“陰陽四時者，萬物終始也，死生之本也，逆之則災害生。”
——《素問·四氣調神大論》自然界與病因
在春秋時代，人們對四時氣候和疾病的關係已有所認識。到了戰國時代，特別是《黃帝內經》認識到：人生活在自然界，人的生命活動，疾病的產生和變化，無不與自然界息息相關。如《素問·寶命全形論》說“：人以天地之氣生，四時之法成。”“天”、“地”是指自然界而言。《素問·生氣通天論》又說“天地之間，六合之內，其氣九州、九竅、五髒、十二節，皆通乎於天氣”，指出人與自然界是一個不可分割的整體。
自然界有四季的變遷，風、熱、暑、濕、燥、寒之氣候更替。人對正常的變化有一定的適應能力，故不病。隻有在時令氣候異常如太過和不及的情況下，才會引起疾病，故六種氣候被稱為“六淫”。各種氣候致病亦各有特點。《素問·至真要大論》指出：“風淫所勝……民病灑灑振寒，善伸數欠……”，“熱淫所勝……民病腹中常鳴，氣上衝胸……”，“濕淫所勝……民病飲積……”，“火淫所勝……民病注泄赤白，少腹痛……”，“燥淫所勝……民病喜嘔、嘔有苦”“，寒淫所勝……民病少腹控睾，引腰脊……”說明風、熱、火、燥、寒是多種病症的原因。《素問·四氣調神大論》說“：陰陽四時者，萬物終始也，死生之本也，逆之則災害生”，指出了人和自然及疾病的關係。《靈樞·賊風篇》也說：“賊風邪氣之傷人也，令人病焉”，賊風是自然界四時的不正之氣，在人體發病中起一定的作用。
精神狀態與病因
關於精神狀態的異常，主要是所謂“五誌”即怒、喜、思、憂、恐的過度。《素問·陰陽應象大論》認為“怒傷肝”、“喜傷心”、“思傷脾”、“憂傷肺”、“恐傷腎”。《靈樞·本神論》則認為：“怵惕思慮傷心、憂愁不解傷脾，悲哀動中傷肝，喜樂無極傷肺，盛怒不止傷腎。”可見，這種情誌變化固定傷害某種髒器的說法是不統一的。
體質與病因
體質是受先天稟賦和後天環境影響而表現出來的個體特性。在體質分型上，《靈樞·壽夭剛柔》說：“餘聞人之生也，有剛有柔，有弱有強，有短有長，有陰有陽。”即人們在其生長發育過程中可以顯示出剛柔、強弱、高低、陰陽等機能與形態上十分顯著的個體差異。
《黃帝內經》還認識到，體質與病因關係很密切，不同體質的人對不同致病因子的易感性不同。例如，《靈樞·陰陽二十五人》將人的體質按五行分為五大類二十五小類，並指出了各種類型的人所易患之病及其發病的時間。《靈樞·論勇》說：“黃色薄皮弱肉者，不勝春之虛風，白色薄皮弱肉者，不勝夏之虛風。”不同體質的人對相同的致病因子的耐受性不同。人的易感性和耐受性有如此大的差別，根本的原因是由體內髒腑的大小、強弱、厚薄決定的。《靈樞·本髒篇》說：“五髒皆堅者，無病；五髒皆脆者，不離於病。”邪氣侵入人體以後，常隨其人素質陰陽的盛衰，或蘊而為熱，或化而為寒。《素問·風論》說：“風之傷人也，或為寒熱，或為熱中，或為寒中，或為癘風，或為偏枯，或為風也，其病各異。”由此可見，人的體質不同是“為病各異”的主要原因。