應對突發公共事件中的醫療衛生保障，主要包括隊伍保障和藥品器械等醫療衛生設備保障兩個方麵，即醫療衛生應急專業技術隊伍的組建和工作的開展；及時為受災地區提供藥品、器械等衛生和醫療設備工作。除此之外，還要在必要時組織動員紅十字會等社會力量參與醫療衛生救助工作。
突發公共事件中的醫療衛生保障，應當依照《國家突發公共事件醫療衛生救援應急預案》的規定進行，在突發公共事件發生後，各項醫療衛生救援應當迅速、高效、有序地開展，各級衛生部門要按照“統一領導、分級負責；屬地管理、明確職責；依靠科學、依法規範；反應及時、措施果斷；整合資源、信息共享；平戰結合、常備不懈；加強協作、公眾參與”的工作原則，最大程度地減少人員傷亡和健康危害，保障人民群眾身體健康和生命安全，維護社會穩定。
各級衛生行政部門要在同級人民政府或突發公共事件應急指揮機構的統一領導、指揮下，與有關部門密切配合、協調一致，共同應對突發公共事件，做好突發公共事件的醫療衛生救援工作。
一、醫療衛生專業技術隊伍的組建和相關工作的開展
突發公共事件應急醫療衛生救援機構和隊伍的建設，是國家突發公共衛生事件預防控製體係建設的重要組成部分，各級衛生行政部門應遵循“平戰結合、常備不懈”的原則，加強突發公共事件醫療衛生救援工作的組織和隊伍建設，組建醫療衛生救援應急隊伍，製定各種醫療衛生救援應急技術方案，保證突發公共事件醫療衛生救援工作的順利開展。
突發公共事件醫療衛生專業技術隊伍的組建，不僅包括綜合性醫療衛生救援應急隊伍的組建，而且還包括特殊專業醫療衛生救援應急隊伍的組建。醫療衛生應急專業技術隊伍主要包括專家組和各級各類醫療機構，包括醫療急救中心（站）、綜合醫院、專科醫院、化學中毒和核輻射事故應急醫療救治專業機構、疾病預防控製機構和衛生監督機構等。醫療衛生專業技術隊伍的組建，應當堅持精幹、高效、反應迅速的原則，盡可能地選用那些經驗豐富、工作能力強、能吃苦耐勞的醫護人員。
醫療衛生應急專業技術隊伍，不僅承擔著對突發公共事件中相關醫療衛生方麵事宜的調查、分析和建議，而且在必要的時候，根據需要及時趕赴現場開展醫療救治、疾病預防控製方麵的衛生應急工作。
突發公共事件發生後，有關衛生行政部門要根據情況組織疾病預防控製和衛生監督等有關專業機構和人員，開展衛生學調查和評價、衛生執法監督，采取有效的預防控製措施，防止各類突發公共事件造成的次生或衍生突發公共衛生事件的發生，確保大災之後無大疫。
各級衛生行政部門要保證醫療衛生救援工作隊伍的穩定，嚴格管理，定期開展培訓和演練，提高應急救治能力。醫療衛生救援演練需要公眾參與的，必須報經本級人民政府同意。
衛生行政部門提出醫療衛生救援應急藥品、醫療器械、設備、快速檢測器材和試劑、衛生防護用品等物資的儲備計劃建議。發展改革部門負責組織應急物資的生產、儲備和調運，保證供應，維護市場秩序，保持物價穩定。應急儲備物資使用後要及時補充。
二、為受災地區提供藥品、器械等衛生和醫療設備工作
對醫療衛生部門而言，除負責組建醫療衛生應急專業技術隊伍和趕赴現場開展醫療救治、疾病預防控製等衛生應急工作外，還承擔著負責為受災地區提供藥品、器械等衛生和醫療設備的工作，並承擔對相關醫護人員進行培訓和業務指導工作。
衛生管理部門除負責上述事宜外，在必要時還應當承擔組織動員紅十字會等社會衛生力量參與突發公共事件的醫療衛生救助工作。紅十字會按照《中國紅十字會總會自然災害與突發公共事件應急預案》，負責組織群眾開展現場自救和互救，做好相關工作，並根據突發公共事件的具體情況，向國內外發出呼籲，依法接受國內外組織和個人的捐贈，提供急需的人道主義援助。