劉進忠投降,也將大西軍在鳳凰山一帶的駐軍分布、虛實全部都告訴給吳三桂和尼堪。
得知這時大西軍人馬雖多，但的幾員主將孫可望、劉文秀、艾能奇、馮雙禮等人這時都不在張獻忠的身邊，吳三桂認為應該抓住戰機，立刻出擊，但尼甚對此卻半信疑，又擔心大西軍人馬眾多，因此也舉棋不定。
吳三桂見狀，決定獨自出擊，在順治三年（1646年）十一月二十六日，下令以劉進忠為向導，部將高大節率領精銳騎軍，輕裝疾進，出其不意，對大西軍發起突然襲擊。
二十七日清晨，清軍隔太陽溪與張獻忠的大西軍相遇。麵對這意外的突然來襲，張獻忠率軍創促應戰，指揮大西軍馬步兵迎戰清軍。
中午十二時左右，吳三桂率大軍趕到戰場，遣部將胡國柱向大西軍右翼進攻，郭壯圖攻擊大西軍左翼。自己親率人馬，中路進攻，戰鬥打得非常激烈，一直打到黃昏時分，大西軍終於抵擋不住，全線潰敗。
就在這時，張獻忠帶著十幾名衛士在太陽溪邊督戰，劉進忠為吳三桂指點道：“這就是八大王。”吳三桂立刻下令，向張獻忠齊發亂箭，在混亂之中，張獻忠中箭身亡，清軍大獲全勝。而這時馬寶、夏國相也攻克了成都。
在張獻忠死後，部將孫可望、劉文秀、艾能奇、馮雙禮等不敢再向陝西進軍，眾人合兵之後，決定以孫可望為首，率軍向南，在重慶府境內，受到明降將曾英部的阻擊，經過了一番激戰，孫可望等人軍擊敗了淸軍，並臨陣斬殺了曾英。這時孫可望本打算繼續率軍進攻，奪取重慶做為川中的立足之地，但這時吳三桂己命大將高大節、王屏藩率軍來增援重慶，因此孫可望等人也不敢在重慶停留，率軍南下，向貴州方向轉移，後來退進了雲南。
而吳三桂本來就打算在四川占地割據，在占領了成都和重慶這兩個四川最重要的城市之後，也忙於穩固占領地區，設將守衛，招降大西軍的餘部，因此也沒有去追趕孫可望等人。
這時張獻忠的勢力基本全部都退出了四川省，而吳三桂搶占了成都、重慶、潼川、夔州等川中地區，而尼堪率領的清軍占領了川北地區，而在川南地區，還有不少明朝的殘餘勢力。而四川的戰事也暫時告一段落。吳三桂和尼堪各守各自的占領區，暫時也都相安無事，並向北京的清廷報告了四川的戰事經過。
玄皇教過去在四川也進行過布置，雖然沒有南方這麼深厚，但也有一定的基礎，打聽一些基本的消息和動向，還是做得到的，現在經過了明石姬的改造之後，也都成為商毅現在的情報網絡，不也四川和浙江兩地，一個長江頭，一個長江尾，相隔萬裏，其間又有千山萬水，因此從四川把消息傳回來，至少也要一個月以上的時間。去年十一月就發生的事情，一直到今年開年之後，商毅才收到。不過這也是沒有辦法的事情，離著這麼遠，就是用信鴿也不好使。
從時間上看,大西軍在四川敗亡的時間和另一時空差不多,不過清軍占領四川的時間提前了，而且吳三桂居然真的挪到四川去了。可以說現在的局勢也變得越來越複雜，當然也越有趣了。
不過四川土地肥沃、資源豐富，素有“天府之國”之稱，在中國版圖中的地位雖然十分重要，但由於地理位置過於偏避，交通也不便利，始終起不到決定性的作用，也有“天下未亂而川先亂，天下未定而川先定”之話。因此吳三桂雖然占領了四川，但恐怕也難成大器。當然也不能對他掉以輕心，因為如果四川和清廷攜起手來，對自己來說還是相當不利的。
商毅想了一想，對明石姬道：“我們在四川的情報人員有多少？都是以什麼身份隱藏？”
明石姬道：“一共有三十八個人，現在都是當地居民，身份基本都是地方的幫會。”
商毅點了點頭，道：“人數到是不少，但身份太單一了，安排一批人轉換其他身份，現在清軍剛進四川，百廢待新，而且吳三桂一定會在川中擴軍，找幾個合適的人，爭取打入到軍中去，還安排幾個人經商，這樣也容易和我們聯絡互通，另外再安排一批新人過去。不過讓他們暫時不要輕舉妄動，先把根基紮牢再說。”
明石姬也點了點頭，道：“還是相公想得周全，妾身實在是自愧不如。”
商毅微微一笑，道：“少給我帶高帽子了，情報工作不是能一蹴而就的事情，凡事要一步一步的來，而且沒有你們以前在四川的基礎，現在恐怕還是舉步維艱。因此這一切也都是你的功勞。”