羅馬教廷首先通過外交渠道，向華東政*府提出了抗議，並表示不承認華東政*府任命的教士，又向歐洲其他國家尋求幫助，希望他們向華東政*府施壓，讓華東政*府收回成命。但所做的一切都成效甚微，對羅馬教廷的抗議，華東政*府根本就不理會，還反懟羅馬教廷不要幹涉華東政*府的內政，而羅馬教廷所求助的國家也都態度曖昧不詳，最多也就是不疼不癢的指責華東政*府幾句，就沒有別的動作了。畢竟其他國家都知道，華東政*府是不會懼怕這些壓力的。
而羅馬教廷在無奈之下，隻得宣布華東政*府統治範圍的教區為非法教區，與羅馬教廷無關，而且也不承認華東政*府統治範圍的教徒是真正的教徒。原以為這樣一來，華東政*府統治範圍的教眾會向華東政*府施壓，那知這一切都沒有用，華東政*府的教會根本不在乎羅馬教廷的承認，完全可以自己搞一套，反正什麼洗禮、彌撒、禱告，聖餐、唱詩這些教會的活動都可以照常進行，也能弄得是模像樣，而教徒們對此也沒有什麼不滿的。其實這就是中國人對宗教的觀念和歐洲人不同，中國人實際上並不在意宗教的正統性，而隻在意自己的感受。就好像佛教徒不會去向往西天，隻要自己能念經頌佛就夠了。
而在得知了華東政*府的情況之後，羅馬教廷雖然被氣得七竅生煙，但卻一點辦法都沒有，因為現在華東政*府的教徒們都滿足於這樣的自娛自樂，教廷又能有什麼辦法，至於武力征服，教廷早就沒有那個力量了。
於是這次在北京，華東政*府也是依法炮製，首先對部份平時作惡較多，北京的民忿較大的外國傳教士當然是進行懲處。其實從總體來說，外國傳教士的道德水平還算不錯，畢竟都是宗教人員，道德水準也要比一般的外國人高出一點，在平時也做過一些施粥舍藥，收養孤兒之類的善事，雖然外國傳教士收養孤兒的主要目地還是為了從小培養教會的信徒，但畢竟是挽救了生命。當然，由於清廷的無能，外國傳教士也會利用自己的身份，為自己爭取一些利益，或是為方便傳教，使用一些特權，但總體來說，其實還不算太過份。
當然害群之馬在那裏都有，何況外國傳教士在中國享有其他地方所難以啟及的特權，因此也難免會有人用來為非作歹，危害鄉裏。不過這些情況北京辦事辦己經做了相當多的工作，在平時己收集了部份品行不端的外國傳教士的大量證據資料，這時自然是新帳老帳一起算了。最終華東政*府共計抓捕了12名民忿較大的外國傳教士，並又驅逐了21名外國傳教士。
隨後宣布所有在北京的外國傳教士、教堂都必須向北京政*府的相關機構辦理相關的手續，申請資質證書和教士資格證，教堂才能組織舉行宗教活動，教士才能從事傳教活動。同時華東政*府又從山東等地調來一批本土培養的教士，任命他們去主管北京的各個教堂，雖然在每個教堂裏隻有2、3個人，但他們的背後有華東政*府的支持，當然沒有人敢反對，而且教堂的事務也沒有那麼複雜，很快就能控製。
何況外國傳教士的人數其實也不多，一般的教堂也就是2、3人，有的甚至隻有一個人，而大部份教徒還是中國人，他們對新來的教堂管理者到並不排斥，畢竟都是同胞。雖然不少外國傳教士拚命向中國教徒灌輸新來的教堂管理者不是真正的主的信徒，因為他們沒有得到羅馬教廷的授權，但對於絕大部份中國教徒來說，官府的授權要比羅馬教廷的授權有用得多，畢竟羅馬教廷在那裏並不知道，但官府就在在自己的身邊。
於是僅僅隻過了幾天的時間，華東政*府就將北京的教會進行了一次重新大洗牌，並且基本將北京的教會控製在自己手裏。並且沒有引起多少波瀾。??
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