“約翰·D·洛克菲勒先生即將留下的世界上最大的一筆財產引起了世人的關注。他的兒子小約翰·戴·洛克菲勒將在幾年後繼承這筆財富。很顯然，這樣一筆巨額財富足以能夠影響到整個世界……或者，把它用在幹壞事上，那將使世界文明的發展推遲25年。”
牧師蓋茨先生是老洛克菲勒的最親密的朋友，在老洛克菲勒晚年時，他不斷地勸說他把錢捐給一些慈善機構。老洛克菲勒在他的建議下把上億美元巨款捐給學校、醫學、研究所等機構，並組成了龐大的慈善機構。老洛克菲勒雖然進行一些捐款、投資，但是更吸引他的是如何賺錢，如何更好地掌握和運用賺錢這項藝術，這是他一生中最執著的動力，也是惟一的。
這樣，小洛克菲勒就得到並緊緊地抓住了這種機會。
小洛克菲勒回憶道：
“蓋茨在此間充當了創造家和理想家，我則是一名推銷員——抓住一切時機向我父親推銷的中間人。”
小洛克菲勒在老洛克菲勒心情不錯的時候趁機提出各種建議，通常情況下，他父親都會答應的。
老洛克菲勒在12年間中，把446719371美元的巨金分給了他的4大慈善機構：普通教育委員會，勞拉·斯佩爾曼·洛克菲勒紀念基金會、洛克菲勒基金會和醫學研究所。
在這些機構中，小洛克菲勒就成為具體負責人。
小洛克菲勒在這些機構的董事會中，遠遠不僅隻充當個說客的作用。
他一邊要主持摸底工作，一邊要尋求合適的管理人才、管理機構。
1901年，在慈善事業家羅伯特·奧格登的邀請下，小洛克菲勒和其餘50名知名人士對南方的黑人學校做了一次曆史性的考查。南方之行回來後，他就把建立普通教育委員會的建議通過郵信告訴了他父親。兩個星期後，他父親就給他彙了1000萬美元過去，以後又陸續捐贈了3200萬美元。到1921年時，捐款額已達到1.29億美元之巨。
蓋茨憑牧師的神聖靈感和商業敏銳性，在洛克菲勒基金會成立後，已經準確地預料到它即將在全世界範圍內產生巨大影響。
1914年，在殖民統治和商業的背景下，蓋茨計劃在中國北京建立一些具有現代化水平的醫院。
這樣，協和醫學院和協和醫院就在北京建立了。小洛克菲勒稱這是“亞洲第一流的醫院”，並親自出席了北京的落成典禮。中國人民從這兩座設備很先進的醫院中得到不少好處和方便。
小洛克菲勒最為關注的還是慈善機構中的社會衛生局。
1909年，賣淫問題成為紐約州長競選的一個重頭戲。被人們稱之為“好好先生”的小洛克菲勒著手組建並負責一個陪審團，任務是專門調查買賣娼妓的生意。
他將全部的精力都投入到他接受的任務中，全天候地忙於工作。一份詳盡的調查報告在幾個月後出台了。在報告中指出：應該建立一個專門委員會來解決這個問題，但被紐約市長拒絕了。於是，小洛克菲勒決定自己把這個任務擔起來。
他於1911年投資50多萬美元建立了社會衛生局。
派出弗萊克斯納到歐洲去考察美國與歐洲娼妓問題的區別，是該局的第一步。
弗萊克斯納在美國工務卿介紹信的幫助下，訪遍歐洲大城市後得出一個結論：把這些事情轉入地下是一種可行方法之一，這樣雖然不能根除，但起碼能有一個隔離的效果。
他認為：如果想解決賣淫問題，就必須了解賣淫存在的合法環境。
為了證明他的看法，該局又派人到歐洲對警方進行一次跨國的考察。
結論令人們十分吃驚：美國警察很隨意、紀律性不強，而歐洲警察卻是一絲不苟。
美國警察製度從這次調查中受益非淺，於是進行了完善和加強。
洛克菲勒基金會的廣泛和複雜的捐贈範圍，是難以計算的。人們對它的印象是它是一個高效率的造福人類的超級慈善機構。
實際上，美國的衛生、教育和福利事業在20世紀發展時，洛克菲勒在本世紀上半葉就已開頭了。
洛克菲勒基金會把目光不僅注視在克服世界性疾病，而且對世界各地的饑荒和糧食問題給予了極大的關注。
一些優秀的科學家在基金會的資助下，發明出來許多新玉米、水稻和小麥，給一些不發達的國家帶來了極大的優惠。
在科學技術方麵，加利福尼亞所造的世界上最大的天體望遠鏡和有助於分裂原子的184英寸回旋加速器，就是在基金會的巨額科研經費支持下完成的。
洛克菲勒基金會每年大約給16000名科研人員提供活動經費，其中也包括許多世界一流的科學家。
小洛克菲勒在經營這些慈善機構的同時，還從事著保護自然這一他終生愛好的事業。
1910年，他把緬因州一個風景美麗的島嶼買了下來，目的就是使這裏的自然風光不受到破壞。在保護自然和方便遊人的前提下，他出資修建了路和橋。後來，他把這以後被稱為阿卡迪亞國公園的島嶼捐給了國家。