表麵上，李世民引經據典，文縐縐的。實際上，他的話裏麵透著血腥味。尉遲敬德這才意識到問題的嚴重性，趕緊磕頭謝罪，從此便處處約束自己的行為。
貞觀十三年（639）二月初七，李世民突然對時任鄜州（今陝西富縣）都督的尉遲敬德說：“有人說你意圖謀反，有這回事兒嗎？”
尉遲敬德氣得都快要爆炸了，將衣服脫掉，露出身上的傷疤，厲聲反駁道：“沒錯，我是造反了。我跟隨您征戰四方，身經百戰，能夠活到今天，已經是僥幸中的僥幸了。現在，天下已經平定，您反倒疑心我會謀反了？”
李世民哪料到尉遲敬德的反應這麼強烈，他淚落如雨，由衷地說道：“卿複服，朕不疑卿，故語卿，何更恨邪！”
有一次，李世民提出想把女兒嫁給尉遲敬德，豈料居然碰了個釘子。尉遲敬德一口回絕，並說：“我老婆雖然身份低賤，相貌醜陋，但是這些年的風風雨雨，是她陪我走過來的。我雖然沒什麼文化，但是也知道古人有富不易妻的義舉。陛下的抬愛我心領了。”富貴而不忘糟糠之妻，尉遲敬德乃真丈夫也！
晚年的尉遲敬德迷信方術，在家中設爐煉丹，服食雲母粉，以求長生不老。唐高宗顯慶三年十一月二十五日（公元658年12月25日），尉遲敬德於家中去世，享年七十四歲。唐高宗為此廢朝三日，令在京五品以上官員都去參加吊唁；同時冊贈尉遲敬德為司徒、並州都督，諡曰忠武，陪葬昭陵。
“玄武門之變”後，秦叔寶獲封左武衛大將軍，得封邑七百戶。
不過，打這以後，這位猛將就再也沒有領兵出征過。不是因為李世民不用他，而是因為秦叔寶身體不好，多年來疾病纏身。不過，秦叔寶倒是很豁達，他常常對人說：“我從少年時代起就戎馬倥傯，經曆過大小二百多次戰鬥，屢次身受重傷，計量我前後流出的鮮血，共有幾斛之多，怎能不生病呢？”
貞觀十二年（638），秦叔寶便因病去世了。李世民追贈他為徐州都督，陪葬昭陵，墓前雕刻石人、石馬，以彰顯其顯赫的戰功和超人的武功。貞觀十三年（639），唐太宗改封秦叔寶為胡國公。貞觀十七年，位列“淩煙閣二十四功臣”之一。