澤理地區，一個普通的小鎮——落葉鎮。在這裏居住的人並不多，但卻住著一位著名的神奇寶貝博士——莉莉絲博士。她和關東地區的大木博士一樣，會把本地區的禦三家，分給年滿12歲的少年們。而就在這天的清晨，三位少年早早的起了床，趕往莉莉絲研究所去挑選適合自己的神奇寶貝，然而今天要挑選神奇寶貝的少年卻有四位……
“喂！小狼，你怎麼還沒起床？博士說了要八點準時到研究所的！你看看現在都幾點了！還不快起床！”
隨著媽媽的大叫，小狼漸漸睜開了眼睛看向鍾表，此時指針正指在九點半處！“啊！”小狼一聲慘叫，連睡衣都沒換，就趕快穿上鞋，匆匆衝出家門趕往研究所。
媽媽在家中望著小狼的背影，自言自語道：“哎！這孩子，也不知什麼時候能改掉這毛病。”
趕往研究所的途中，風景可是很好，如果是平常，小狼一定會慢慢地欣賞，可現他要做的是一件可能改變自己終身命運的事，那裏還敢欣賞，快速地跑向研究所……
哐——小狼猛地推開了研究所的大門，嘴裏喘著粗氣，緩了緩說：“莉，莉莉絲博士，請給我神奇寶貝，我要出去旅行，當世界第一的神奇寶貝訓練家！”
莉莉絲博士微笑著說：“咦？你就是小狼吧！你遲到了吧！而且你要穿睡衣去修行嗎？”
“修行和穿什麼衣服有什麼關係嘛！快給我神奇寶貝啦！”
“嗯，那好吧！還剩下一隻神奇寶貝，不過這隻神奇寶貝的個性很差喲，是被人挑剩下的啦！”說著莉莉絲博士走到了她的研究台，拿起了一個神奇寶貝球，向空中擲去……
“皮卡丘～”隻見一隻皮卡丘出現在地上。
“哇，那有嘛，這隻明明就很好啊。”小狼蹲下身來摸了摸皮卡丘的頭，卻沒有注意到皮卡丘露出了一下‘鬼笑’！
“皮卡丘！”果然下一秒皮卡丘大叫一聲，並發出了【電擊】。“啊～”慘叫聲緊接從小狼嘴中發出，此時小狼的頭發已經全都豎了起來。
突然，莉莉絲博士好像想起了什麼，對小狼說：“小狼，你爸爸應該教過你艾爾法文吧！”
“是啊，怎麼了嗎？”
“那太好了，你快跟我去一趟方圓市。”說著，莉莉絲博士將神奇寶貝球交給了小狼，又從衣兜中拿出了自己的神奇寶貝球走出門外，投擲出去放出了一隻暴蠑螈，然後騎到了它的背上。
“小狼，別愣著了，快上來吧。”
“哦！”小狼用神奇寶貝球將皮卡丘收了回去，也騎到了暴蠑螈背上。
“暴蠑螈，飛空術！”莉莉絲命令道。
嗖——
隻見暴蠑螈快速向高空……