內丹南宗之說，基本架構大抵也是如此。張伯端《悟真篇·序》說：“仆既遇真詮，安敢隱默？所得成律詩九九八十一首，號曰悟真篇。及乎篇集既成之後，又覺其中惟談養命固形之術，而於本源真覺之性有所未究，遂玩佛書及傳燈錄，至於祖師有擊竹而悟者，乃形於歌頌詩曲雜言三十二首，今附之卷末，庶幾達本明性之道，盡於此矣。”就其整體理論來說，其實亦如王重陽一般，可分為性理與命功兩部分。命功為養命固形之術，性理則王重陽兼采了佛教的慈悲、持戒、忍辱，儒家的孝敬、忠君、尊師；張伯端吸收了禪宗的“明心見性”。其後道教內丹學各派紛紛講三教合一或仙佛合宗，蔚為風氣，殆皆如王重陽、張伯端，是由它這種特殊的理論結構所導生出來的。但性命雙修，不隻是分列性理與命功而已，其命功亦須講性命雙修。張伯端之前，如崔希範《入藥鏡》說：“水真水，火真火，水火交，永不老。水能流，火能焰，在身中，自可驗。是性斂，非神氣。”謂大藥就在身中，不假外求。其藥以鉛汞為主。鉛汞指水火，而此水此火又並非一般所說的水與火，乃是身體內部的心火與腎水（注意：心火即真水，因離中有陰，心中有液，此液即為真水；腎水才是真火，因坎中有陽，腎中有氣，此氣乃真火）。兩者水火相交、陰陽既濟，就稱為性命相合（元蕭廷芝注雲曆代丹家對性命的解釋都不外將命歸為氣、形、身，將性歸為神、心。如《西山群仙會真記·養心》：“從道受生謂之性，自一稟形謂之命。
《入藥鏡》：“是性命，非神氣。”王道淵注：“性即神也，命即氣也。性命混合，乃先天之體也。神氣運化，乃後天之用也。故曰‘是性命，非神氣’也。”彭好古注：“在天者成性，在地者立命，遂有性命之分。”
李攀龍注：“性，火也。命，水也。性命，水火之本源也。性命即鉛汞，鉛汞即性命。性命即神氣，神氣即性命。”等等都是。內丹學各門派皆主雙修性命，但在修性修命的先後、次序及下手處等方麵則各持己見。一般認為北宗、文始派、青城派是先性後命；南宗張伯端等則為先命後性。張伯端《悟真篇》雲：“虛心實腹義俱深，隻為虛心要識心，不若煉鉛先實腹，且教收取滿堂金。”彭好古注：“虛心是性功上事，實腹是命功上事。不若煉鉛服食先實其腹，使金精之氣充溢於身，然後行抱一之功，以虛其心，則性命雙修，形神俱妙，大修之事畢矣。”仇兆鼇補注：“心之所以不虛者，緣汞無鉛伏，故觸境易搖，不若煉鉛以製伏之，使心有所含育也。南宗先命而後性，於此章見之。”（《悟真篇集注》）至於北宗則主張三分命功，七分性功。以清淨為主，以“識心見性”為首要。故王重陽說：“隻要心中清淨兩個字，其餘都不是修行。”（《重陽全真集》卷十）馬鈺說：“清淨者，清為清其心源，淨為淨其氣海。”（《丹陽真人語錄》）丘處機說：“吾宗惟貴見性，水火配合其次也。”（《長春祖師語錄》）但不管北宗、南宗，抑或東派、西派，其修丹的終極處都要落實在煉神還虛以合道上，因而修性為內丹修煉過程中最基本的修煉手段。所以李道純說：“仙師雲：隻煉金丹不達性，此是修行第一病。隻修真性不修丹，萬劫陰靈難入聖。誠哉言歟！”“左為性，性屬離；右為命，命屬坎”，可見性命相合即是水火相交）。其後五代時陳樸《內丹訣》與此相似，說：“心光腎液合丁壬……心腎始交通……火自海門朝帝座。”心屬火，配南方丁；腎屬水，配北方壬。經二轉三轉之後，“真水真火，上下交合，以配丁壬而抱養真丹”。至張伯端，所著《玉青金笥青華秘文金寶內煉丹訣》亦有《坎離說》，謂心腎交、鉛汞合、精神會，丹即可以成就。同時元金月岩編《抱一子三峰老人丹訣》也說：“凡修仙學道之士，先要識性命根源。根源者，此是人之心腎也。”
這些都是以坎離心腎水火講性命的。但王重陽之後，此說又有新的發展，不以心講性，改由腦說。其說倡自丘處機，他所著《大丹直指》雲：“金丹之秘，在於一性一命而已。性者天也，常潛於頂；命者地也，常潛於臍。頂中之性者，鉛也、虎也、水也、金也、日也、意也、坎也、坤也、戊也、姹女也、玉關也。臍中之命者，汞也、龍也、火也、根也、月也、魄也、離也、乾也、己也、嬰兒也、金台也。”（下卷）這段話，在據信為尹誌平弟子所著之《性命圭旨》中發揮得更廣。頂中之性（汞、龍、火、根、日、魂、離、乾、己、天、君、虛、兔、無、主、浮、朱砂、扶桑、姹女、昆侖），臍中之命（鉛、虎、水、蒂、月、魄、坎、坤、戊、地、臣、實、烏、有、賓、沉、水銀、華嶽、嬰兒、曲江），“總來隻是這兩個字，兩個字隻是一個理，故盲修者歧而二之，若真修者合而一之。合一者，煉氣而凝神，盡性而至命，烹鉛而幹汞，取炊而填離”（《性命雙修萬神圭旨》利集第五節口訣）。
