而他來京城雖然還不到一日，但是朝堂上的文官們想要壓製武臣抬頭的風聲，已經傳入到了他的耳中。
此前朝臣們對於皇帝興建軍校、新軍持有容忍態度，一是因為新帝登基時，朝中黨爭的激烈，他們在某些方麵隻能服從於皇帝的意思，避免皇帝徹底倒向政敵。
二是後金國勢越來越強盛，在遼東幾乎無可抵禦，除了一道殘破的寧錦防線和山海關外，京城北麵已經再無可靠的屏障。
這種狀況之下，為了維護京城內自家的安危，興辦一隻強軍可以說也是京城上下官吏的共識。隻不過，大家爭的是這隻新軍掌握在誰手中而已。
崇禎摒棄了由內監勳貴單獨掌軍的傳統，設立軍校和總參謀部，讓孫承宗等文臣統領操練新軍，消除了一部分文官們的戒心，算是贏得了最大的共識，新軍也才能順利編練出來。
但是隨著皇帝親征薊州，初步煉成的新軍擊退了入侵關內的後金軍隊之後。朝中的文官們突然發覺，這隻新軍雖然名義上是孫承宗、袁崇煥等文官訓練編製出來的，但是這隻新軍的內部封閉性更好，文官們根本影響不了新軍內部的軍官提升，從前的兵部現在倒是成了總參謀部的後勤部門了。
在這樣的狀況下，朝中差不多已經達成權力平衡的文官們，自然想著要騰出手來壓製一波武臣勢力上升的勢頭了。
奢安之亂的結束，對西南諸軍的安置，也就成了文官們對於皇帝的初步試探。
朱燮元既然看明白了朝中局勢，自然不願意同執政的內閣閣臣們去唱反調。但是皇帝親口點了自己的名字，他也不得不站出來發表看法了。
作為平息了奢安之亂的首功之臣，他對於西南局勢的了解自然是超過了朝中的各位官員的。
要他閉上眼睛去附和內閣諸閣臣的意見，他是覺得不大妥當的。思前想後了許久，朱燮元終於對著皇帝行禮說道：“陛下，臣兩度受命，在川、貴兩地奔波對付叛逆，對於當地的風土人情倒也是略有所得…”
朱燮元沒有直接表態支持那一方的意見，而是把自己在四川、貴州任職期間的經曆，和對當地風土人情的了解講述了一遍。
說完了這些之後，他才轉回正題說道：“…以臣所見，自奢安之亂之後，貴州、四川的菁華之地大半被毀，我漢人百姓在這兩地的人口也大量銳減，數十年教化之功也毀於一旦。
而在這場戰亂之中，不僅我漢民損失慘重，當地土民的損失也同樣不小。雙方在戰爭中的互相仇殺之下，戰亂之前當地各族百姓的睦鄰友好關係，現在已經蕩然無存。
當下在貴州，漢人村寨不許其他土民3人以上結隊從村子邊上經過，而苗、瑤等族百姓則同樣拒絕漢人進入自己的寨子休息，各族百姓之間的關係可謂是劍拔弩張。
如果朝廷以為奢、安兩家土司服軟，西南地方就能回到戰爭之前的社會，無疑是想的太過於簡單了。”
郭允厚忍不住向他發問道：“那麼按照朱大人的意思，朝廷還需要向西南撥款多少年，才能讓西南恢複到戰亂之前呢？”
朱燮元沉吟了一下，終於委婉的說道：“需要多久才能讓西南地區恢複到戰亂之前，臣實在是不知。
但是臣以為，想要消除西南地區繼續發生叛亂的隱患。一是向西南持續遷移漢民，在這次戰亂之中，隻有漢民才是真正願意支持朝廷官軍的。
其他各族雖然沒有參與叛亂，但也隻是閉門自守，很少願意協助朝廷官軍平叛。隻要漢民在當地的數量占據了一半以上，西南的局勢才會有真正的緩和可能。
二是將有功將士分別安置在各要道衝口，把從叛逆中繳獲的土地分給這些有功將士，則將士們自然會感念朝廷的恩德，替朝廷鎮守地方，隔絕地方上各族百姓的衝突。而且也能減少朝廷對於西南地區的軍費撥款…”
原本還對朱燮元的說法有所不滿的內閣閣臣們，聽了他最後的建議之後，終於臉色緩和了下來。把這些有功將士分拆安置，顯然也是符合他們心意的。
不過在朱燮元之後發言的秦良玉，卻皺著眉頭說道：“總督大人前麵說的臣都讚成，唯獨這把有功將士分鎮各地，臣以為不可…”