南京城外一時大軍齊集，營帳連天，戰旗飄飄。楊秀清得知韋昌輝死了，陳玉誠與李秀成降了。放眼天下就隻餘他楊秀清一支太平軍還在死守著一座孤城，頓時心慌起來，著心腹時時巡防於城頭，防止有心懷不軌的將領與城外清軍私通。一麵收集城中糧草物資屯積備戰。
一時之間南京這座江南繁華無比的大都市人心惶惶，百姓哭聲日夜不息。楊秀清將城中糧食都搶了來，又不許百姓出城逃走，日夜都派兵將巡防城內，發現有私下逃走的百姓一律處死。
幾日之間殺人盈百，被殺百姓的屍體甚至都沒有人掩埋，爆露野外。而楊秀清自己則每日在天王府中與愛妃美妾醉生夢死，全然不知道南京城裏怎麼樣一副人間地獄的情形。
清軍每日隻是在城外布陣挖溝，一副根本沒心思攻打南京的樣子。卻每日都將寫有勸降，或勸百姓逃走的紙條射入城中。言及官兵馬上就要破城了，勸老百姓趕快離開。
百姓惶惶不安，每日都有有偷偷越城牆而去，就連士兵也有悄悄溜走的。楊秀清知道了大驚失色，連忙命心腹接管城防，凡有越城而逃著，一律格殺無論。如此一舉更讓楊秀失卻民心，軍心更是不穩。楊秀清殺天王洪秀本就沒有多少支持者，全靠武力支撐著。如今天國覆滅在即，誰不想給自己留條後路。許多天軍將領密秘商議，私下裏遣人與清軍談叛。楊秀清，軍心民心幾乎盡失，卻不自知仍自在天王府花天酒地，幻想天下一統的美夢。
南京被圍之時，石達開正在廣西大山之中與廣西清軍遊擊戰。由於廣西是天軍發源地，民眾基礎很好，地形又險要。清軍根本無法捉摸到石達開的足跡，加上又有百姓自願為天軍報信。石達開不但未因此而損失實力，而且借著天軍聲勢將原本隻餘三萬餘的部隊瞬間擴充至十萬餘人。
得天揚州，九江被破，南京被圍，清軍重兵雲集南京的消息之後，石達開也開始醞釀著自己的出路了。他知道現在是他最後的機會，借著清軍主力全部集中在了南京對付楊秀清，廣西周邊並無多少清軍的兵力，現在是石達開進入四川，借四川以為根本的唯一機會。
若等到南京也被破，清軍大軍南向，石達開想要衝出廣西都難了。於是石達開於鹹豐五年九月開始準備著戰前事宜。著部下四處收購糧草，可是廣西貧困已久，任是他怎麼收購，也所有有限。這也是石達開非要衝出廣西立足四川的根本原因之一。
九中旬，石達開率部十萬，出廣西發動了寶慶彙戰，豈圖先占寶慶，摒除後顧之憂，再以重兵力，輕裝北上再入湖北，由湖北入川。可是他沒有想到的是，並不是清軍沒有兵力入廣西剿滅他，而是廣西大山實在太大，清軍根本沒有辦法抓住他的蹤跡，老對頭曾國藩其實就等老石自投羅網，在寶慶四邊布下重重包圍，借勢一股作氣，殲石達開於城下。
而且，駐守兩廣的左宗棠也早已得到鹹豐的命令，石達開不出廣西則左宗棠不入廣西，若石達開出廣西，則左宗棠速尾隨其實，斷其退路，務必使石達開進退無路，乖乖就範。左宗棠先自有些奇怪為什麼皇上這麼肯定石達開會好好的根據地不呆，非要去四川？四川好是好，可惜如今先機已失，若是他自己，左宗棠打死也不會出廣西，乖乖呆在廣西根清軍打遊擊，慢慢發展勢力。
當石達開率部十萬浩浩蕩蕩自桂林出發，沿湘黔邊界殺往寶慶的時候，一直守在石達開屁股後麵遲遲未動的左宗棠立馬揮軍入廣西，以迅雷不及掩耳之勢瞬間攻下石達開在廣西的根本重地桂林，以及慶遠，並尾隨敗軍之後，將石達開入廣西的路全部封死。
而曾國藩則命令湘軍全部快速散於寶慶各地，等候石達開的到來。曾國藩千辛萬苦一路如吊死鬼一樣的追著石達開不放，一方麵是為了屢敗於石達開之下的仇，他心有不服，一方麵是因為鹹豐的一道要活的石達開，不要死的石達開，讓曾國藩心領神會的知道滅發賊的重點不在南京，而在石達開身上。