納迪爾.默罕默德哪裏想得到，固始汗為了迫使他們無法在浩罕停留下來營建防線，居然連戰場也不打掃，就這麼帶著自己的嫡係部隊追殺了上來。
納迪爾.默罕默德駐紮下來的地方距離戰場實在，天色還十分明亮的時候，和碩特部的斥候已經找到了他們。
固始汗連隊形都沒有調整，隻是簡單的將近3500人的部隊分成了三隊，然後命令三名部下各領一隊輪番上前衝擊納迪爾的營地。
此時納迪爾.默罕默德倒是收攏了上千名潰軍，但是這些潰軍還沒能從剛剛的戰鬥中清醒過來，正是處於腦子最為混亂的時候。
因此當他們一看到打著固始汗旗號衝鋒的蒙古軍隊後，便立刻再次衝出了營門，向著西麵逃亡而去了。
正分散了隊伍對逃兵進行重新整理編製的近衛騎士們，在這樣突然的打擊下，頓時陷入了各自為戰，這無疑給了蒙古騎兵一個極大的激勵。
接近黃昏時的這一仗，終於讓納迪爾.默罕默德傷筋動骨了。他最為忠誠的千餘近衛騎士，一下子丟掉了近一半，還順帶著丟掉了部隊攜帶的最後那點輜重糧食
納迪爾.默罕默德帶著剩下的四、五百近衛騎士突圍時，心裏是極不好受的。不過固始汗這邊並沒有放棄對於納迪爾這隻軍隊的追擊，在留下了五百人看守俘虜，並催促後方軍隊快些跟上後，第二天一早固始汗便帶著3千人繼續追了下去。
布哈拉汗國雖然是一個半遊牧國家，近衛騎士在野外的生存能力比普通的農耕民族騎兵要強的多。但是，和蒙古人相比，他們還是不夠看的。
而且布哈拉近衛騎兵所用的馬匹都是中亞的好馬，雖然這些馬匹在短途衝刺和負重能力上要比蒙古馬優秀的多，但是這種馬對於飼料的要求還是比較高的。
丟掉了僅剩的輜重之後，納迪爾和部下連自己都得餓肚子，更不必提給這些馬匹喂食精糧了。好在費爾幹納盆地雖然幹燥，但是有水的地方就有優良的草地，可以讓這些馬匹自己覓食。
但是這樣的飼養方式，差不多已經讓這些馬匹失去了作戰的體力。而聯軍沿著納林河大道實施的焦土戰略，使得納迪爾很快放棄了沿著大道前進的打算，否則在他們逃出生天之前，不是餓死就是被身後的蒙古騎兵給一口口的吃掉了。
納迪爾的選擇，讓他失去了同兒子阿布.阿吉斯彙合的機會，但也同樣逃過了被聯軍前後合圍的危機。隻不過當他逃亡到浩罕城附近時，固始汗的軍隊已經先他一步包圍了這座城市。
納迪爾放棄了衝入浩罕城重整旗鼓的打算，在劫掠了浩罕城附近的一個村子之後，補充了糧食的殘軍便直接翻越山嶺前往塔什幹去了。
崇禎十二年八月初四，樊一蘅、孟喬芳帶著大隊人馬抵達了安集延。五日之後，浩罕城向固始汗打開了城門，至此費爾幹納盆地已經全然落入了聯軍手中。
樊一蘅並沒有著急向費爾幹納盆地西北方向的塔什幹進軍，而是在調查了費爾幹納盆地的風土人情和同聯軍各方將領進行交談之後，於九月八日在安集延召開了一次費爾幹納戰後處置會議。
這場會議實質上就是，作為外來者的聯軍同費爾幹納各族居民代表進行統治約定及分贓的會議。葉爾羌汗國獲得了烏茲根地區；吉爾吉斯人同伊卜喇伊木王子、伊斯瑪依勒王子平分了，從費爾幹納山到安集延北部之間的土地。
馬守應獲得了奧什村及附近的領土，他隨後就將奧什村改成了駐馬店。
安集延城在抵抗布哈拉軍的過程中出了大力，所以安集延伯克賽非依舊掌握了這座城市，不過明軍在安集延設立了費爾幹納督軍府，在城內駐紮了下來，以此來統禦整個盆地地區。
海達爾被冊封為那木幹城的城主，而浩罕地區則交給了固始汗，至於阿爾斯蘭的部族則獲得了瑪爾噶朗城。靠近納林河的交通要道都控製在了聯軍手中，至於盆地的邊緣部分，則進行了大規模的交換土地，使得這些村落和少數民族失去了固有的勢力範圍，不得不向聯軍輸誠。
雖說有些村子並不願意遷移，但是在聯軍的武力威懾和阿布.阿吉斯這位汗王繼承人的勸說下，大多數人還是服從了這個看起來瞎折騰的命令。
通過一係列的政策操作，樊一蘅總算是初步建立起了，大明對這一地區的統治權力。而本地統治秩序的建立，也使得聯軍消耗的大量物資不必再由南疆運入，這又為聯軍下一步作戰打好了基礎。
就在樊一蘅整頓盆地內部的統治秩序時，盆地內部聯軍再次大勝的消息，正向著四麵八方傳播開去，給布哈拉汗國內部及周邊的勢力帶去了極大的震撼。