那是我們永生難忘的回憶。
我，我們，與數碼獸創造的回憶。
一些事情被塵封，可我們仍舊在這裏。
在仰望天空的時候，就能看到曾經的夥伴，就像它們，在抬頭仰望天空的時候，也能看到我們一樣。
我們曾是馴獸師，而現在，我們是現實世界中，普通的人類。
……
一年過去了，一年前，數碼世界再度與現實世界相連，甚至是將平行世界卷入進來。
那場戰役，數碼獸數以百萬計，強者更是數不勝數，將四聖獸，以及服務於伊古德拉希爾的皇家騎士團都卷進來，已經可以稱之為「戰爭」。
那次戰役比七年前的數碼死神還要恐怖，甚至是讓人絕望過，但在絕望之中，也燃起了希望的光芒。
點燃這希望的火光的，正是馴獸師們。
馴獸師與他們的夥伴數碼獸，拚上性命，將肆虐數碼世界的病毒，以及在這其中推波助瀾的數碼獸盡數鏟除，數碼世界與現實世界終於重新恢複平靜，這是他們第二次拯救世界。
然而，還有第三次危機，正籠罩著現實世界與數碼世界！
……
現實世界，因為進入二十一世紀之後，世界逐漸迎接和平世界，各國科技飛速發展，無論是軍事產品，亦或是民用技術，全都日新月異，汽車、電腦、網絡、服裝、飲食等等，所有技術百廢俱興。
城市之間，高樓林立，車水馬龍。
因為和平，人們得以平靜安寧的生活，雖然經曆過兩次關於數碼世界的劫難，但是對於全世界數十億人類來說，災難使得人們更加團結，挺過一次又一次的苦難。
現在，正是春季，鳥語花香的季節，同時，也是學生們畢業的日子。
高中三年級的學生們，胸前佩戴一朵櫻花，麵帶笑容，與自己的朋友們坐在學校的禮堂中，進行著一生一次的高中畢業典禮。
本應該是這樣的……
東京新宿，雖然是白天的上午九點，但是卻沒有一點陽光灑在大地上，天空似乎是被烏雲遮蓋，明明是早上卻如同深夜一樣，還好，城市中的燈光照亮了這裏，讓人們及時是在「黑夜」也可以不用迷失方向。
可是這裏的人們，已經不是迷失了方向，這麼簡單的事情了。
「快走！」
「啪！」
鞭子打在地麵上，將一塊兒磚瓦打碎，飛濺的石子劃過一個人的臉龐，使其流下一絲鮮血，恐懼的表情在這個人的臉上浮現出來。
眼前的怪物，就如同玩偶一般，可是卻足有三四米高，手中拿著鞭子，猩紅的雙目怒視著麵前的人類，口中發出嗬斥，使得他們瑟瑟發抖。
被嗬斥的人不敢多言，背著身上的重物，一步步向前走著，在他的身後，還排著一條長長的隊伍，都是和他一樣的成年男人，身強力壯，有些是坐在辦公室中的社會精英，此刻也隻能脫下精致的西服，將布滿塵土的重物背在身上，跟隨著隊伍一點一點向前走著。
在另一條街道上，幾個形態各異的「怪物」追逐著一個手中拿著一塊兒麵包和一個小塑料口袋的女人。
女人的體力不支，被「怪物」們撲倒在地，搶走了手中的麵包的塑料袋。
「求求你們！不要拿走它！我餓著沒有關係，我的兒子生了重病，不吃藥不吃飯的話，會不行的！」