最後，是由在現場的時任麗春市委書記的朱時友和市委譚無忌以及省公安廳副廳長指揮現場的公安幹警、武警和在現場的機關工作人員，采取強行將在場的人員隔離成幾個板塊的辦法，減少現場因為擁擠而發生的衝撞，並反複在現場音響中廣播，要求現場人員迅速離開現場。而那些到現成的上訪人員看到現場受到衝擊，開工儀式已經無法舉行的現實後，感到衝擊現場的目的已經達到，也慢慢地退出現場。這樣一來，在人員逐步退出現場後，才使局勢得以控製。
最後，事件現場出現了踩死三人、踩傷四十多人的慘痛結果。
事件基本平息後，中央和西原省組成調查組，對整個事件進行調查，調查的最後結論是主要責任在省委、省政府和省級相關部門，麗春市委、市政府雖然有工作做得不到位的責任，但上訪群眾反映的問題並不是麗春市自己能夠解決的問題，所以麗春市委、市政府及南山縣委、縣政府不承擔事件責任，隻承擔工作責任。最後中央對“南山事件”做出如下處理意見：時任副省長因為無視群眾的生命受到威脅，自行逃離現場受到被撤職的處分，時任省政府副秘書長因為工作不力，受到黨內嚴重警告的處分。時任省上的書記和省長雖然沒有到現場，但由於在這件事情上負有直接的領導責任和前期已經有問題反映，卻沒有及時解決處理，存在失察失職責任，兩人都受到黨內警告處分。其他西原省相關部門的領導也不同程度地受到一定處分。
由於出現了這種嚴重的不穩定問題，準備進入南山縣的該大型國有企業最後終止了進入南山的工作。
由於不少省級部門的領導受“南山事件”的影響，受到過處分，“南山事件”後很長一段時間，西原省的領導包括省級部門的領導都不願意到麗春來。麗春因此受到的影響也就更在巨大。不僅企業沒有進入，還得罪了不少領導。朱時友雖然在這次事件後沒有受到處分，但由於省上的書記和省長都受到了處分，自然對麗春的幹部不滿意。“南山事件”過後沒有多久，省上就把朱時友調到省上的一個冷部部門任職去了。要不是考慮到要消除“南山事件”的影響，並且繼續做穩定南山群眾的工作，省上不得已才把譚無忌提拔為市委書記。
從某種意義上講譚無忌是“南山事件”的受益者，但由於他是在這種特殊的背景下擔任市委書記的，所以在擔任市委書記之初非常艱難，省級各部門特別是經濟部門對麗春都有成見，不願意和麗春的幹部打交道，更不要說支持麗春了。而不少企業也因為“南山事件”，認為麗春的投資環境不好，不願意到麗春投資。可以說，譚無忌在市委書記的位置上，是付出極大的努力，好不容易通過各種各樣的工作，才逐步削除“南山事件”的影響，改變麗春工作極為被動的局麵，並使麗春在原來的基礎上有了較大的發展。這也是之前譚無忌自己一直自我感覺良好的原因。
現在，秦有益提到上下都應該深刻吸取‘南山事件’教訓的事，譚無忌自然印象深刻，並且在思想上高度警覺。如果再出現一個“南山事件”，譚無忌就不可能受益，而隻會受損了。
聽了秦有益的話後，譚無忌說：“確實，‘南山事件’教訓太深刻了，受‘南山事件’影響的，不僅僅是麗春市，西原省都受到了極大影響。”
“所以，我們要提醒省上的領導，對麗春當前的情況也不能掉以輕心，‘縣縣通高速’所引發的群體性上訪問題的根源並沒有消除，相反，還有高鐵建設項目和麗春機場的建設項目，在做好群眾工作確保麗春穩定方麵，還必須引起高度重視。這次高省長來麗春，我們必須把這個意思想辦法明確告知他，讓他在思想上有一個認識，進而引起重視。”秦有益並沒有想到如果高遠誌聽了他們的話後對麗春下一步修建高鐵和機場的事持不支持的態度，那對麗春來說就將會是一個巨大損失。但秦有益不會去考慮這些問題，如何壓製住歐陽永好，擋住歐陽永好很快上升為市委書記的路，甚至讓他當不成麗春的市委書記，是他目前心裏的唯一目標。