EAP在中國的發展才十多年的時間，因此在理論和實踐積累方麵都還不足。而且，由於中西方文化傳統和社會經濟現實的差異，注定了EAP在中國的發展道路上必定麵臨很多挑戰，譬如適應本地國情、文化和人群的特征等。目前，我國EAP服務模式主要麵臨以下四個方麵的困難和挑戰。
建立中國化的EAP標準的問題
EAP是一項有高度、有廣度的工作，要想取得較大發展，就需要一個有一定視野和凝聚力的權威機構，培養一支具有相當實力的科研隊伍，根據中國的國情建立適應中國社會現實的EAP標準。
要想建立這個標準，首當其衝的當然是必須將EAP本土化，要對中國本土的文化和社會進行研究。目前我們在這方麵做得還很不夠：一方麵體現在我們對本土的文化和社會研究的欠缺上；另一方麵則是我們現在所使用的心理學研究方法，包括谘詢的研究方法大都是照搬西方的，而沒有創造出符合本土文化的一套標準。如果沒有針對性的研究，中國的EAP發展就很容易陷入盲人摸象的窘境，難以得到健康的發展。“不以規矩，不能成方圓”，我們必須根據自己的國情和文化特點，建立我們自己的規矩，畫好自己的方圓。隻有建立起適應中國社會現實的EAP標準，才能夠使這一外來工作方式有效地服務於我們的企事業發展，服務於我們整體的社會進步。
中國人對“心理”的敏感與防衛
EAP項目的成功實施，必須建立在EAP服務機構、企業以及員工三方之間互相信任、通力配合的基礎上，但是，在中國做到這一點卻很難。一方麵，中國人十分注重個人在精神層麵上的隱私，他們對心理服務有一種與生俱來的抵觸，很多人不承認自己有心理方麵的問題；另一方麵，他們會把心理問題想成一種不能公之於眾、難以啟齒的病，誰如果有心理問題，可能就要遭到周圍人的另眼相待。其實在國外，去心理診所解決心理問題是十分普遍的事情，西方人習慣於每周去教堂做禮拜，遇到問題向神父懺悔，這其實也是一種心理服務。而在中國，大家對內心深處的問題退避三舍，很多人選擇回避。
中國人不願意正視心理問題的這一特點，使得他們在麵對心理谘詢的時候，不願意敞開心扉。他們會隱藏內心的想法，在多次谘詢之後，也不願意暴露自己真實的內心。再加上國內企業的勞資關係較為對立，員工對企業的信任度有限，而員工接受這種服務，則意味著將個人隱私對心理谘詢師或者員工關係專員和盤托出。一旦員工懷疑谘詢師不能真正做到中立，確實保障員工的隱私，受製於項目費用支付方，就會極大地影響員工使用這類服務，最終導致項目的失敗。除了員工本身的防備心理，我國很多企業對於員工的心理關注意識也很淡薄，認為員工的心理問題屬於個人問題，與企業無關，企業沒有必要去重視。尤其是在一些民營企業，更覺得投入大量財力、人力、物力，得不償失。
企業主對成本效益的評估