這是一個精靈與人和平共處的美好世界，在圖諾地區，每一個孩子在14歲的時候都可以從自己的出生地領取一隻精靈(也稱神奇寶貝或者口袋妖怪)，成為一名精靈訓練師，但是，並不是每一個人都可以成為訓練師，由於名額有限，一個城市隻有三到五個人能成為訓練師。
訓練師顧名思義就是以訓練精靈獲得成就的人，同時訓練師裏麵還包括協調家，飼育家等等。
每個地區都會有一個精靈聯盟，每一年舉辦一屆聯盟大賽，聯盟大賽就是彙聚該地區所有的精英訓練師一起精靈對戰。勝利的那個人可以成為冠軍，獲得冠軍就可以挑戰該地區的四天王和上任四天王冠軍，從而成為真正的冠軍，而除了地區聯盟以外，還有一個世界聯盟，每五年舉辦一次世界聯盟賽，隻有獲得地區冠軍實力的人才可以參加比賽，勝利的人可以成為世界冠軍(也稱神奇寶貝大師)
除了普通的精靈，世界上還有一些神獸，也就是傳說中的精靈，它們擁有普通精靈無法達到的力量，但是它們行蹤不定，很少有人能看到他們。
故事的冒險就在圖諾地區的穀木鎮，正式展開。