薛家軍和劉香俘獲了鄭芝龍部六百艘戰艦，兩軍平分這六百艘戰艦，薛家軍手裏俘獲的戰艦多達四百多艘，要交給劉香一百多艘戰艦，劉奔、武大海、武洋等將領都不願意交出，薛破虜曉以利害，薛家軍需要劉香這樣的勢力牽製鄭芝龍和福建、廣東的明軍。
劉香得到了薛家軍送來的一百多艘戰艦，不過鄭芝龍那六萬俘虜誰都沒有要，送到海裏喂魚蝦了，然後薛家軍和劉香聯合進攻鄭芝龍的泉州海港，把停靠在海港裏一千艘多大、小艦船付之一炬，從此之後鄭芝龍隻能在福建、廣東海邊活動，昔日的海上霸主風光不在，從崇禎八年六月起，鄭芝龍就在泉州郊外臥病不起了。
至此福建、廣東一帶海上劉香稱雄，不過表麵上留下海上遵守跟薛家軍定下的協議，即劉香在福建、廣東沿海的海上收益一半歸薛家軍，而薛家軍的商船在福建、廣東貿易劉香不得征收任何費用；再就是盤踞在濠鏡澳（澳門）葡萄牙海軍實力不俗。
崇禎七年四月，林丹汗死在了青海的打草灘阿拉他拉，蘇泰大福晉的兒子察哈爾?額爾克孔果爾額哲被立為大汗，仍駐紮在河套地區，可是稚嫩額哲難以服眾，原來跟著林丹汗的部落紛紛散去，最後額哲隻剩下一萬人人馬，大汗額哲和母親蘇泰大福晉企圖收回察哈爾部，可是察哈爾大部被娜木鍾控製，額哲和蘇泰大福晉沒有達成目的。
崇禎八年正月，娜木鍾之子薛燭正位察哈爾大汗，號“光明大汗”，娜木鍾身為王太後，蒙古各部競相朝賀，蘇泰大福晉、額哲以自己這方是林丹汗長子，又有蒙古王朝的傳國玉璽，斥責娜木鍾謀權篡位，可是蘇泰大福晉、額哲並無能力討伐娜木鍾。
除了林丹汗的蘇巴海福晉、俄爾哲圖福晉，弟弟粆圖台吉遺失草原之中，斯琴圖福晉、竇土門福晉、兀浪哈大公主、泰鬆公主、貴英恰（烏雲娜福晉的哥哥）都先後投向娜木鍾，娜木鍾封斯琴圖福晉、竇土門福晉、烏雲娜福晉三人為王太妃，後來都隨娜木鍾侍候薛雲，皆為薛雲的後妃，烏雲娜產下一女封公主。
蘇泰大福晉、額哲眾叛親離，對娜木鍾恨之入骨，暗中勾結建虜皇太極，以傳國玉璽為進身台級，投靠建虜皇太極，崇禎八年六月，皇太極命多爾袞、嶽托、豪格領兵一萬女真精銳，偷偷前往鄂爾多斯迎接蘇泰大福晉、額哲，十月底蘇泰大福晉、額哲隻帶著三千部族和傳國玉璽，隨多爾袞、嶽托、豪格來到了金國盛京，皇太極納蘇泰大福晉為妃，封額哲額爾克孔果爾，安置在鴨綠江西岸靠近朝鮮義州的地方，後封額哲為親王，並將皇女馬喀塔格格嫁給了他。
得到傳國玉璽的皇太極認為天命有歸，積極籌備登基稱帝，代善、阿敏都暗中鄙視，阿濟格、多爾袞、多鐸都覺得時間不成熟，可是嶽托、濟爾哈朗、豪格卻極力擁戴，八旗將領個個希圖從龍之功，漢臣李永芳、範家主等頻頻勸進。
大明崇禎九年四月十一日，愛新覺羅?皇太極在盛京稱帝，皇太極改女真族名為滿州，建國號大清，年號崇德，是年為崇德元年，眾臣上尊號“寬溫仁聖皇帝，然後是大封功臣，四月二十六日，崇德皇帝皇太極派多羅武英郡王阿濟格為首領等統八旗兵十萬伐明。
阿濟格兵分三路入喜峰口、獨石口，大明巡關禦史王肇坤拒戰兵敗陣亡，明軍退至昌平防守，清兵再侵居庸、昌平北路，京營總兵王樸馳援，傳說擊斬一千一百零四人，俘獲一百四十三人。
八天後建虜三路大軍會於北京延慶縣，連敗明軍七陣，俘獲人畜一萬三千多，七月初三日，北京全城戒嚴，清軍經延慶入居庸關，取昌平，守城總兵巢丕昌投降，明德陵被焚毀，大軍直*北京西直門下。
崇禎皇帝大驚，急命文武大臣分守都城各門，命兵部尚書張鳳翼總督各鎮援兵，讓太監高起潛為監軍，然而各鎮勤王軍未到，即使有出擊的機會高起潛也不敢一戰，上層官員如此貪生怕死，難怪下麵將士畏敵如虎，一遇清軍便望風喪膽退縮不前。
清軍無意攻打京師，依太宗方針，在京城周圍不斷劫掠，消耗明軍實力，七月清軍攻陷昌平後，又相繼攻下良鄉、圍攻順義。明順義知縣上官藎與遊擊治國器、都指揮蘇時雨等城陷皆戰死，清軍乘勢又攻下寶坻、定興、安肅、大城、雄縣、安州等近畿州縣。
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