：“絕對…沒有。這種體積的怪物需要路基或者海基的大型重武器才能消滅掉。我們手上最強的火力也不過是毒刺導彈和重機槍，打這種怪物基本上沒有用。”沈超看這屏幕上哥斯拉的巨大背影說道。
電影在繼續，由於哥斯拉造成的破壞，軍隊第一時間趕來並封鎖了曼哈頓島。可是曼哈頓如此巨大，簡直就是一片鋼鐵叢林，即便是哥斯拉體型巨大，依然很快消失的不見蹤影。軍隊緊急疏散了曼哈頓島上的所有人，然後在城市內開始武裝搜索。
當他們發現哥斯拉的挖洞能力之後，軍隊又不得不在地下設置大量地雷，防止哥斯拉逃出，這時，主角的作用體現出來了。電影裏的主角提出可以使用誘餌將哥斯拉引出來消滅掉。軍隊的指揮官采納了他的建議，調集了大量的海鮮堆在一起充當誘餌。
很快，哥斯拉成功的被人類引誘出來，但是伏擊點地形狹窄，通訊又出現故障。軍隊沒能集中好他們的火力，哥斯拉逃脫了。當劇情進展到哥斯拉用計謀幹掉幾架追擊它的直升機時，愛麗絲不禁發出一陣驚呼。
這還遠遠沒有完，隨著電影裏主角因為泄密被踢出軍隊的科研隊伍後，劇情進展到了全新的方向，主角開始在找上門的法國特工的幫助下，開始尋找哥斯拉的巢穴，意圖找到可能存在的哥斯拉卵，而自覺慚愧的前女友也和那位命大的攝影師一起追蹤他們的行動。
地麵上，軍隊再次使用誘餌吸引哥斯拉自投羅網。有了上次的經驗，他們將這次的伏擊點設置在了有大片空地的中央公園。不過雖然他們的布置非常嚴密，但是有著極高智商，而且已經吃過一次虧的哥斯拉在來到附近時認出了這是個陷阱。
最終，哥斯拉沒有如願的進入火力嚴密的伏擊圈。它以極快的速度逃離了現場，躲過了大批的武裝直升機。但是，即便它逃到海裏。軍隊依然做好了準備，三艘核潛艇堵住了它的退路。
其中一艘潛艇首先發射了魚雷，力圖消滅哥斯拉，但是緩慢的魚雷卻被哥斯拉引到另一艘潛艇上爆炸了。餘下的潛艇繼續攻擊，終於在哥斯拉跑回陸地前擊中了它。看著哥斯拉巨大的身軀在海底發出哀鳴，愛麗絲的態度不像是之前那麼絕對了。
：“隻能殺了它麼？”她扭過頭看著沈超問道。
：“恐怕隻能這樣，畢竟，它的繁殖和攻擊能力太強，不消滅它的話，那個世界的人類說不定就會被滅絕。”沈超聽得出來愛麗絲是動了惻隱之心，畢竟，這部電影裏的哥斯拉隻是個動物，它不是故意來攪亂人類的生活的。它造成的巨大破壞隻不過是它的巨大體型帶來的副作用。
愛麗絲沒有再說什麼，電影還在繼續，主角一行人追蹤著哥斯拉留下的痕跡，終於在亂成一團的麥迪遜大廳裏發現了哥斯拉的卵。當他們修複好電力，打開大燈後，他們發現這裏有近200枚一人高的巨型哥斯拉蛋。
更糟糕的消息是，這些蛋馬上就要孵化了。在經過一番驚險的掙紮，主角一行人遇到跟蹤他們的攝影師和主角的前女友。兩隊人合作著利用廣場裏的轉播設備將這裏的情況發送了出去。得到消息的軍隊立即派出戰鬥機前去執行轟炸任務。
又是一番鬥智鬥勇的驚險過後，他們成功的在戰機趕來前逃出了麥迪遜中心，躲過了轟炸。所有的剛出世的哥斯拉也都被戰鬥機的空對地導彈消滅了。就在這和諧的，像是典型的好萊塢電影結尾的時候。一聲熟悉的巨響從地下傳了出來，哥斯拉巨大的身影從地下鑽出。之前的魚雷沒有幹掉它！
幸存下來的幾個人再次開始逃跑，費了不少事跟軍隊聯係上。得知哥斯拉依然存活的軍隊讓還沒有返回基地的戰鬥機立即返航消滅哥斯拉。終於，經過一番冒險，哥斯拉被困在布魯克林大橋上。趕到的3架戰鬥機戰鬥機來回發射了兩次導彈，終於將它擊倒。至死，它還在努力為自己死去的孩子報仇。看著哥斯拉那龐大的身軀倒地，沈超感受到旁邊兒的愛麗絲歎了口氣。