楊凡、夜風、雪兒、楊詩筠四人乘著飛舟，終於在數百年後重新回到了天元大陸。
首先，楊凡、夜風兩邊分頭行事。楊凡帶著徒弟去陰鬼教報仇，夜風則是帶著雪兒回到禦獸宗，找他的師叔金風陽算帳。
重新回到陰鬼教裏，卻發現這裏麵目全非，當年的金丹長老由於時間的原因都已經損落，就連楊凡的師傅靈鬼上人都兵解輪回。
三峰的新長老驀然見到了一個元嬰期老怪，都大感吃驚，全都恭敬異常，將這些年發生的事情和盤托出。
楊凡感到時間才是修仙者最大的敵人，帶著楊詩筠來到鬼海，把這裏的凶魂厲魂收入萬鬼幡中。又將自己煉出的一枚滅靈丹交給了鬼王峰的老祖。要說這個老祖也是楊凡相識之人，正是當年幫助楊凡入教的兩人之一朱易簡。
這樣一來，也結束了與陰鬼教的瓜葛，帶著徒弟離開了陰鬼教。
路上，與夜風等人在翠竹穀相遇，他們都想要找秦靈兒，想看看當年的那個知己好友還在不在世。
意外之下偶遇張楚楚，此時的張楚楚已經是金丹期修士，她見到楊凡的時候也非常驚奇，告訴他們秦靈兒被魔族的人帶到了黃風穀裏，黃風穀的實力太過強大，有兩名元嬰期修士在裏麵，已經成為了天元大陸上最強大的所在。
一行五人到了黃風穀裏，大戰一番，卻沒有發現秦靈兒的下落，逼問之下被告之秦靈兒被魔族的聖女帶到了魔界裏麵。
楊凡讓夜風、雪兒、楊詩筠等人回去虛空群島，自己和張楚楚隻身前往魔界救秦靈兒。
來到魔界之後，打聽了魔族王宮的下落，兩人便一起來到了魔宮。
但令楊凡萬萬沒有想到的是，魔族的聖女竟然就是秦靈兒，張楚楚也是魔族之人。
整件事情都是一個巨大的陰謀和陷井，秦靈兒前世在百年的閉關中沒有能達到元嬰期，意外損落輪回，記憶也變成空白，轉世成為了秦靈兒，天元大陸中的聖女不過隻是一個幌子。
在秦靈兒成功結出金丹的那一刻，被張家老祖帶到了黃風穀，融合了她生前的一縷魔魂，得到了前世的記憶。
楊凡暴怒之下無處發泄，魔族也到了生死邊緣，秦靈兒請求他救上魔族的未來，隻要在靈族的手上幫助魔族渡過難關，可以幫他用魔氣貫體之法達到化神期的境界。
秦靈兒的苦苦哀求，還有柳媚兒的傷勢，化神期境界的誘惑，讓楊凡先與對方虛如委蛇，答應了秦靈兒的要求。
楊凡與分身兩人進入魔族的秘境，接受了龐大的魔氣貫體，兩人在崩潰的邊緣雙雙達到了化神期的境界。
但令楊凡沒有料到的是，根本沒有什麼靈族的進攻，這些全是秦靈兒捏造的謊言。
魔神的力量和傳承重新回到了魔靈的體內，就連他前世的記憶也因此被秦靈兒貫入其軀。
魔神恢複力量之後，第一件事情就是要殺死楊凡。但那狂暴的一擊，卻被秦靈兒攔下。
秦靈兒麵帶微笑的躺在楊凡懷裏，撫摸著他的臉說了聲對不起，又告訴他自己愛他的心從未變過，當初的約定至到臨死的這一刻還深深映在腦海裏，她結為金丹的時候，也是她這一生最開心的時候，因為可以永遠和楊凡在一起。但是魔族的使命沒有完成，她的代價就是用自己的生命來懺悔。
秦靈兒臨死前最後的請求，就是讓楊凡帶著他回到天元大陸，回到沐陽城裏的那個小店，因為那裏有著她一生之中最美好的回憶。
秦靈兒死了，死在了楊凡的懷裏。
魔神恢複了記憶，大為高興，但他不知道黃泉幡和楊凡的秘密，記憶隻停留在了出征前的時候。
楊凡懷裏抱著秦靈兒，望著魔神久久無語。
魔神手持黃泉幡，大聲說是天地至寶，將龐大的魔氣湧入幡中，沌機神獸的封印被打破，在魔氣的衝刷之下沌機神獸恢複了自由。
楊凡笑著對魔神說這裏的一切就交給你了，我已經很累了，要走了。
於是，楊凡使用秦靈兒給他的傳送玉碟，離開了魔界，離開了魔宮。
在身影消失的時候，回頭看了一眼，那強大到無可匹敵的沌機神獸在放出無數的重鎧大軍吞噬著周圍的人群，魔神空有一身能耐卻無法施展，沌機神獸用飽含殺意的眼神望了一眼魔神，口吐人言說要吞了對方，神獸之威不允許由凡人踐踏。
楊凡先是回到虛空群島解開了柳媚兒的元神禁錮，又帶著秦靈兒的身軀回到了沐陽城，重新租下了那個小店，也將店名換成了當年的“靈丹閣”。
二十年之後，一個古靈精怪的少女來到店中，問楊凡收不收黃龍散，這是她自己煉製的黃龍散，還有不少的丹方。
楊凡見到這個少女之後便笑了，笑聲整個沐陽城都可以聽得到，這個少女無論是長相還是氣質都與他當年在散修坊市遇到的秦靈兒一模一樣。
全劇終。