軍隊裏，一部分還在軍營裏日夜操練，另外一部分則派出去剿匪，如此才能以戰養兵。不過，段業可不相信軍隊靠著各種演說的煽動，靠著充足的糧餉，就能脫胎換骨。
軍隊的關鍵，在於組織化，正規化，說白了，就是靠組織維係，靠洗腦來激發，如今段業自己是敦煌太守了，有些事情也可以公開做了，反正全天下郡內的郡兵，都無一例外都幾乎等於太守的私兵，很多事情，不做反而矯情了。
段業做的最重要的一件事，便是親自給每個士兵發餉，而且絕不假手任何人，每一筆都是這樣。
方式也是和過去一樣，所有領餉的兵都站成一排，段業親自捧著製錢挨個給，同時順便和士卒們寒暄幾句，當然了，早就安排好的人會在這個時候高喊，“我們吃誰的飯！”
所有人自然齊聲高呼，“吃段府君的飯！”
“我們穿誰的衣？”
“穿段府君的衣！”
“我們給誰賣命！”
“給段府君賣命！”
一次次的重複著這樣機械的動作，一遍遍不厭其煩的做這些瑣碎的事情，段業終於從士卒們的眼中看見了尊重，看見了服從，更看見了習慣。
對的，就是習慣，一旦一切形成了習慣，什麼事情都好做了。這支軍隊，是段業安身立命的本錢，隻能牢牢把握在段業的手裏，這一點是不可以讓步的。
除了軍隊，還有行政體係，敦煌城的過往官吏以及機構，當初為了穩定，段業一概沒動，但是很顯然的是這些官僚機構，並不讓段業滿意，而且段業就算對他們施恩，而他們也對段業服從，但是人之常情，先用自己人總歸更是放心，因此段業的辦法，是舊的不動，添加新的，先增設了許多機構，把自己放心的人安插進去，讓他們逐漸取代舊的機構的權力，等到時機成熟的時候，在給予舊機構的人妥善安置的同時，再用新的來取代舊的。
段業曾經仔細考慮過曆史上曾經有過的各種官製，後來還是發現，六部製還是最適合當下的時局的，有六部，就能大概把各種事情清晰的攤派到部門裏去，免得推諉扯皮，但是三省當然不能要，段業現在當然需要分權製衡，但是那是他手下那群人，彼此之間需要製衡，免得他們貪贓枉法或者仆大欺主，威脅到段業的權力，對於段業自己，更重要的還是要確保絕對的權力。
敦煌郡很小，自然不至於用到部級，因此眼下還初步用的是吏，禮，刑，兵，戶，工五局，目前來說，這些個局現在隻是其他衙門的谘詢機構，但是按照段業的安排，等到這些局的人們都紛紛掌握了實際操作政務的能力，並且建立了相應的權威後，就到了除舊布新的時候了。
另外，段業眼下最麻煩的事情，其實還是人才，任何時代，最寶貴的，永遠都是人才。