解決富家千金被綁事件並回到毛利偵探事務所後已經是晚上11點了。“柯南，要不今天你就和我睡吧，要不，明天早上我整理一間房間出來給你作為臥室，好不？”小蘭說。“哦，好，謝謝小蘭姐姐。不過我今天晚上要去阿笠博士家那拿衣服，明天再過來住”“這麼晚了，要不我陪你去吧，你一個人去，我怕出事”“不用了，我會自己保護好自己的，小蘭姐姐你先睡吧”柯南送小蘭到臥室，然後出了偵探事務所，奔向阿笠博士家。
一路上，他在想：不知道我什麼時候才能回到現實世界，在柯南世界可是要破許多案子的，雖然我看了700多集柯南，可是柯南的推理方法還沒有掌握多少啊。以後該怎麼辦？還有，我不是真正的柯南的身份要不要跟阿笠博士說？我要不要告訴小蘭我的真實身份？……不一會兒就到了博士家門口。
柯南剛想敲門，就聽到“砰”的聲音，博士身上全是發明物的殘骸。“博士，你沒事吧”，門沒上鎖，柯南推開門，衝進博士家。“博士，看來你發明東西又失敗了”“是柯南啊，這隻是個小意外，我可發明了許多有用的東西呢”阿笠博士拍了拍身上的灰。
“柯南，你不是去偵探事務所了嗎？怎麼又回來了？”阿笠博士好奇地問，“況且這麼晚了還不回去睡覺”。“博士，其實我回來是有事要告訴你的……”“什麼事啊，先進來再說，天這麼晚了，我帶你去我房間睡吧，有事的話明天再說”“哦”柯南走進屋，屋裏到處都是博士發明的奇奇怪怪的東西，而且生活用品也很亂，看來博士是個不會收拾的人，柯南輕歎了口氣，比動畫裏還亂啊。
第二天早上。柯南比博士先起來，看了博士家亂糟糟的，有潔癖的他從倉庫拿來掃帚開始掃地。“噢”博士伸了個懶腰，“柯南呢？難道回家了？”“呲呲”是掃地的聲音。博士走出臥室，看到柯南正在掃地，額，柯南，那個打掃衛生的事我自己來做就可以了，你再去睡會吧，現在才5點半哪。不，博士，還是我幫你打掃衛生吧，實在是太亂了，柯南說。沒辦法，讓柯南一個人打掃畢竟不好，於是博士和柯南一起打掃，花了2個小時，終於打掃完了。
“博士，你以後可要注意衛生啊，你的這些發明應該放到倉庫，還有這些生活用品要放在適當的地方……”“新一，不，柯南，我知道了，謝謝你幫我搞衛生啊，哦，你還沒吃早飯的吧，我帶你去附近的飯店吃”“嗯，好”
打掃好衛生之後，博士帶柯南去了毛利偵探事務所樓下的波洛咖啡廳。然後回阿笠博士家。
“柯南，你昨天晚上不是說有事要告訴我嗎？是什麼事情啊？”一進屋阿笠博士就問。柯南趕緊把大門關了。其實，也沒有什麼大事了，其實我不是……不，我不能說，萬一博士真與黑衣組織有關該怎麼辦？“博士，我想告訴你的事是……我身體縮小了，力氣也不如從前了，現在我寄住在小蘭家，我是個男孩子，在小蘭姐姐遇到危險時，我應該保護她對不？隻是我現在這個樣子，該怎麼辦啊？”“柯南，原來你擔心這件事啊，不用擔心，我有幾個專門為你定製的發明，等會啊，我去拿”是動漫中博士為柯南發明的那些東西嗎？聽到發明，柯南很高興。