崇禎九年臘月，薛家軍才回到出發地庫倫城，去時的六萬人馬，回來時已經是十萬大軍，加上隨軍家屬和女俘，整整二十多萬人，真真幾乎是把薛雲搶進了王帳，兩人在王帳中成其好事，把涼在一旁的布木布泰氣得要死，好在真真已經力不從心，布木布泰還是分了一杯羹，薛雲娛樂之後就逗弄真真和布木布泰的孩子。
真真的兒子是上天賜子，已經穩穩坐上了土謝圖汗部的王座；布木布泰有了兒子，對薛雲是千依萬順，跟以前的布木布泰判若兩人，薛雲從布木布泰貪婪的眼睛中，讀到了布木布泰的野心，這才是布木布泰低眉順眼體貼入微的原因。
真真的兒子漢名薛遆，暗與帝字同音，薛雲對真真野心勃勃心裏不爽，可是聽到布木布泰給兒子取的小名竟然是“福臨”，把薛雲差點驚得暈過去，布木布泰還一個勁在解釋這名字是表示福氣降臨的意思。
薛雲還算有氣度，沒有一腳把布木布泰踢出氈毯，哎，這真是造孽啊，自己的兒子怎麼跟皇太極的兒子同名，看來自己逆天改命還是留下很多痕跡，薛雲給布木布泰的兒子取名薛魚，就是不想他成龍，禁止布木布泰再叫兒子“福臨”找個名字，布木布泰覺得夫君莫名其妙，可是她非常害怕薛雲，隻好無條件的答應了，不過薛雲對布木布泰和薛魚有深深的顧忌，一直暗暗限製這母子兩人的發展，薛魚一生平平談談的做了一世王爺，布木布泰也沒有卷起什麼浪花，成了薛雲後宮一個平凡的嬪妃。
崇禎十年正月，薛雲得到和碩特部顧實汗準備兵伐土謝圖汗部的消息，和碩特部顧實汗兵敗，逃回準噶爾之後，又以達賴五世、班禪四世贈予的“丹增卻傑”（執敬法王）稱號率和碩特部兵馬南進青海，進而占據西藏地區。
這些年顧實汗原據青海與黃教為敵的喀爾喀部卻圖汗，並其部眾四萬人，滅康區百利土司頓月多吉，滅與黃教為敵的藏巴汗，掌握西藏地方政權，大力扶植黃教，至崇禎九年時，顧實汗統一準噶爾和西藏地區，擁兵四十餘萬之眾，得知薛雲東歸，急於複仇的顧實汗準備大軍齊出，滅薛家軍、滅土謝圖汗部。滅庫倫城，果然餘勇可賈顧實汗不介意滅掉大明，見了一個政教合一的大蒙古國。
薛雲不得不放棄了返回大明的計劃，拔掉昔日入侵土謝圖汗部最後一個毒瘤，崇禎十年四月在土謝圖汗部西部，顧實汗的四十餘萬之眾，對上了薛家軍的二十萬大軍，除了薛家軍十萬火槍兵，還有土謝圖汗部和車臣部、紮薩克圖部和薛家軍土謝圖汗部軍區的十萬聯軍，顧實汗自持兵多將廣，認為滅薛家軍聯軍隻在旦夕之間。
戰爭的結果讓顧實汗肝膽俱裂，顧實汗知道薛家軍火槍厲害，自己也見識過火槍的，而且自己手下也有兩千火槍兵，可是麵對薛家軍十萬火槍兵，這根本不是一個級別的戰鬥，顧實汗敗了，敗得很慘，四十餘萬大軍損失怡盡。
顧實汗隻率領一萬多人逃入西藏，薛家軍乘勝追擊也殺入了西藏腹地，顧實汗逃到哪裏，薛家軍就追到哪裏，到崇禎十年冬，薛家軍利用追殺顧實汗，重創了西藏黃教，西藏的其他教派也深受打擊，西藏的政教合一基礎被摧毀。
崇禎十一年春，薛家軍千裏突襲藏南，顧實汗最後的數千死黨家屬，被薛家軍一舉殲滅，薛雲認為已經統一了西藏，正準備立即班師回朝，迎接建虜入侵京畿的這次大考，哪知道仇視薛雲的達賴五世準備在布達拉宮宴請薛雲時叛亂。
薛雲洞悉了達賴五世的陰謀，立刻軟禁了達賴五世，對達賴喇嘛的格魯派（黃教）再次清洗，從此西藏黃教一蹶不振，而班禪額爾德尼的格魯派靠近薛家軍趁機崛起，後來成了西藏第一大教，因為依靠外來勢力，班禪額爾德尼的格魯派幾百年後依然飽受本土頑固派的質疑。
薛雲留下哈丹昭日格等一萬薛家軍駐守西藏，自己率領大軍返回土謝圖汗部，因為達賴五世叛亂的耽擱，到達土謝圖汗部時，已經是崇禎十一年九月，薛雲隻在庫倫城休息了五天，就率領十萬大軍返回大明。
薛雲考慮讓苔絲娜的兒子薛猛做藏王，把苔絲娜留在了庫倫城，等薛猛大一些，西藏穩定一些後入藏；而娜仁高娃、布木布泰、郎氏隨軍返回大明，薛家軍沿著外蒙古行軍，進入寒冬的蒙古草原，讓薛家軍的行軍速度緩慢，牲口和士兵的傷凍非常嚴重，崇禎十一年臘月，薛家軍到達科爾沁邊境，損失牲口三萬多，犧牲戰士一千人，還有一萬人不同程度的凍傷。
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