直到九日傍晚才最終熄滅的這場席卷了整個文京區、台東區的大火，將東京的這兩片城區幾乎燒成一片平地。而作為轟炸目標最核心的東京帝國大學，則被從地麵上徹底的抹掉。所有在校師生，校內儲備的大量書籍、教材，以及日本最頂尖的教學和科研設備全部被燒毀。
存放在東京帝國大學校內的，由日本最尖端的核物理學家仁科芳雄，研製的日本第一台回旋加速器，連同這天晚上就住在東京帝國大學校內的東京理化研究所內的這位研製者。包括他最著名的學生，後世被稱為日本雷達事業奠基人，正在日以繼日忙著研製雷達的朝永振一郎教授，以及從德國搞來的雷達資料也一同灰飛煙滅。
這場轟炸，對於日本人來說無疑是一個不小的災難。不僅單純是喪生在轟炸引燃的大火之中的五六萬普通百姓，還有儲備了整個日本最尖端科研儀器的東京帝國大學被夷為平地，以及帝國大學內的上百上千的日本頂級科學家和大量的學生。
淩晨三點多，絕大多數人都在睡夢之中。而尚未完全轉入戰時狀態的日本本土，甚至連防空洞的數量都不足。民眾雖然多次做過防空演練，但是演練與實戰是兩碼回事。再加上突然的襲擊，直到轟炸完成全市也沒有拉響防空警報。
而炸彈的落點又是在整個東京市內最中心人口密集區域，造成這麼大的傷亡也就不足為奇了。這還是抗聯投彈的噸位不足，隻有七十餘噸的當量，毀滅的麵積沒有那麼大。如果換了載彈量更多的大型轟炸機，恐怕東京的損失還要巨大的多。
此次轟炸之中巨大的損失，讓上至日本天皇，下至普通的東京居民都感覺到異常的震驚。從轟炸核心區域找到的燒焦屍體，堆積如山。流經轟炸區域內的幾條河內也堆滿了試圖跳河逃避大火，卻因為空氣被大火吸光而窒息死的人。
一直生活在和平中的日本本土居民，終於領會到了什麼叫做戰爭的恐怖。幾年來中國大後方那些和平居民的遭遇，在首次降臨到他們的頭上。打開了潘多拉匣子的日本人，終於還是品嚐自己釀下的苦果。
盡管在廣播上，日本人對此次抗聯對東京的轟炸，給予了最強烈的譴責。指責中國人是劊子手，惡意屠殺和平居民。隻是日本人掀起的這番賊喊捉賊的輿論，卻是遭到了全世界的一致恥笑。
開什麼玩笑，中國那些城市遭受你們轟炸的還在少數嗎？傷亡在日軍飛機上投下的各種炸彈下的中國人，還在少數嗎？從九一八事變後的錦州，日本人首開對城市進行無差別轟炸的記錄。
到八一三淞滬會戰開始後，日軍對中國各大城市實施的無差別轟炸，到對重慶和大後方有恃無恐的大轟炸。現在自己挨炸了，反倒是指責別人轟炸和平居民，這是什麼理論？恐怕全世界的人，隻有日本人才能做的出來。
上海、南京、武漢、重慶、成都、西安、蘭州、延安，甚至西寧、安康，大後方的那些城市哪一個沒有落下日本人的炸彈？自己被炸一次就急赤白臉的指責別人，典型的隻許州官放火，不許百姓點燈的做法。不要臉之極，形容日本人可謂是恰如其分。
麵對著燒成一片廢墟的東京帝國大學，前來視察的日本首相東條英機久久的沉默。在返回首相官邸之後，第一個命令就是下令關東軍、支那派遣軍、朝鮮軍，集中所有的飛機對抗聯實施報複。隻是日本陸海軍航空兵大部分已經南下，能抽調出的作戰部隊相當有限。
整個中國派遣軍的作戰飛機，眼下加在一起也不足一百架。對重慶大後方的轟炸，也開始逐漸降低的力度。尤其是轟炸機群，眼下絕大部分都被抽調往東南亞作戰，現在到哪兒去湊大本營要求的飛機？關東軍今年會戰，航空兵團遭受重創。中國派遣軍的轟炸機，隻剩下一些輕型飛機。
為了給大本營一個交待，在這位首相再三嚴令之下，關東軍與支那派遣軍抽調出所有的轟炸機群。包括海軍抽調出來的兩個轟炸機戰隊在內，集中了七十多架轟炸機。主要是輕型轟炸機，對抗聯的根據地進行了幾次轟炸，以便向大本營交差。
隻是日軍的報複行動，在早有準備的抗聯航空兵的攔截之下損失慘重。在丟掉了一半的飛機後，日軍不得不放棄了這種得不償失的報複行動，等待著東南亞戰場戰事結束之後在做安排。
在急於報複的同時，日軍大本營對此次東京挨炸事件，在其天皇的親自追問之下，也進行了嚴厲的追責。負責日本本土防空的各級軍官，受到了最嚴厲的處罰。東京防空負責人與東海岸警戒艦艇的所有艦長，包括倒黴的東京周邊地麵高射炮中隊長以上的軍官，全部被勒令切腹謝罪。至於負責本土防禦的那幾名將軍，全部在第一時間被勒令退出現役。
當然這些與楊震都已經無關，日軍大本營就算將本土負責防禦的軍官全部殺光，楊震也隻能躲在一邊偷著樂，而不會有任何的反對意見。不過他除了指示航空兵做好被日軍報複的準備之後，並沒有太多的精力去管日本人怎麼想。