5、各種養形左道
凡此諸說，均為命功。故無論如何說性命雙修，都仍隻是就人之身命說。如此，也能稱之為形神合一嗎？不是隻偏於形體嗎？不然。我們在前麵講過：王重陽所說的“心”就同時是物質心也是神識心。同理，諸家所說之坎離、心腎、鉛汞、精血等，並不純然是物質，因為彼等所雲精氣等常是說先天之元精元氣，未必為呼吸之氣與淫佚之精；精氣之運動以至相合，又須靠意或其他虛靜心神之類功夫。這類功夫，諸家巧妙不同；所講的心腎鉛汞又常是“不可以有形求，不可以無形取”（張伯端語），“非印堂，非腦門，非肚臍，非膀胱，非兩腎，非腎前臍後，非兩腎中間。上至頂門，下至腳跟，四大一身，才著一處，便不是也。亦不可離了此身，向外尋之”（《中和集·玄關一竅》），“涕唾精津氣血液，七般靈物總屬陰，乃後天渣質之濁陰”（張三豐《玄機直講·一粒黍米說》）……如此雲雲，所以才難懂，才使修道人望洋興歎，不知如何下手。否則，單憑那簡單的心腎相交雲雲之術法便能成仙嗎？
而不幸曆來修煉者大多在此誤入了歧途，隻知命，隻知身形，而不知性，不知心神，以至於他們雖自命為修道煉養之士，實乃大悖於道教之宗旨。李道純《中和集》論“旁門九品”曾痛斥之，曰：
禦女房中，三峰采戰，食乳對爐，女人為鼎，天癸為藥，產門為生身處，精血為大丹頭；鑄雌雄劍，立陰陽爐，謂女子為純陽，指月經為至寶，采而餌之，為一月一還；用九女為九鼎，為九年九返。令童男童女交合而采初精，取陰中黍米為玄珠。至於美金花、弄金槍，七十二家強兵戰勝，多入少出，九淺一深，如此邪謬，謂之泥水。丹法三百餘條，此大亂之道也。乃下品之下邪道也。
又有八十四家接法，三十六般采陰。用胞衣為紫河車，煉小便為秋石，食自己精為還元，捏尾閭為閉關。夫婦交合，使精不過為無漏；采女經為紅圓子。或以五金八石修煉為丸，令婦人服之，十月後，產肉塊為至藥，采而服之。如此謬術，不欲盡舉，約有三百餘條，乃下品之中外道也。
又有諸品丹灶爐火，燒熱五金八石，勾庚乾汞，點茅燒艮，撥灰弄火。至於靈砂外藥、三遜五假、金石草木服餌之法，四百餘條，乃下品之上外道也。
這些下三品之法門，共同的特色，在於“求諸身外”，而非“返求諸己”。其次，又都隻在形術上花腦筋，毫無精神上的修養功夫，甚至“以鄰為壑”，用采擷他人、損耗他人來補益自己，所以被視為最下品。對此，張三豐也說：
又有一等小根盲人，見先聖所言外陰陽、外爐鼎、外藥物，執迷女子為鼎器，則又可哀已也。某見酷好爐火者，百無一成。又以軒轅鑄九鼎而成道，以為必用鼎器九人，謬之甚矣。嚐見有進過五七鼎，亦無成就者。且人念頭一動，先天淳樸即散。先天既喪，後天雖存，究何益於身心？不過聊存其四大而已。
《性命圭旨》則說修道者有九十六種外道、三千六百旁門：
旁門小術，易學難成而見效速。是以貪財好色之徒，往往迷而不悟。其中有好爐火者，有好彼家者，有視頂門者，有守臍蒂者，有運雙睛者，有守印堂者，有摩臍輪者，有搖夾脊者，有兜外腎者，有轉轆轤者，有三峰采戰者，有食乳對爐者，有閉息行氣者，有屈伸導引者，有三田還返者，有雙提金井者，有曬背臥冰者，有餌芝服術者，有納氣咽津者，有內視存想者，有休糧辟穀者，有忍寒食穢者，有搬精運氣者，有觀鼻調息者，有離妻入山者，有定觀鑒形者，有熊經鳥申者，有餐霞服氣者，有長坐不臥者，有打七煉魔者，有禪定不語者，有齋戒斷味者，有夢遊仙境者，有默朝上帝者，有密咒驅邪者，有見聞轉誦者，有食己精為還元者，有捏尾閭為閉關者，有煉小便為秋石者，有采女經為紅鉛者，有輕舉而思以駕風驂者，有吞精咽華以翕日月者，有步罡履鬥以窺星辰者，有依卦爻之序而朝屯暮蒙者，有售黃白之術而燒茅弄火者，有希慕長生不死者，有馳誌月日飛升者，有著相執而不化者，有著空流而不返者，有持定慧而望解脫者，有祛貪嗔癡而思清靜者，有生而願超西域者，有死而願登天堂者，似此泯泯棼棼，難以悉舉。
這些批評，固然不乏內丹一脈之偏見，因此符籙丹鼎齋醮等等都遭了貶抑；但若與莊子批評刻意養形者那些話合看，便不難發現：養形以求壽者，不但未因莊子之指摘而稍戢其聲勢，更與道教守一、還精、存思、養氣、煉神等術相結合，而更朝養形一麵去發展，而且此類人士亦均號稱為道教，波衍甚盛。無怪乎李道純、張三豐等人要將之判為旁門左道了。