第五章
陳雲林表示，由於眾所周之的原因，兩隻熊貓來台時間被延宕數年，“今天終於可以宣布，在履行完相關手續後，兩隻熊貓將落戶台北市木柵動物園。”
台北市立動物園園長葉傑生表示，據其所知，當時“團團”、“圓圓”在四川已分開進行檢疫。他希望兩隻熊貓在12月中旬之前來台，並經過在台一個月的檢疫期之後，爭取在春節前後與台灣民眾見麵。
葉傑生表示，當前動物園各項軟硬件設施都已準備好，台灣方麵飼養人員亦已於兩周前趕赴四川，提前熟悉情況。
受四川汶川17萬羌族民眾委托，陳雲林同時宣布，將送給台灣同胞17株珙桐樹苗。珙桐樹俗稱為“綠色熊貓”、“植物活化石”，是曆經億萬年時間洗禮的珍貴孑遺植物。
珙桐樹又稱“鴿子樹”。每年四、五月間，山風吹來，好似一隻隻白鴿振翅欲飛，一樹璀璨，蘊藏和平與友好、歡樂和吉祥之意。羌族同胞希望，把珙桐樹同災區民眾感恩的心，一起種植在台灣的土地上，讓其枝繁葉茂。
台灣同胞相贈大陸同胞的長鬃山羊和梅花鹿，都是台灣特有亞種。沒有山羊胡子的長鬃山羊具有良好的平衡性，可在岩壁陡坡間行走自如。
而梅花鹿鹿角形狀酷似台北的“北”。有消息稱，長鬃山羊將取名為“長長”、“久久”，梅花鹿則命名為“富富”、“貴貴”。
當晚，海協會在圓山飯店舉行答謝宴，海協會會長陳雲林致詞時表示，兩岸關係未來應該怎麼走，和平發展是曆史的正確方向，也是人民的必然選擇。
陳雲林說：
短短4天，他的心情可以“欣慰、憧憬、感謝”6字概括。陳雲林表示，這次兩會首次在台北舉行會談，簽署4項協議，實現兩岸渴望了年的通郵、通商、通航，令他感到欣慰；看了電影《海角七號》，也讓他對台灣南部的風土人情懷有無比憧憬；對於大量警察和維安人員這幾天來的保護高度感謝。
陳雲林說，台灣百年滄桑史，因不同的曆史遭遇，台灣人對兩岸關係各有不同看法，“做同樣的事情，在你們這裏要比我們那裏更困難。”陳雲林說，若大家秉持誠意與耐心，以協商化解分歧、以協作代替對抗，“未來和平發展的道路將愈走愈寬廣”。
針對民進黨前晚的抗議行動，導致許多警察與記者受傷，陳雲林說：“人心都是肉長的，警察受傷，想必家屬也很心疼。”陳雲林表示，他要對維安警力及家屬致上敬意與感謝。陳雲林一行搭機離台返京
2008年11月7日上午，海協會會長陳雲林一行搭機離台返京。
8時10分左右，海基會在圓山飯店大廳為海協代表團舉行簡單隆重的歡送儀式。
在會上，海基會董事長江丙坤致詞表示，這次兩會台北協商的成果豐碩，新出爐的台灣媒體民調也都給予高度肯定。
江丙坤說：
我要在這裏說珍重再見，5天4夜的時間相當短促，也非常緊張，但成果非常美滿豐碩，簽署了4項協議、也辦了兩場攸關兩岸未來發展的座談，共謀麵對國際金融情勢，相互提供意見。
談到陳雲林此行訪台的安排，江丙坤說：
陳會長有機會看看台灣經濟成長的奇跡，也就是科學園區，當然也看到台灣另一麵，包括農家等風土，更有機會欣賞《海角七號》。
江丙坤說：
我相信，我們站在這裏，心情是感覺成果很滿意，因為今天某些媒體已經作了民調，一家媒體說，這次會談52%是滿意的，另外一家媒體說56%是肯定的，也就是說我們的努力沒有白費，因為這攸關兩岸人民的福祉，我們會繼續努力，終極目標：“兩岸和平，經濟雙贏”。