終因超負荷工作，累垮了身體，秋審尚未結束，就發現自己咳出的痰液中帶出了血斑，渾身疲乏無力，不得不“謁告”（請假），回家調養。
養病期間，情緒怎麼也安定不下來，總覺得在刑部幹得再出色，充其量不過是個刀筆小吏而已，太窩囊；這樣下去，恐難實現“飛騰”的夙願。而這時又傳來英軍侵擾東南沿海各州縣的消息，也觸動著他對時局的憂心，寫詩曰：
謁告經旬晝掩關，秋風吹雨滿長安。
展書唯覺古人好，得酒豈知來日難。
虛擬飛騰酬壯歲，未妨疏拙稱閑官。
卻思嶺海傳烽急，掛壁龍淵倚醉看。
——《謁告》
顯然，他不甘心自己默默無聞的現狀，在身體沒有康複的情況下，便迫不及待地向軍機處呈遞了要求投軍報國的請願書。
等待批複的時間一天天過去，結果沒有了下文；希望破滅，心事沉鬱的走出郊外，即景生情，脫口吟成《郊行》的詩，道出了有懷投筆，無路請纓的落寞：
久不向郊郭，焉知秋已深。
頹陽依遠堞，寒色變平林。
搖落中年感，蒼茫日暮心。
候蟲誰聽汝，辛苦獨悲吟。
道光二十一年（1841）一月七日，英國不滿意與清廷的談判進展，悍然出動海陸軍進攻虎門的第一重門——沙角、大角炮台，中國軍隊倉促應戰，傷亡慘重。時在廣州的欽差大臣琦善，沒經過朝廷的批準，就擅自和英人義律議訂了《穿鼻草約》，致使英國輕而易舉地占有了香港。
琦善的賣國行為，引起清廷上下的不滿，道光帝認為有損大清國的尊嚴，決定反擊英軍的挑釁。英軍借機先發製人，再攻虎門，水師提督關天培親自督軍堅守炮台，因寡不敵眾，以身殉國。
五月，英軍轉攻廣州，廣州城外的泥城、四方炮台相繼失守，負責防衛的大臣奕山，嚇破了苦膽，趕緊以恢複對外貿易為條件，和英人達成暫時停戰協議，雙方簽訂了《廣州和約》。簽約表現的媾和行為，點燃了廣州三元裏人民仇視英人的怒火，聚眾數萬，奮起抗擊，迫使英軍退回軍艦。
九月，英軍複攻定海，遭到舟山軍民的頑強抵抗；沿海不斷受到英軍的挑釁，羽檄像雪片一樣飛到京城，朝野內外輿論大嘩。
在此之前，清廷君臣之間，圍繞鴉片的輸入展開過激烈的辯論，持有“嚴禁”和“弛禁”兩種不同觀點的大臣，唇槍舌劍地進行過交鋒。最終，以穆章阿、琦善、耆英為代表的主和派占了上風，而道光帝迫於輿論的壓力，還在二者之間左右搖擺。
馮誌沂對籠罩在苟安求和氣氛下的現實極為不滿，經常在下值後，與同僚們聚首一堂，發表議論，聲揚林則徐、祁藻、黃爵滋、陳用光、王鼎、潘世恩等嚴禁鴉片販賣的政治勢力，九月十二日，他實在難抑憂時感事的情懷，寫詩雲：
嶺海烽煙又浙東，羽書夜半達深宮。
宵衣誰遣勞明主，專閫頻聞策上公。此日天心應悔禍，向來廷議但和戎。謄黃詔下三軍泣，早晚舟山看掛弓。
——《九月十二日作》
事實確如主戰派所言，妥協求和，隻能會助長英軍的囂張氣焰，滅清軍的威風。時至十月中旬，廈門、鎮海、寧波逐一被英軍攻破，三總兵葛雲飛、王錫朋、鄭國鴻相繼戰死在陣前，捐軀盡忠。
奸臣誤國，壯士殉難，事變肇始，清廷就接連重演著曆史上的悲劇，形勢嚴峻了。