飛雲回到木葉已經有十幾天的時間了，而他的內傷早已在回到木葉的第二天便痊愈了。這讓木葉醫院的醫生們大為驚異。因為在根據他們的診斷，結合過往病例的恢複時間，他們推斷，飛雲至少要在一個月後才可以完全康複。這件事兒也驚動了三代，三代雖然也感到很是驚訝，但畢竟是大人物不是，比這還要不可思議的事情見得多了，所以也沒覺得有什麼不對的。因此，飛雲在住院的第二天早晨便出院了，而他也隻是在木葉醫院裏睡了一晚而已。至於內傷的原因，這就說來話長了。總之，他是在君麻呂出去找尋食物不在他身旁時，碰到了一個氣息極為詭異的強大男人，奇怪的是那男人將他擊成重傷後沒有取了他的性命便自行離開了…
而和飛雲一起回來的君麻呂，也已經被三代安排好了住處。不知為何，三代對飛雲似乎有著一種莫名的信任。就拿飛雲將君麻呂領回木葉的這件事情來說吧。雖然長老團們在這件事情上不停的在給三代施壓，但是三代在這件事情上卻是沒有像往常一般做出讓步，甚至沒有給長老團留下一絲的商量餘地。
自從回到木葉後，飛雲便沒有再跟隨第七班一起做任務了。原因不是因為厭倦了，也不是因為不想，而是因為他還有很重要的事情要做。自從被大蛇丸擊敗後，他已經深刻的意識到了自身的不足，所以他這十幾天，他在夜以繼日的瘋狂的苦修，就連君麻呂的事情也顧之不得了。這期間春野櫻他們來看過飛雲幾次，無非就是讓飛雲快些回到隊伍中來。而君麻呂也來找過他，從他的語氣中，不難聽出他對現在在木葉的生活很是滿意。而不知為何，在飛雲不跟隨第七班一起做任務這件事情上，卡卡西竟然沒有絲毫的難為飛雲，而三代也沒有說些什麼。似乎是覺得也許飛雲的實力已經早已不適合在這個班待著，或者說是不適合屈尊於下忍的隊伍了吧。隻是現在沒有一個合適的機會和緣由，不然興許飛雲早已被三代提拔為木葉上忍了吧。
這天，飛雲正在修煉場兀自苦修。
“出來！”正在修煉中的飛雲突然出聲道。
“嘿嘿。小鬼，你的實力不錯嘛。”一個臉上罩著個麵具的男子一邊說著，一邊從一旁的樹林中緩步走了出來。看打扮似乎是木葉暗部的人。木葉暗部，全稱是“暗殺戰術特殊部隊。”對於飛雲來說，這是一個有些神秘的部門。
“說！”飛雲的語氣很是生硬，絲毫不給來人一絲一毫的麵子，現在他可是在爭分奪秒的提升自己的實力啊。一秒鍾都耽擱不得，所以不願意多蹦出一個字，更別說多說一句廢話了。
“嘿嘿，別這麼不懂禮貌嗎。”來人聽出了飛雲口氣中的冷漠，有些尷尬的撓了撓頭。
見飛雲沒有再理會他，有些無趣的咳嗽了兩聲，“好吧好吧，說正事兒。三代大人讓你過去一趟。”
“嘭”的一聲，一陣煙霧過後，飛雲已經消失在了那名暗部的視野裏。原地已經沒有了飛雲的身影，有的隻是一個目光呆滯的暗部…
“三代。找我有事兒？”飛雲門兒也沒有敲，就像回到了自己的家中一般，大大咧咧的推門便走入了火影辦公室。