三更燈火五更雞，正是男兒讀書時。黑發不知勤學早，白首方悔讀書遲。
孫思邈在行醫之餘，分析藥性，收集藥方，他非常重視學習別人的長處和民間經驗。在他苑員歲時（遠緣圓），《備急千金要方》一書問世。全書共猿園卷，圓猿圓 門，方論緣猿園園 餘首，記載了願園園多種藥物的藥性及功效。
孫思邈從苑員歲（遠緣圓）到整整員園園歲（遠願員）時，他在洪洞縣又把這 猿園年治病時所積累的經驗，編著成第二部醫書《千金翼方》，為《備急千金要方》作了補充。除了這兩部醫學專著外，還著有《攝生論》、《福壽論》、《保生銘》、《存神煉氣銘》、《攝養枕中方》、《老子莊子注》、《會三教論》等書。
孫思邈在行醫道德品質方麵，也是傑出的典範。他經常教導跟隨他學醫的徒弟們，做一名醫生，一定要有高尚的人格、刻苦鑽研精神和強烈的責任感。他常對人說：醫生應把病人看成是自己的父兄，對待病人不應“瞻前顧後，自慮吉凶”。他在治病中，不計較“晝夜寒暑，饑渴疲勞”，就是對那些患“瘡痍下痢，臭穢不可瞻視，人所惡見”的病人，也不嫌其髒，總是耐心治療。他在編著《備急千金要方》一書中，首次提出了“大醫精誠”論，其中“精”指醫技，“誠”指醫德。
凡大醫治病，必當安神定誌，無欲無求，先發大慈惻隱之心，誓願普救含靈之苦……
孫思邈政治上不慕名利，史書稱他曾有三次辭官不做。第一次是在隋文帝時期，他“稱疾不起”；第二次是在唐太宗時期，他又“固辭不受”；第三次是唐高宗召見了他，要拜他做諫議大夫，他還是謝絕了。他在學術上多才多藝，知識淵博，唐朝初年知名之士不少都曾對他“執師資之禮”，名醫孟詵和詩壇中唐初四傑之一的盧照鄰都曾拜在其門下。
孫思邈醫學經驗豐富，又虛心好學，所以他在醫藥學方麵取得了多方麵的成就。他一生足跡遍及天下名山，實地考查，采集藥材，積累了豐富的采藥和製藥經驗。他還首創了“複方”這一我國醫藥史上的重大革新。孫思邈在《千金要方》和續作《千金翼方》裏，列舉了幾百種藥材，並告訴人們采集的季節和藥效。
孫思邈是我國婦科和兒科的首創者。《千金方》“始婦人而次嬰孺”，他分析了女性和男性、小兒和成人在生理上的不同，指出婦產病和小兒病的特點，認為三者應當單獨立科。在他的影響下，唐代醫學家王燾在《外台秘要》中特為“婦人”、“小兒”立專章，宋代時更出現了婦產科和小兒科的專著《婦人大全良方》、《小兒藥證直訣》。
孫思邈對針灸學也有重大貢獻。他在前人的基礎上，重作了《明堂針灸圖》，繪製了三幅大型彩色針灸掛圖，分別把人體正麵、背麵和側麵的二十經脈用五色繪出，把七經八脈用綠色繪出。孫思邈主張針灸和藥物綜合治療，“知針知藥，固是良醫”。從此，我國醫學提高到一個新的高度。
孫思邈受到後人深深的尊敬，在他的故鄉———陝西省耀縣孫家塬，為他建立了祠堂，把他曾經隱居過的山叫做“藥王山”，山上建有藥王廟，廟中有他居住過的石洞———太玄洞和他的塑像。太玄洞旁還有宋代刻的八塊大石碑，刻著他的《千金要方》的一部分內容。
由於他對祖國醫學的貢獻，人們一直以各種方式紀念他。凡是他留下足跡的地方，人們紛紛建起藥王廟來紀念這位藥聖。明清時期河南靠懷藥貿易起家的懷幫，從一開始就認識到藥王孫思邈是他們的無形資產，他們均敬奉藥王孫思邈，在懷藥的經營過程中，懷商紛紛建立藥王廟，以祈求藥王的保佑，並舉行藥材交易大會，積極發展懷藥經濟。