黃州安國寺坐落於湖北省黃岡市黃州區城南長江之濱、故道北岸的寶塔公園內。據明弘治《黃州府誌》載，該寺始建於唐高宗顯慶三年（658 年 ），由郡人張大用於顯慶二年捐地基，由僧人惠立創建，取名“護國寺”。又據蘇軾《安國寺記》稱，該寺始建於南唐李璟保大二年（944年），始名護國寺。據分析考證，該寺應始建於高宗顯慶二年（657年），名護國寺，後因唐武宗滅佛和唐末黃州戰亂，護國寺荒廢。至五代南唐時，因統治者倡佛，故舉國上下競相效尤，保大二年在護國寺遺址上重修。
北宋天聖年間（1023-1032年），韓琦投奔其兄（黃州刺史韓琚）時，在安國寺內發憤讀書，“白晝青燈，風雨無怠”，終於考中進士，並於宋仁宗嘉祐右年間任樞密使、宰相，為北宋名臣。後人在安國寺旁立有“韓魏公祠”，此祠為韓琦青年時的讀書遺址，安國寺也因韓琦發跡於此而名聲遠播。嘉祐八年（1063年），宋仁宗禦賜“安國”寺名，並賜玉印一方。玉印為陽篆字體，印麵呈正方形，邊長10.6厘米，文日“敕賜唐代祖庭安國禪林之寶”。印鈕為一瑞獸，造型奇偉，至今仍為鎮寺之寶。自此，安國寺成為江淮名刹，規模宏大。“堂宇齋閣，蓮皆易新之，嚴麗深穩，悅可人意，至者忘歸。歲正月，男女萬人會庭中，飲食作樂，且祠瘟神。”（引自蘇軾《黃州安國寺記》）
北宋元豐三年至七年（1080-1084年），蘇軾謫居黃州，因安國寺“茂林修竹，陂池亭榭”，環境優美，蘇軾“間一二日輒往，焚香默坐，深自省察”。寫下了《安國寺浴》、《安國寺尋春》、《應夢羅漢》、《黃州安國寺記》等眾多膾炙人口的詩文，並與寺內高僧繼蓮結下深厚友誼。蘇軾還將寺旁池塘辟為放生池，取名為“蘇子瞻放生池”，勒石立碑。
北宋末年至南宋初年，金兵南侵，黃州多次淪為戰場，生靈塗炭，安國寺亦遭厄運。陸遊於乾道六年（1170年）至黃州時，發現安國寺已“兵火之餘，無複遺跡，惟繞寺茂林啼鳥，似猶有當時氣象”，後又作《自雪堂登四望亭因曆訪蘇公遺跡至安國院》詩紀念。
元朝時，安國寺得以修複。元末戰亂，安國寺又毀於兵火。
明朝朱元璋統治時期，戰亂結束，百廢待興。洪武元年（1368年），黃州城由南往北移。洪武七年，僧人雲亭重修安國寺。宣德七年（1432年）又加以培修。弘治十二年（1499年）遺愛亭重建於府前西側。次年，韓琦讀書處由寺院旁改建於院內東側。正德元年（1506年），安國寺祭祀唐代著名戰將張巡的“睢陽張公祠”被毀。萬曆二十四年（1596年）安國寺得以再次修複。著名書畫家董其昌還為韓琦讀書處親筆題寫“韓魏公讀書堂”橫額。明朝後期，國勢衰微，社會動蕩，安國寺無人複修，荒涼破舊，正如洪周祿所述：“荒草城南異昔時，獨留頹寺帶殘碑。”
清代前期，國泰民安，安國寺再現江淮名刹，寺院規模宏大，除同治寺院外，還有睢陽院（以唐名將睢陽張巡為名）等建築，有亭日“春草”，有軒日“竹嘯”。“曲檻幽榭”，“與紺宇琳官相輝映，雖古宿之精廬，亦先賢之別業也”。
清鹹豐、同治年間，太平軍占領黃州時，於鹹豐三年（1853年），因東王楊秀清《告江南士民諭》令：“現今拿獲僧道，並查首倡及重修之人，一並拿究。”將安國寺焚毀。此後，安國寺長期頹廢，至光緒二十二年（1896年），住持僧月鬆四處募捐集資重修，安國寺又呈規模，為十方叢林。
中華民國十六年（1927年），北伐革命軍進駐黃州後，曾一度號召民眾“打菩薩”，使安國寺的佛像受到一定損毀。至解放前夕，安國寺雖破舊，但整體格局尚好，仍為江淮名刹。本地知名將領方本仁為安國寺醉瘋和尚塔院題額並手書“福公塔院”（醉瘋和尚又名福光），題名石刻今在寺中。
中華人民共和國建國初，安國寺殘存建築麵積僅約1400平方米。進入嵌有“安國禪寺”匾額的門樓，是一方形院坪，約130平方米，穿過院坪為天王殿，殿後約有500平方米的長方形花園，中有路直通大雄寶殿。大雄寶殿佛相背麵，樹立高寬各約4米的南海島泥塑模型。島上五峰起伏，大小菩薩神姿各異。大雄寶殿後為觀音殿。3座大殿兩側，相對建有客廳、齋堂、塔屋和寮房共20餘間。寺門西側有荷花池、火花窯及僧人墓塔數座。
“文化大革命”中，安國寺房屋先後被部隊、工廠、建築隊等八家占用，至上世紀80年代才部分收回，僅存門樓、三座大殿屋宇和部分小房。
改革開放以後，在宗教信仰自由政策感召下，在保護文物古跡的法令指導下，有關部門按政策還部分土地於寺院，為寺院發展創造了條件。但至今仍有部分土地未能收回。顯光法師1986年重回安國寺後，四處奔走呼籲，收回部分被占土地，修葺大雄寶殿、觀音殿、天王殿及山門，重塑菩薩、海島及各大天王，增修寮房及課堂，恢複寺內秩序，安國寺重現生機。