事故發生後，安全監管局領導率有關人員趕赴事故現場，指導事故搶救等有關工作。根據國務院領導同誌指示精神，國務院事故調查組於當日15時到達事故現場。在初步勘查事故現場情況後，召開了調查組第一次全體會議，對事故救援、善後處理和調查工作做出具體部署，成立了事故調查組、現場打撈組、事故調查專家組、善後處理組和新聞報道組五個工作小組，積極開展搜救和事故調查等項工作。
事故發生後，中國保監會要求內蒙古保監局組織保險公司趕赴事發地進行查勘理賠，並協助地方政府和有關部門做好搶險救援工作。內蒙古保監局領導即帶領查勘搶險小組趕赴現場，清理核對本次航班乘客購買航空保險和其他人身保險情況，並積極協助內蒙古自治區政府事故應急處理小組開展善後處理工作。上海保監局迅速組織有關保險公司對失事飛機的保險情況進行調查。
事故發生後，包頭機場立即啟動應急救援預案，通知機場消防、公安和包頭市中心醫院、120急救中心、消防支隊等單位參加應急救援，並將事故情況報告民航總局、民航華北管理局、包頭市政府、民航內蒙古監管辦、內蒙古機場集團公司、東航、呼和浩特區域管製室等單位。8時28分，包頭市消防支隊、包頭機場消防隊先後趕到事故現場，展開滅火和救援工作。包頭市公安、武警官兵對事故現場進行了控製和封鎖，維護現場秩序，疏導現場道路交通。包頭市委、市政府領導及時趕赴現場組織指揮應急救援工作。內蒙古自治區政府領導率相關部門負責人於當日上午到達包頭，指揮協調事故現場應急救援和善後工作。包頭鋼鐵公司打撈隊當日上午到達現場打撈飛機殘骸、遇難人員遺體及黑匣子，交通部海事局也及時派員參加打撈工作。
包頭市120急救中心在8時26分接到包頭市民航局關於飛機失事墜入南海公園的報告後，立即啟動緊急事故處理預案，派出鐵路醫院的2輛救護車於8時38分到達事故現場，並立即向110、119指揮中心彙報，增派3輛救護車於8時56分到達現場。8時59分，包頭市衛生局和120急救中心有關領導到達現場指揮醫療急救工作，並緊急調度包頭市中心醫院、第三醫院、市蒙中醫院、解放軍二九一醫院的醫護人員和救護車前往現場，同時要求電力中心醫院、一機醫院做好增援準備。10時，共有10輛救護車、83名醫護人員趕赴現場參加救援工作。11時，根據現場情況，急救中心又安排部分救護車及醫護人員前往民航賓館，做好遇難者家屬應急救護準備工作。
內蒙古自治區衛生廳領導在事發後緊急趕赴現場，協調當地衛生部門。一是組織醫護人員做好遇難者家屬的醫療救護工作；二是組織衛生防疫部門與有關部門合作，做好汙染水麵及環境的消毒工作；三是密切觀察遇難者家屬的精神狀態，選派心理醫生開展工作；四是做好指揮部和參加搶救人員的衛生保健工作。