但由於原來是處於戰爭時期，而且官員的人材缺乏，因此商毅並沒有進一步建全地方行政機構、主要是在行政職能上，還是由知府、知州、知縣一個人通盤全管，隻是各級地方機構的人員多了一些。
那麼現在就是該建全地方行政機構的時侯了，因此商毅決定，在鄉、鎮級行政單位設財政部；縣級行政單位再加設文教部、農業部、商務部、組織部、宣傳部，文書處共計七個部門；而省級，省會市、市級行政單位，再加設工程部、工業部、土地資源部、交通部，審計署共計十二個部門。另外根據各地的實際情況，省級，省會市、市級行政單位，還可以増加海洋開發部、民族事務部等其他部門。
在管理上，釆用雙重管理方式，即各級地方的行政部門，即要對地方政府付責，同時也要受各自的上一級主管部門管理。各部門的付責官員由各級地方官員提名、再交各部門的上級部門審核批準。
而各地方的最高行政官員，在目前的階段，省級和省會市、市級行政單位，是由皇帝或內閣推薦名單，然後交國會投票批準通過，就可以上任了。而任期時間為四年；縣級行政單位，由其直屬上級部門推薦，交由內閣批準，任期為三年；而鄉、鎮級行政單位則是由直屬上級部門在當地選拔，交省級部門批準，任期為三年。
這樣一來，再加上地方的司法係統，整個地方政府的行政機構，產生方式也就可以建全了。而且在地方上可以各付其責，也可以更好的治理好地方。另外也増加了大量基層官員的位置，不僅可以消化掉大量的官員，也可以給新晉官員提供在基層煆煉的機會，為帝國培養出更多的有用之材。下麵要做的，就是在地方上按照這樣的標準，各自完善。等到條件成熟之後，再建立地方議會。
不過現在中華帝國畢竟剛剛建立不久，完成國家統一還不到一年，各地方的發展進程也不一樣，另外現在帝國也確實還缺少相應的人材，因此各級地方行政機構的完善，也需要相當長的一段時間。而商毅決定采用逐步推行的辦法，首先在自己最早統治的八個省裏開始進行行政機構的完善工作，也為其他各省做一個樣板範例。而其他各省現在則是走這八個省的老路，先建立好四級的地方行政機構，將吏員納入政府機構中來，然後再逐步建全各部門。
但這一來就需要大量的基層官員，因此商毅也下令，帝國的科舉製度正式啟動，今年在帝國的各省，都展開鄉試，明年進行省試，後年進行會試和殿試。
開展科舉，是中國古代的一件大事，雖然現在帝國的教育體糸並沒有完全建立起來，但鄉試基本還是考的傳統內容，隻是多了一門算術，這並難不倒絕大多數考生，從省試開始，才加入所謂格物致用之學，而從現在起，還有近兩年的時間，從現在開始學起，也都還來得及。而且隻要是科舉開了，也就意味著有機會了，第一次考不上，還可以再考第二次、第三次，因此帝國的學子，讀書人也都無不歡喜鼓舞，紛紛準備開始苦讀，以其望一舉中的，一夜成名。
而就在帝國開始科舉的同時，另一項新的選拔官員的考試，各部門的經濟特科也同時開考。
經濟特科是為選擇地方基層專業官員而設的考試，將不設鄉試，直接進行省試，考試核格之後，可以參加第二年的會試，同時也可以到省裏報名掛號，等候分配到縣、鄉、鎮地方部門工作。雖然這是在最基層的地方，但也可以算是政府官員，隻要是勤奮工作，努力學習，依然是有機會晉升到市級、省級，甚致是中央的相關部門中去。如果在第二年通過了經濟特科的會試, 那麼就可以分配到市級、省級的地方部門去工作，起點也就提高了一步。
不過相對科舉來說，經濟特科的考試就要專業得多了，有不少還需要動手，不是突擊幾天就能夠應付得的，但是對科舉一個有效的補充，也使普通平民當官的機會，大大増加了。
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