而最後就是在淮西地區留下一支遊動部隊，在清軍的後方活動，在外線作戰，打擊清軍的補濟線。這項任務，商毅交給了李定國的六團。同時又讓段鵬帶兩個偵察營，加入李定國的隊伍，組成外線作戰兵團。也由李定國為主，段鵬為副，來指揮這支軍隊。
這個決定到是有些出人意料，因為李定國是中途加入商家軍的，並不是山東的老部隊，屬於非嫡係出身。不過目前商毅手下的兩支主力部隊都有各自的任務，抽不開身，淮西一帶河流密布，水網交錯，也不利於騎兵大範圍的高速移動，也隻有六團這一支人馬可派。而且在加入商家軍之後，李定國一直都表現的不錯，這次擊敗孔有德的香澗湖之戰，就是他頂住了孔有徳的進攻，為其他部隊的合圍創造了機會，圓滿的完成了任務，也充份顯示出潛在名將素質。
另外現在的通訊手段並不發達，一但進入戰場之後，部隊的行動就由主將自己決定了，李定國是農民軍出身，過去和明軍交戰都是邊打邊跑，也有一定的打運動戰的實際經驗。對商毅提出的運動戰術理解的很快，可以說他確實是執行這頂任務的最合適人選。
安排好這一切之後，商毅這才率先返回揚州。當然也受到了史可法和揚州軍民的熱烈歡迎，
雖然南京朝廷沒有把劉良佐和黃得功重新調回江北，但史可法也並沒有感覺到太過擔心，因為現在他對商毅己經完全相信了。雖然得知了商毅準備放棄淮西地區，並且對商毅提出的運動戰術也是一知半解，但還是相信商毅這樣做，一定是有道理的，因此也顯得非常從容。
就在商毅回到揚州的第二天，史可法也招集揚州的所有官員，宣布將由商毅來主管整個江淮的軍務，抵抗清軍的南侵。
這時商家軍新編的第五師剩下的兩個團也己經到位，而且經過了兵工廠兩個月的奮力搶工，武器也都裝配齊全，也基本形成了戰鬥力，對於保衛揚州的戰鬥來說，這也是十分重要的。
另外李本深也把自己的部隊拉到了揚州，接受了商家軍的整編，經過了對士兵的考核之後，一萬二千多人中興有二千五百多人合格，商毅從杭州抽調一部份新兵，合並成了商家軍第二十團，任命李本深為團長，讓他們駐守淮安府，通過洪澤湖水路，支援泗州和盱眙的守軍。並且又將不合格的士兵，連同家眷都送回杭州，接任全新的訓練，而在剩餘的士兵中，又有一千多人打算棄軍務農，商毅也都滿足了他們的要求，讓杭州的行政官員安置他們。而這時商家軍在江北戰場的總兵力也己經達到了四萬五千左右。
而在明軍方麵，劉肇基丟失了壽州之後，帶著殘兵也退回到揚州，史可法也任命他統管揚州的人馬，這時在場州的明軍，總計約有八千餘人。同時史可法又命駐守泰州的江北四鎮之一劉澤清，移駐高郵，和揚州形成犄角之勢。
劉澤清是四鎮之中兵力最薄弱的一個，手下隻有三萬餘人，因此駐地也最偏，在江北的最東邊，基本臨近海邊了。而且在駐守江北的這一年多的時間裏，劉澤清到是很少鬧事，但做的隻有一件事情，就是拚命斂財。現在清軍的東路軍基本被打殘了，黃河水道也被商家軍的水軍封鎖，劉澤清守在泰州己經沒有任何意義，史可法也想把這支人馬利用起來。
其實早在商毅駐守淮河的時候，黃得功和劉良佐回援南京，史可法就想調劉澤淸去駐守廬州，抵抗清軍，但當時劉澤清不敢和清軍交戰，死活賴在泰州不動。後來商毅在淮河大敗清軍，黃得功和劉良佐也江南大敗左軍，人人都立了戰功，隻有劉澤清什麼也沒撈著。
因此劉澤清也大為後悔，商家軍戰鬥力強，打戰很猛，自己可是早就知道的，怎麼就沒跟著去呢？跟著商家軍身邊，人家吃肉，自己也可以弄幾口湯喝，總好過現在一事無成呀。於是史可法再下令調劉澤清駐守高郵的時候，劉澤清也二話沒說，把人馬全都拉來了。
這一樣，明軍的總兵力也差不多有接近十萬，到是可以和清軍有得一拚。也可以說，在商家軍的帶動下，各路明軍也沒有像另一時空裏那樣，紛紛歸降清廷，現在的局勢，遠比曆史上的要好。
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