距離紫禁城北麵一街之隔的皇家科學院內，在臨近西海子一處花園內，豎立著兩排東西向的平房，這裏便是皇家科學院外籍院士的宿舍所在。在這兩排平房前有一排開著白花的老槐，看起來甚是清幽。
鄧玉函和金尼閣兩人剛好分住在一東一西，這些平房雖然戶戶相連，但是每戶之前都有修剪過的灌木圍成的院子。朱由檢先去看的鄧玉函，和其他人種植的花草相比，他家門前的院子裏倒是多了一些新奇的植物，看起來倒是一些藥草。
院內正在煎藥的兩個年輕人，看到皇帝到來之後，頓時起身前來迎接他了。朱由檢對著他們擺手說道：“不必慌張，你們隨意來一個陪朕進去探望下鄧先生，另外一個自去看著火候，不要將藥煎糊了。”
兩名年輕人對望了一眼之後，年紀較大，麵目較為黝黑的年輕人便對著身邊的年輕人說道：“傅師弟入門不久，還是我來看著藥爐，你陪著陛下進去看完陛下吧。”
朱由檢轉頭讓隨從留在門外，隻讓呂琦跟著自己走進了房門，臨近房門之前，他不由又停了下來，對著屈身向著自己行禮的那位年輕人問道：“你叫什麼名字？”
“學生鄭元藏。”這位年輕人老實的回道。
“恩，你好好煎藥，這些日子且好好照顧鄧先生。”朱由檢對著他這麼吩咐了一句，便轉頭走進了房間。
皇帝進來的時候，鄧玉函正半靠在軟枕上看書，他此刻的身體既不能站立，也不能躺下，隻有這麼半靠半躺著，才能讓他好受一些。當朱由檢看到他的時候，便知道鄧玉函的時日已經不久了，畢竟一個原本體格健壯的白人男子，現在已經瘦的快要皮包骨頭了。
朱由檢阻止了鄧玉函想要起身行禮的舉動，握住了鄧玉函的雙手說道：“我這些日子一時瑣事纏身，倒是來遲了，想不到鄧先生的身體已經…”
看著朱由檢露出難過的表情，鄧玉函倒是為崇禎開解道：“皇帝陛下不必過於憂慮，對於我們這些主的信徒來說，死亡不過是回到了主的懷抱而已，這並不是什麼壞事。
我很清楚自己的病情到了什麼地步，對於死亡我並不畏懼，但是對於我手上的的工作，我卻有些放不下來。我原本想要學習大明的禮儀，在臨死之前想要向陛下上一封遺書，交代一下手中的工作。
不過陛下也知道，我雖然學會了中國話，但是對於用中文寫作就有些力不從心了。因此隻能以拉丁文寫了一封遺書，陛下今日來了，正好將它交給陛下，希望能夠對陛下有所幫助。”
朱由檢接過了鄧玉函讓身邊弟子取來的錦盒，轉手便交給了身後的呂琦，接著他便對著鄧玉函繼續說道：“鄧先生寫的東西，我回宮後一定會好好研究，不會辜負先生的一片心意。不知鄧先生對於自己的身後之事，可有什麼要求嗎？或者說你在故鄉可有什麼親人需要照顧嗎？雖然大明和歐洲有萬裏之遙，但是朕還是可以派人…”
鄧玉函阻止了崇禎繼續說下去，他在一陣咳嗽之後，才對著崇禎說道：“我自投入教會之後，我就將我的一切奉獻給了天主，這些俗務自然也有耶穌會的兄弟替我料理，陛下就不必在這方麵費心了。不過我倒是還有兩件事一直放心不下，希望陛下能夠給予成全。”
朱由檢立刻回道：“鄧先生有什麼心願就說出來，隻要我做得到的，一定會為先生去做的。”
鄧玉函看著皇帝慢慢說道：“第一件事是，我受陛下資助，潛心研究人體解剖學，數年來終於寫成一冊《解剖學補注》。我很希望陛下來日能夠將之頒行天下，不要讓它沉沒下去。”
朱由檢一口答應道：“這是理所應當之事，對於醫學的研究，大明不會停止。今日中西方的一些人將新醫學視為洪水猛獸，但是朕可以擔保，後世之人一定會記住先生為新醫學開創作出的貢獻的。”
鄧玉函聽了皇帝的話語，頓時笑了笑，露出了向往的神情說道：“如果陛下說的是真的，我倒是真想去看一看，那樣一個時代。”
停頓了片刻之後，鄧玉函便再次開口說道：“這第二件事，便是我奉皇帝陛下命令，和吳有性先生一起創建的皇家醫科大學和宣武門新式醫院。
吳先生受命前往武漢建立醫學院，以研究治療南方的各種傳染惡疾，這雖然也是一件重要之事。但是陛下，目前來看，有資格帶領皇家醫科大學和新式醫院繼續前進的，隻有吳先生。
新式醫學將中西方的草藥學、經驗醫學和最新的化學醫藥學研究融合於一體，沒有一個開明而又知識淵博的學者帶領，新式醫學就有可能走上歪路，變成神秘學和迷信相結合的巫醫。這是我所不願意看到的，為了新式醫學的健康成長，我希望皇帝陛下能夠召回吳先生，讓他接管這兩所醫學機構…”