自古以來妖怪便存在於世間，大部分妖怪分為數種，一種占局妖怪中大部分，即是由於人類的恐懼與信仰而形成的妖怪，這類妖怪在古代，因為人類的敬畏之心，大部分實力都不弱，甚至有許多憑借人類強烈的敬畏感情進化成了神明的存在，而另一部分極凶極惡的妖怪則成為了絕對的力之妖，就算是神明也須敬畏三分。
一種則是根源之妖，因為世界的本源而形成的生靈，其中大部分可以被稱之為真正的神明，都擁有強大的力量。
還有一種則是由人類轉化成的妖，以及由各類生物借由機緣巧合突破原本的極限而轉化成了新生的妖，這類妖實力大小不一，屬於特殊類，類似吸血鬼，魔法使，各類草木、動物化作的精靈與妖獸，這其中某些機緣奇特的妖，甚至可以成為最強的存在。
古時，群魔亂舞，大地上存在無數的妖怪，人類在妖怪的夾縫中生存，淪為妖怪的工具，而這時，也許是人類生來便是上天所眷顧的種族，人類從神明與其他強大的存在手中漸漸學會了力量，陰陽術，魔法，靈力，無數強大的人類得以出現，與群妖分庭抗拒。
無數時光輾轉而逝，漸漸的科技出現了，人類的敬畏之心慢慢的消失，大部分依憑而生的妖怪力量皆消失的幾近無存。許多神明也一一因為沒有人類的信仰從而導致力量的消失，神體的消散。
但是這對於一些立於妖怪這一定義的最高神明們，類似上帝、天照之類是毫無影響，而這種神明大部分都是無視人間是非的。而剩下的特殊妖怪，強大的漠不關心，弱小的更是無能為力。
在這過渡的數百年裏，由人類的敬畏之心而產生的妖怪在自身力量消失與人類的絞殺麵前大部分皆成為了曆史的塵埃。
但是那些獨善其身的妖怪也沒有想到，人類之後會將鋒矛指向它們，許多弱小的精靈乃至神明被那些強大的人類所消滅。
極東之國中有一處遠離人裏的邊境之地一直是數量眾多的妖怪居住之所，因為有許多精靈的存在，被稱為幻想鄉。
隨著時間過去，人類數量因文明發展起來而劇增。到了500年前，在極東之地被稱為妖怪大賢者的根源之妖---境界妖怪“八雲紫”出現了
它擔心人類再增長下去的話會導致幻想鄉的平衡崩壞，於是建立“虛幻與現實的境界”，招引外界的妖怪前來幻想鄉，使得妖怪的勢力獲得了平衡。
到了明治時代，近代文明發展起來，將非科學的事象稱為“迷信”並加以排斥，於是幻想鄉內的妖怪賢者與絕世天才博麗巫女一起建立了強大的結界----博麗大結界。結界徹底將幻想鄉與外界隔離了開來。
從此以後，幻想鄉的各種事物就在現實中人們的記憶中消逝而去了。
而存在於幻想鄉中的妖怪並不會同外界的妖怪一樣力量消散，反而會更加強大。
後來，也有好多日本以外的妖怪因為勢力的消失而移民進來。境界的效果現在也在持續著。
在幻想鄉獨特的隔離環境下，妖怪們建立了一個異於外麵世界的文明。那不是唯物文明，而是比人類世界更久遠、更優秀的以精神為中心的文明。充斥著無數非常識的夢幻之地。
故此地亦被稱為---“眾神眷戀的幻想鄉”......