消失8年、如今突然重出江湖的神秘怪盜——怪盜基德，引起了喜愛魔術表演的高中生黑羽快鬥的注意，因為他父親、世界知名魔術師黑羽盜一也是8年前去世的。快鬥在陰差陽錯之下，進入到父親的密室，發現其中存放著與怪盜基德一模一樣的服裝。疑惑的快鬥決定穿上基德服裝，去今晚基德的預告現場去一探究竟……
快鬥發現以基德身份活動的人竟然是盜一生前的魔術助手寺井黃之助，他更從寺井口中得知父親黑羽盜一就是怪盜基德，以及盜一其實是遭暗殺身亡的真相……快鬥決定繼承父親的衣缽，成為第二代怪盜基德，以此引出殺父元凶，調查父親的死因。
最後怪盜基德終於知道了父親是被誰殺害的，就是一個神秘的黑衣組織，因為第一代基德（也就是黑羽盜一）不聽勸告試圖破壞黑衣組織的好事（指比黑衣組織先一步找到世界上唯一一顆可以長生不老的寶石---潘多拉），所以在一次魔術表演中遭到了黑衣組織的殺害。於是黑羽快鬥決心做第二代怪盜基德完成父親未完成的使命。
另外，知道黑羽快鬥就是怪盜基德的有如下幾個人······
寺井黃之助：曾是第一代怪盜基德黑羽盜一的手下及管家，起誓付出生命也要幫助快鬥少爺（黑羽快鬥），在怪盜基德盜取寶石的時候擔任助手來幫助怪盜基德。
小泉紅子：是一位魔法師，與天下所有魔術師為敵，因為她認為這個世界上的所有男人全部全部都是她的俘虜，但是魔法水晶球顯示隻有一個人甚至不可能成為她的俘虜，這個人就是怪盜基德（黑羽快鬥）。所以就混入了高中生之中來征服黑羽快鬥做她的俘虜。
白馬探and江戶川柯南：他們都是有名的偵探，而江戶川柯南是怪盜基德的死敵，白馬探是蜘蛛的死敵，因為知道蜘蛛的目標是怪盜基德，所以因此調查了怪盜基德的身份之後也混入了高中生，以此來消滅蜘蛛。
黑羽雨彥（作者）：黑羽快鬥的表姐，有時候會住到黑羽快鬥的家裏幫助黑羽快鬥盜取寶石，也是一位有名的魔法師，魔法水平十分高超，雖說雨彥是魔法師，但是魔法也運用的和魔術一樣厲害！因為想要幫助自己的表弟（黑羽快鬥），所以黑羽快鬥的媽媽不在家的時候會經常來看快鬥並照顧快鬥，也因此混入了高中生，位置坐在了黑羽快鬥的前麵，和塵夕同桌，塵夕比雨彥大一歲，所以做了雨彥的姐姐，也是快鬥和青子的姐姐。
中森塵夕（作者噠偶妮醬）：中森青子的姐姐，是一位非常厲害的魔術師，因為有一個偵探的頭腦，所以她不僅是魔術師，還是偵探，因為雨彥和塵夕是從小玩到大的好朋友，所以她從雨彥那裏知道了快鬥的事情之後，也從國外回到日本，聽雨彥說了做一名高中生挺好玩的，所以也成為了高中生，她有時會幫助快鬥，所以住進了青子的家裏，青子的老爸沒有回家的時候也會照顧青子，據說塵夕還是黑羽盜一的徒弟，所以魔術技能十分的高超。在班級裏位置坐在了青子的前麵，和雨彥同桌。