不過太平洋艦隊雖然不敢出戰，但仍然經常在港外布雷，加強港口的防禦，5月12日48號*艇在大連灣東北的大窯口執行掃雷任務時，觸雷沉沒；5月14日，通訊艦“宮古”號又在大窯口附近掃雷時觸雷沉沒。
而這時太平洋艦隊布雷艦阿穆爾號的艦長伊萬諾夫中校經過觀察，發現了日本艦隊的行進路線規律，日本軍艦基本上是進至港口南方10海裏的地方展開炮擊的，因此向代理司令維特格夫特建議，在這一帶地區布設*，得到了維特格夫特的同意。正好當起了大霧，於是阿穆爾號出港，在伊萬諾夫認定的地點布下了50顆*。
5月15日淩晨1點，第3戰隊在大霧中監視旅順港時，發生了軍艦撞擊，日本剛從意大利購買的裝甲巡洋艦春日號與甲午戰爭中的功勳戰艦吉野號相撞，春日號的的衝角撞破了吉野號的左舷，造成大量進水。然而由於在濃霧中的視野近乎零，因此其他各艦無法展開救援。到2點10分，吉野號沉沒，艦上共有318人死亡，90人獲救。
而這次事故並沒有影響聯合艦隊的行動計劃，亮以後，大霧漸散，第1戰隊依然按計劃前往老鐵山東南海域威攝港內的俄艦。而這裏正好就是昨俄艦剛剛布雷的海域。
9點50分，戰列艦初瀨號的艦尾觸雷，一聲巨大的爆炸聲響起，艦體發生了劇烈的晃動，旗艦附近的水麵上一片紅褐色。
隨行的戰列艦笠置號，昂號立刻采取救援行動。但10點15分時，正準備救援初瀨號的昂號右舷後部也觸雷，一分鍾不到的時間，右舷前部再次觸雷。
這時聯合艦隊也有些不知所措，不知道到底是觸雷，還是有潛艇襲擊，東鄉平八郎一麵下令其他各艦不許輕舉妄動，注意防備潛艇，一麵命笠置號放出繩索，準備拖曳初瀨號，但就在11點35分時，初瀨號後部炮塔下方再次觸雷，並引發了炮藥庫爆炸，不到兩分鍾的時間，初瀨號便沉入水鄭而另一艘昂號這時也大量進水，無法曳航，於下午5點沉沒。
不過這時旅順黃金山炮台的俄軍雖然已觀察到了初瀨號、昂號的觸雷，但代理司令維特格夫特隻命令各艦派官兵到岸上觀摩戰果，卻沒有出動艦隊出擊，趁勢痛擊聯合艦隊，結果白白錯過了這個翻盤的大好機會。
初瀨號和昂號均是聯合艦隊的主力軍艦，竟然在一內同時觸雷沉沒，對於聯合艦隊來不啻為沉重打擊。而收到了東鄉八平郎的報告之後，軍令部也是大吃一驚，軍令部部長伊東佑亨害怕如此重大的損失因此影響到官兵及國內民眾的情緒，於是命令封鎖消息，對外隻公布這兩艘軍艦受傷正在修理鄭而為了補充第1戰隊的戰鬥力，東鄉平八郎隻待將剛剛購入的兩艘裝甲巡洋艦日進號和春日號編入第一戰隊，勉強湊夠六艘之數。而春日號也是在同一，剛剛撞沉了吉野號。
不過日進號和春日號屬於意大利加利波蒂級裝甲巡洋艦，排水量僅7700噸，主炮為4門203毫米，戰鬥力連第2戰隊的幾艘萬噸級裝甲巡洋艦都比不上，而初瀨號、昂號都是排水量達1.5萬噸左右，主炮為4門305毫米口徑巨炮，因躥1戰隊的戰鬥力自然的大大降低了。
而且聯合艦隊的惡運卻並沒有結速，兩之後，炮艦大島號又和赤城號發生的碰撞事故，驅逐艦曉號又觸雷沉沒，僅僅隻有5時澗，聯合艦隊竟然連續損失了7艘軍艦，包括2艘核心主力的戰列艦和1艘功勳的巡洋艦，好在是這時陸軍的登陸基本結束了，因此東鄉平八郎下令艦隊暫停所有行動，回港修整。
但太平洋艦隊仍然沒有抓住這個時機有所行動，從而也錯過了最後一次扭轉局麵的機會。
好在是日本陸軍並未受海軍的影響，當然海軍封鎖消息的對像也包括陸軍，因此陸軍根本就不知道海軍遭到了開戰以來所未有的重創，還以為海軍的局麵仍然大好。於是陸軍在5月25日，發動金州戰役，並於5月28日攻占金州，大連，守衛金州、大連的俄軍、僑民徒旅順，至此日軍完成了對旅順的包圍，並且完全切斷了旅順對外的一切聯係。