是比登天還難。
此時，覺明手上的量子跟蹤探儀上的紅點閃爍著，這證明荒智雨目前還在這艘耀斑級星艦上，且儀器上代表荒智雨的紅點正以緩慢的速度移動著，這也就證明荒智雨暫時還是自由的，活蹦亂跳的，這個情況，也讓覺明稍稍舒了口氣。
當覺明在探測儀上確定了荒智雨的大致位置，兩人便朝著那個方位艱難的尋找起來。在這格室的謎宮裏，要找到一個微不足道的生命體，其難度簡直可比大海撈針，但覺明和莫夜都沒有放棄的意思。
每一個8麵體格室，都同時與其他8個8麵體格室相通，所以，每通過一個格室，你都有8個選擇，這樣的組合排列，幾乎達到了天文級的數量級。可想而知覺明他們要成功找到荒智雨的難度了。
其實覺明並不知道的是這些所謂的格室其實是生物係星艦的骨骼內結構。骨質比較疏鬆，質量也輕，這正是吞雲可以在納雲星大氣層中飛翔的原因之一。
自覺明他們潛入耀斑級星艦，已經約有十分鍾時間，星艦方麵暫且沒有對他們的入侵做出有效的反應。然而覺明心中很清楚，這種級別的星艦，不可能沒有自防禦係統，也不可能對入侵者束手無策，也許此時正有一個巨大的危機等待著他們。所以盡快找到荒智雨，這才是當務之急。
但現實情況是，覺明與莫夜在無盡的格室謎宮裏漸漸迷失了方向，並來是朝著荒智雨的方位前進，實際效果卻是南轅背轍，越走越遠。這是由8麵體的結構定的，隻要選錯一個通道，其結果就有可以差之千裏。眼見著時間一分一秒的過去，覺明也著急了起來。